More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_2171 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_2171  ABC-2 type transporter  100 
 
 
256 aa  509  1e-143  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0230  ABC-2 type transporter  65.62 
 
 
256 aa  359  3e-98  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2013  ABC-2 type transporter  67.58 
 
 
256 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.0000119274  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1034  ABC-2 type transporter  66.41 
 
 
256 aa  321  9.000000000000001e-87  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.150436 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0251  ABC-2 type transporter  50.78 
 
 
255 aa  267  1e-70  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.452318 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0363  ABC-2 type transporter  31.29 
 
 
289 aa  126  3e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  30.55 
 
 
290 aa  124  1e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0062  ABC-2 type transporter  30.59 
 
 
260 aa  113  3e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566487  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0300  ABC-2 type transporter  31.22 
 
 
270 aa  109  3e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1766  multidrug ABC transporter, permease protein  30.97 
 
 
242 aa  109  6e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0559  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  34.02 
 
 
264 aa  108  9.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  31.11 
 
 
251 aa  108  9.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4106  ABC-2 type transporter  30.84 
 
 
293 aa  107  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  30.45 
 
 
250 aa  105  6e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2298  daunorubicin resistance ABC transporter membrane protein  29.87 
 
 
264 aa  105  6e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.207913  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0037  ABC-2 type transporter  29.3 
 
 
255 aa  105  8e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.8 
 
 
249 aa  103  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1478  ABC-2 type transporter  30.73 
 
 
254 aa  103  4e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.31 
 
 
254 aa  102  6e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2250  ABC-2 type transporter  32.05 
 
 
256 aa  102  6e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.239998  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0014  ABC-2 type transporter  28.95 
 
 
304 aa  101  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1125  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  33.18 
 
 
260 aa  100  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.742933  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  28.31 
 
 
284 aa  100  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0426  ABC-2 type transporter  28.83 
 
 
256 aa  99.4  5e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0476  ABC transporter  28.94 
 
 
261 aa  99  6e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0918062 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  32.72 
 
 
288 aa  99  6e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.34 
 
 
249 aa  98.6  8e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2561  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  31.05 
 
 
249 aa  97.8  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2056  ABC-2 type transporter  31.43 
 
 
241 aa  97.8  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.794734  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  26.19 
 
 
254 aa  97.8  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0685  ABC transporter, permease protein  27.39 
 
 
277 aa  96.7  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.537478  normal  0.14182 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  30.66 
 
 
255 aa  96.3  4e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  26.85 
 
 
253 aa  95.9  6e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1528  hypothetical protein  29.81 
 
 
249 aa  95.5  7e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0242  ABC-2 type transporter  30.45 
 
 
278 aa  95.1  8e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2893  ABC-2 type transporter  26.69 
 
 
270 aa  93.2  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.5 
 
 
249 aa  92.8  5e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.12 
 
 
253 aa  92.8  5e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1170  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.18 
 
 
253 aa  92.8  5e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0176  hypothetical protein  27.6 
 
 
241 aa  92  7e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.67071  normal  0.0449558 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1459  ABC-2 type transporter  31.71 
 
 
249 aa  91.7  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5103  ABC-2 type transporter  28.38 
 
 
281 aa  91.3  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00233057  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2221  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  30.2 
 
 
273 aa  90.5  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000454003  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0010  ABC-2 type transporter  29.57 
 
 
280 aa  90.1  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1380  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.22 
 
 
256 aa  90.1  3e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000932687  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1426  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.73 
 
 
256 aa  89.7  4e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0562869  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2515  ABC transporter, permease protein  29.77 
 
 
278 aa  89.7  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4031  ABC-2 type transporter  29.95 
 
 
289 aa  89.4  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.246164  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0427  ABC-2 type transporter  29.09 
 
 
278 aa  88.6  8e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.469533  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0287  hypothetical protein  26.91 
 
 
241 aa  88.6  9e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.301015  normal  0.184502 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1079  ABC-2 type transporter  31.63 
 
 
296 aa  88.2  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1123  ABC-2 type transporter  29.52 
 
 
257 aa  88.2  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.36 
 
 
253 aa  88.2  1e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0497  ABC-2 type transporter  29.44 
 
