More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1020 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  100 
 
 		 249 aa  482  1e-135  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1528  hypothetical protein  78.71 
 
 		 249 aa  385  1e-106  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2561  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  75.1 
 
 		 249 aa  375  1e-103  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  71.77 
 
 		 249 aa  367  1e-100  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1459  ABC-2 type transporter  75.5 
 
 		 249 aa  362  3e-99  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  67.47 
 
 		 249 aa  352  4e-96  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  48.79 
 
 		 250 aa  257  1e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0037  ABC-2 type transporter  47.15 
 
 		 255 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  39.6 
 
 		 254 aa  201  9e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2298  daunorubicin resistance ABC transporter membrane protein  46.23 
 
 		 264 aa  197  2.0000000000000003e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.207913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  42.17 
 
 		 255 aa  192  6e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  40 
 
 		 254 aa  190  2e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0559  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  49.07 
 
 		 264 aa  187  2e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  42.92 
 
 		 253 aa  185  6e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0300  ABC-2 type transporter  45.19 
 
 		 270 aa  179  4e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  38.25 
 
 		 253 aa  177  1e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0426  ABC-2 type transporter  40.56 
 
 		 256 aa  176  4e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  37.85 
 
 		 253 aa  175  5e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  37.45 
 
 		 253 aa  175  7e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1125  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  40.87 
 
 		 260 aa  172  2.9999999999999996e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.742933  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  37.85 
 
 		 251 aa  171  9e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1170  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  36.78 
 
 		 253 aa  168  6e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  39.19 
 
 		 284 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1380  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  42.06 
 
 		 256 aa  160  2e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000932687  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1426  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  41.59 
 
 		 256 aa  159  5e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0562869  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1239  hypothetical protein  70.34 
 
 		 126 aa  159  5e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0798004 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  39.3 
 
 		 288 aa  158  6e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4031  ABC-2 type transporter  42.06 
 
 		 289 aa  155  7e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.246164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2221  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  37.97 
 
 		 273 aa  150  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000454003  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5103  ABC-2 type transporter  36.44 
 
 		 281 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00233057  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2893  ABC-2 type transporter  32.66 
 
 		 270 aa  142  5e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0476  ABC transporter  32.39 
 
 		 261 aa  141  9e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0918062 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1203  ABC-2 type transporter  30.24 
 
 		 251 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0595438 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0215  ABC-2 type transporter  37.12 
 
 		 275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.716105  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0380  ABC-2 type transporter  36.67 
 
 		 280 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1766  multidrug ABC transporter, permease protein  30.08 
 
 		 242 aa  129  6e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2499  ABC-2 transporter component  36.97 
 
 		 276 aa  129  6e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0242  ABC-2 type transporter  34.22 
 
 		 278 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1478  ABC-2 type transporter  29.83 
 
 		 254 aa  119  3e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0062  ABC-2 type transporter  31.34 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566487  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1789  ABC-2 type transporter  34.43 
 
 		 261 aa  116  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2515  ABC transporter, permease protein  30.63 
 
 		 278 aa  115  8.999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0251  ABC-2 type transporter  32.16 
 
 		 255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.452318 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0176  hypothetical protein  29.17 
 
 		 241 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.67071  normal  0.0449558 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0427  ABC-2 type transporter  31.84 
 
 		 278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.469533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3931  ABC-2 type transporter  30.36 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.284935  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 290 aa  107  1e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0010  ABC-2 type transporter  30.21 
 
 		 280 aa  108  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0685  ABC transporter, permease protein  31.25 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.537478  normal  0.14182 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2056  ABC-2 type transporter  27.5 
 
 		 241 aa  106  4e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.794734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2794  hypothetical protein  28.83 
 
 		 276 aa  105  5e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0995371 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0230  ABC-2 type transporter  29.44 
 
 		 256 aa  105  9e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0287  hypothetical protein  28.75 
 
 		 241 aa  104  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.301015  normal  0.184502 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5948  ABC transporter permease  30.61 
 
 		 284 aa  104  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0673459  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4739  ABC-2 type transporter  31.34 
 
 		 285 aa  103  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1245  ABC-2 type transporter  30 
 
