More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0613 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0613  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 369 aa  740    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1258  ABC-2 type transporter  59.89 
 
 		 366 aa  458  9.999999999999999e-129  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.793324  normal  0.287343 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4575  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  27.66 
 
 		 370 aa  160  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.745541  normal  0.326628 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  29.95 
 
 		 253 aa  97.8  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  30.58 
 
 		 251 aa  93.6  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2599  putative ABC transporter, permease protein  29.29 
 
 		 339 aa  94  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2544  ABC transporter, permease protein, putative  29.82 
 
 		 339 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0951215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2323  ABC transporter, permease  30.18 
 
 		 339 aa  92  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00174786  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2365  ABC transporter permease  30.18 
 
 		 339 aa  92  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2542  ABC transporter permease  30.18 
 
 		 339 aa  92  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2556  putative ABC transporter, permease protein  27.65 
 
 		 339 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0674400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3115  ABC transporter, inner membrane subunit  24.08 
 
 		 383 aa  90.9  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3309  ABC-2 type transporter  23.76 
 
 		 383 aa  90.1  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  32.02 
 
 		 254 aa  90.1  6e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3224  ABC-2 type transporter  23.5 
 
 		 383 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.13853  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  27.83 
 
 		 290 aa  87.8  3e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2816  putative ABC transporter, permease protein  29.09 
 
 		 339 aa  87  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000326896 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.72 
 
 		 253 aa  87  5e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1758  ABC-2 type transporter  24.04 
 
 		 341 aa  87  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1669  ABC-2 type transporter  24.72 
 
 		 347 aa  86.3  8e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1459  ABC-2 type transporter  26.94 
 
 		 249 aa  85.9  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  26.42 
 
 		 381 aa  84.7  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25.1 
 
 		 253 aa  84.3  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1528  hypothetical protein  26.45 
 
 		 249 aa  83.6  0.000000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1203  ABC-2 type transporter  25.51 
 
 		 251 aa  83.6  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0595438 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3069  ABC-2 type transporter  27.42 
 
 		 373 aa  82.8  0.000000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.669525  normal  0.261942 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25.21 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.12 
 
 		 253 aa  82  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2298  daunorubicin resistance ABC transporter membrane protein  30.27 
 
 		 264 aa  81.6  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.207913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1356  ABC-2 type transporter  24.94 
 
 		 370 aa  81.6  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000392503  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  29.11 
 
 		 284 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1046  ABC-2 type transporter  24.94 
 
 		 383 aa  80.9  0.00000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.21 
 
 		 249 aa  80.9  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  24.43 
 
 		 379 aa  80.5  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  23.98 
 
 		 384 aa  79.3  0.00000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3587  ABC transporter, permease protein, putative  23.04 
 
 		 375 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  25.2 
 
 		 378 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2352  ABC-2 type transporter  27.7 
 
 		 339 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.229577  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0255  ABC-2 type transporter  25.78 
 
 		 373 aa  78.2  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2507  putative ABC transporter, permease protein  28.09 
 
 		 339 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0363  ABC-2 type transporter  26.94 
 
 		 289 aa  77.8  0.0000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2561  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.25 
 
 		 249 aa  77.8  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0426  ABC-2 type transporter  25.82 
 
 		 256 aa  77  0.0000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  20.72 
 
 		 377 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.18 
 
 		 249 aa  77  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0037  ABC-2 type transporter  28.3 
 
 		 255 aa  76.6  0.0000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1561  ABC-2 type transporter  30.12 
 
 		 252 aa  76.6  0.0000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.403911  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1478  ABC-2 type transporter  30.35 
 
 		 254 aa  76.6  0.0000000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1170  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.36 
 
 		 253 aa  76.3  0.0000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  23.5 
 
 		 375 aa  75.9  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0380  ABC-2 type transporter  31.76 
 
 		 280 aa  75.9  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4310  ABC-2 type transporter  23.94 
 
 		 390 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  24.43 
 
 		 388 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1340  ABC-2 type transporter  24.24 
 
 		 378 aa  75.5  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  28.57 
 
 		 250 aa  75.1  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  27.01 
 
 		 261 aa  74.7  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000233601  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  24.66 
 
 		 254 aa  74.7  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  27.66 
 
 		 288 aa  74.7  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1295  ABC transporter permease protein  30.48 
 
 		 376 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0481069  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2708  ABC transporter related  22.49 
 
 		 691 aa  74.3  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.163982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2056  ABC-2 type transporter  28.79 
 
 		 241 aa  74.3  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.794734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0873  ABC-2 type transporter  22.69 
 
 		 380 aa  73.9  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.344098 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1380  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  24.9 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000932687  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0559  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  30.43 
 
 		 264 aa  73.6  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1766  multidrug ABC transporter, permease protein  28.57 
 
 		 242 aa  73.6  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1426  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  24.9 
 
 		 256 aa  73.2  0.000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0562869  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  23.48 
 
 		 387 aa  72.8  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  23.02 
 
 		 376 aa  72.8  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0131  ABC-2 type transporter  23.39 
 
 		 378 aa  72.8  0.000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.110874  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  22.87 
 
 		 382 aa  72  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0176  hypothetical protein  28.79 
 
 		 241 aa  72  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.67071  normal  0.0449558 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0476  ABC transporter  26.21 
 
 		 261 aa  71.6  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0918062 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  21.33 
 
 		 367 aa  72  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2281  ABC transporter, permease  26.84 
 
 		 337 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2250  ABC-2 type transporter  25.91 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.239998  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0449  putative multidrug efflux ABC transporter  29.95 
 
 		 274 aa  70.5  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.603097  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3039  hypothetical protein  22.76 
 
 		 382 aa  70.9  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.320364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2221  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  29.7 
 
 		 273 aa  70.5  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000454003  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1910  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  31.76 
 
 		 376 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0170149  normal  0.0809617 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3104  ABC-2 type transporter  21.99 
 
 		 375 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  24.42 
 
 		 384 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1750  putative multidrug efflux ABC transporter  30.54 
 
 		 277 aa  69.7  0.00000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0190039  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05121  putative multidrug efflux ABC transporter  29.95 
 
 		 274 aa  69.7  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001402  ABC-type multidrug transport system permease component  22.02 
 
 		 366 aa  69.3  0.00000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04741  putative multidrug efflux ABC transporter  29.41 
 
 		 274 aa  68.9  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1422  ABC-2 type transporter  22.34 
 
 		 373 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1524  ABC-2 type transporter  20.36 
 
 		 373 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.96 
 
 		 384 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1515  ABC-2 type transporter  20.36 
 
 		 373 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0427  ABC-2 type transporter  26.19 
 
 		 278 aa  68.9  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.469533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  23.79 
 
 		 384 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05051  putative multidrug efflux ABC transporter  29.41 
 
 		 274 aa  68.9  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.507008  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2831  ABC-2 type transporter  20.36 
 
 		 373 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.335891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2056  export ABC transporter permease protein  27.53 
 
 		 379 aa  68.9  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00520961  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  20.94 
 
 		 371 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  22.51 
 
 		 360 aa  68.2  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  22.99 
 
 		 366 aa  67.4  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0062  ABC-2 type transporter  28.64 
 
 		 260 aa  67.8  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566487  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06359  hypothetical protein  23.27 
 
 		 366 aa  67.8  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2573  ABC-2 type transporter  20.25 
 
 		 373 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>