 
286 aa  87.8  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  32.98 
 
 
261 aa  87.4  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000233601  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3861  ABC-2 type transporter  30.77 
 
 
291 aa  86.7  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.92497  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3931  ABC-2 type transporter  30.22 
 
 
263 aa  86.7  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.284935  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0192  hypothetical protein  30.45 
 
 
295 aa  86.7  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.144906 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1561  ABC-2 type transporter  33.67 
 
 
252 aa  86.3  4e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.403911  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.27 
 
 
253 aa  85.9  6e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4739  ABC-2 type transporter  29.1 
 
 
285 aa  85.5  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1203  ABC-2 type transporter  27.63 
 
 
251 aa  85.5  8e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0595438 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4873  ABC-2 type transporter  30.94 
 
 
298 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0966  ABC-2 type transporter  29.09 
 
 
259 aa  85.1  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0786  ABC-2 type transporter  28.31 
 
 
254 aa  84.7  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.585621  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2794  hypothetical protein  23.28 
 
 
276 aa  83.6  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0995371 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2668  putative ABC-2 type transporter  27.51 
 
 
263 aa  83.2  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.149875  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2588  ABC-2 type transporter  31.53 
 
 
298 aa  83.2  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3518  ABC-2 type transporter  31.53 
 
 
298 aa  83.2  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04741  putative multidrug efflux ABC transporter  29.39 
 
 
274 aa  80.5  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23570  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  28.64 
 
 
267 aa  80.5  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.24456  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05051  putative multidrug efflux ABC transporter  29.39 
 
 
274 aa  80.9  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.507008  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0449  putative multidrug efflux ABC transporter  29.39 
 
 
274 aa  80.1  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.603097  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5948  ABC transporter permease  29.39 
 
 
284 aa  80.1  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0673459  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5008  ABC-2 type transporter  28.18 
 
 
290 aa  79  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0701746  normal  0.113041 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1802  ABC-2 type transporter  31 
 
 
293 aa  79.3  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217297  normal  0.454939 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0010  ABC-2 type transporter  30.88 
 
 
277 aa  79  0.00000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0265688  normal  0.974707 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1851  ABC-2 type transporter  31.56 
 
 
297 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.894723 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6126  ABC-2 type transporter  27.95 
 
 
275 aa  78.2  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0365687  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2186  ABC-2 type transporter  31.56 
 
 
297 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.189047 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2613  ABC-2 type transporter  29.2 
 
 
270 aa  77.4  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.937981  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2716  ABC-2 type transporter  27.31 
 
 
297 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.722099  normal  0.404026 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0215  ABC-2 type transporter  32.53 
 
 
275 aa  77.8  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.716105  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0612  putative multidrug efflux ABC transporter  31.42 
 
 
284 aa  76.6  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2149  ABC-2 type transport system permease protein  30.8 
 
 
286 aa  76.6  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.157353 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3136  ABC-2 type transporter  30.88 
 
 
263 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05121  putative multidrug efflux ABC transporter  29.46 
 
 
274 aa  75.9  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2499  ABC-2 transporter component  29.95 
 
 
276 aa  75.5  0.0000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1750  putative multidrug efflux ABC transporter  30.49 
 
 
277 aa  75.5  0.0000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0190039  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2261  ABC-2 type transporter  26.39 
 
 
260 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.121091  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1894  putative daunorubicin resistance ABC transporter, permease protein  29.66 
 
 
260 aa  75.1  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00976323  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1358  ABC-2 type transporter  28.37 
 
 
294 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.624692  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1796  ABC-2 type transporter  26.83 
 
 
280 aa  75.1  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000116393 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0025  ABC-2 type transporter  29.91 
 
 
290 aa  74.7  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1945  ABC-2 type transporter  33.18 
 
 
263 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0850168  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1789  ABC-2 type transporter  33.18 
 
 
261 aa  73.9  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2667  ABC transporter  31.8 
 
 
263 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0137793  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2845  ABC-2 type transporter  29.46 
 
 
269 aa  74.3  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0354167  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1861  ABC-2 type transporter  25.21 
 
 
258 aa  73.9  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3547  ABC-2 type transporter  30.5 
 
 
259 aa  73.6  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.369986 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>