 		 292 aa  102  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0464218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2587  ABC multidrug efflux transporter, inner membrane subunit  30 
 
 		 286 aa  102  5e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1936  ABC-2 type transporter  29.22 
 
 		 286 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2171  ABC-2 type transporter  29.2 
 
 		 256 aa  100  3e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1561  ABC-2 type transporter  30.6 
 
 		 252 aa  99.4  4e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.403911  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2328  transporter, putative  33.33 
 
 		 246 aa  99  7e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.117528  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1861  ABC-2 type transporter  28.89 
 
 		 258 aa  98.6  8e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5008  ABC-2 type transporter  27.51 
 
 		 290 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0701746  normal  0.113041 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4411  ABC-2 type transporter  32.38 
 
 		 253 aa  97.8  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.309984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2668  putative ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 263 aa  98.2  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.149875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5312  ABC-2 type transporter  27.95 
 
 		 292 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.91396  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1802  ABC-2 type transporter  26.64 
 
 		 293 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217297  normal  0.454939 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0249  hypothetical protein  30.77 
 
 		 281 aa  96.3  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2250  ABC-2 type transporter  31.65 
 
 		 256 aa  95.9  6e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.239998  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2613  ABC-2 type transporter  25.79 
 
 		 270 aa  95.5  7e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.937981  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1851  ABC-2 type transporter  26.2 
 
 		 297 aa  95.1  9e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.894723 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0363  ABC-2 type transporter  25.66 
 
 		 289 aa  95.1  9e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2186  ABC-2 type transporter  26.2 
 
 		 297 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.189047 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2013  ABC-2 type transporter  30.36 
 
 		 256 aa  94.7  1e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.0000119274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  32.99 
 
 		 261 aa  93.6  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000233601  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0749  ABC-2 type transporter  30.2 
 
 		 253 aa  93.2  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.41583 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0723  ABC-2 type transporter  28.21 
 
 		 272 aa  92.8  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0756908 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1034  ABC-2 type transporter  30.14 
 
 		 256 aa  92.4  5e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.150436 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2326  ABC-2 type transporter  30.92 
 
 		 253 aa  92  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0025  ABC-2 type transporter  27.51 
 
 		 290 aa  92  7e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2261  ABC-2 type transporter  26.79 
 
 		 260 aa  90.5  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.121091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1448  ABC-2 type transporter  26.94 
 
 		 251 aa  90.1  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0318973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1221  ABC-2 type transporter  32.2 
 
 		 253 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.389129  decreased coverage  0.00710452 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1123  ABC-2 type transporter  32 
 
 		 257 aa  90.1  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0861  ABC-2 type transporter  29.6 
 
 		 255 aa  89.7  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0630993  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3036  ABC-2 type transporter  26.13 
 
 		 295 aa  89.7  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1607  ABC-2 type transporter  30.04 
 
 		 253 aa  89.7  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0979931  normal  0.144248 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1912  ABC-2 type transporter  29.84 
 
 		 253 aa  89.7  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.846791  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0704  ABC-2 type transporter  29.55 
 
 		 259 aa  89.4  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0516518 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0030  ABC-2 type transporter  28.45 
 
 		 272 aa  89  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2088  ABC-2 type transporter  30.47 
 
 		 253 aa  89  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0318264  normal  0.440249 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1894  putative daunorubicin resistance ABC transporter, permease protein  27.23 
 
 		 260 aa  88.6  9e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00976323  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2741  hypothetical protein  28.92 
 
 		 253 aa  88.2  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.919871  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3881  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 263 aa  88.2  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.574088  normal  0.697417 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0390  ABC-2 type transporter  31.2 
 
 		 255 aa  87.8  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6150  putative ABC-2 type transporter (permease protein)  29.24 
 
 		 253 aa  87.4  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00809538  normal  0.0938496 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0899  ABC transporter, inner membrane subunit  28.83 
 
 		 287 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.208954  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2924  putative ABC transporter inner membrane subunit  32.16 
 
 		 253 aa  87.8  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0411  putative NodJ  31.17 
 
 		 255 aa  87  3e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0497  ABC-2 type transporter  31.28 
 
 		 286 aa  87  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>