More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3882 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3882  ABC-2 type transporter  100 
 
 
278 aa  542  1e-153  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1448  putative ABC transporter transmembrane protein  59.27 
 
 
252 aa  293  3e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0096  ABC-2 type transporter  60.98 
 
 
247 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1448  ABC-2 type transporter  55.78 
 
 
251 aa  281  8.000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0318973  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3137  ABC-2 type transporter  56.32 
 
 
277 aa  273  3e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.428202  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4170  ABC-2 type transporter  52.29 
 
 
270 aa  238  8e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0786  ABC-2 type transporter  41.13 
 
 
254 aa  157  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.585621  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4200  ABC-2 type transporter  45.74 
 
 
275 aa  156  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0014  ABC-2 type transporter  34.5 
 
 
304 aa  122  5e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3408  ABC-2 type transporter, permease protein  30.49 
 
 
243 aa  122  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184246  normal  0.618546 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1730  hypothetical protein  32.91 
 
 
251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.45161 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3247  ABC-2 type transporter  35.56 
 
 
254 aa  118  9e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.590775 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1533  ABC-2 type transporter  30.11 
 
 
274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2409  ABC-2 type transporter  34.19 
 
 
253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0497  ABC-2 type transporter  31.06 
 
 
286 aa  114  3e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1958  ABC-2 type transporter  33.07 
 
 
250 aa  112  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00055396  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4106  ABC-2 type transporter  31.25 
 
 
293 aa  112  8.000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1123  ABC-2 type transporter  31.13 
 
 
257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0062  ABC-2 type transporter  32.42 
 
 
260 aa  107  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566487  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0966  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 
259 aa  107  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0121  ABC-2 type transporter  32.94 
 
 
252 aa  101  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0240531  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1775  ABC transporter related protein  39.58 
 
 
249 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.254288 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  29.36 
 
 
269 aa  100  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  31.22 
 
 
270 aa  100  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1483  ABC-2 type transporter  30.4 
 
 
269 aa  99.8  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00140227  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  29.29 
 
 
288 aa  93.6  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0937  ABC-2 type transporter  30.4 
 
 
269 aa  93.6  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0918  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 
254 aa  89.7  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0666  ABC-2 type transporter  29.96 
 
 
285 aa  89.7  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0037  ABC-2 type transporter  29.27 
 
 
255 aa  89.4  6e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1839  ABC-2 type transporter  28.03 
 
 
266 aa  89  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0538  ABC-2 type transporter  29.82 
 
 
267 aa  89  8e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.690834  hitchhiker  0.000010786 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.51 
 
 
249 aa  87  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1123  ABC-2 type transporter  31.73 
 
 
275 aa  87  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1878  ABC-2 type transporter  31.82 
 
 
273 aa  86.7  4e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  32.89 
 
 
255 aa  86.3  5e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  28.84 
 
 
251 aa  85.1  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1426  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.02 
 
 
256 aa  84.3  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0562869  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2716  ABC-2 type transporter  29.84 
 
 
254 aa  84.3  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1380  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.02 
 
 
256 aa  84.3  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000932687  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0363  ABC-2 type transporter  28.1 
 
 
289 aa  83.6  0.000000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  30.09 
 
 
253 aa  84  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18340  ABC-type multidrug transport system, permease component  30.17 
 
 
282 aa  83.6  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.823039 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6126  ABC-2 type transporter  33.62 
 
 
275 aa  81.6  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0365687  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2250  ABC-2 type transporter  33.03 
 
 
256 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.239998  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1937  ABC-2 type transporter  25.34 
 
 
284 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.008119  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2056  ABC-2 type transporter  30.16 
 
 
241 aa  80.5  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.794734  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3547  ABC-2 type transporter  28.79 
 
 
259 aa  80.1  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.369986 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  30.26 
 
 
261 aa  79.3  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000233601  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0476  ABC transporter  25.91 
 
 
261 aa  79.3  0.00000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0918062 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  28.37 
 
 
284 aa  79  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1203  ABC-2 type transporter  30.97 
 
 
251 aa  79.3  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0595438 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5103  ABC-2 type transporter  28.21 
 
 
281 aa  79  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00233057  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3922  ABC-2 type transporter  26.09 
 
 
266 aa  79  0.00000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0348636  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1352  ABC-2 type transporter  29.77 
 
 
254 aa  78.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.137638  normal  0.090478 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1384  ABC-2 type transporter  26.84 
 
 
269 aa  78.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78336  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2021  hypothetical protein  25.59 
 
 
289 aa  78.2  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.290119  normal  0.988573 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.23 
 
 
253 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4031  ABC-2 type transporter  31.05 
 
 
289 aa  77.4  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.246164  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  29.54 
 
 
250 aa  77.4  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2298  daunorubicin resistance ABC transporter membrane protein  27.88 
 
 
264 aa  76.6  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.207913  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.23 
 
 
253 aa  76.6  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0746  ABC-2 type transporter  29.39 
 
 
280 aa  76.3  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.89 
 
 
254 aa  76.3  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23570  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  27.89 
 
 
267 aa  76.3  0.0000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.24456  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1766  multidrug ABC transporter, permease protein  30.52 
 
 
242 aa  76.3  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1476  ABC-2 type transporter  26.61 
 
 
267 aa  76.3  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19160  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  26.32 
 
 
319 aa  75.9  0.0000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.338631 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.96 
 
 
253 aa  75.5  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1808  ABC transporter, efflux permease protein  28.76 
 
 
249 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0300  ABC-2 type transporter  28.71 
 
 
270 aa  75.5  0.0000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  25.52 
 
 
290 aa  74.7  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1122  ABC-2 type transporter  25.48 
 
 
285 aa  75.1  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408605  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3101  ABC-2 type transporter  25.81 
 
 
266 aa  75.1  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0542  ABC-2 type transporter  26.54 
 
 
253 aa  75.1  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0340  ABC-2 type transporter  26.98 
 
 
273 aa  74.3  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.171685  hitchhiker  0.00234396 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1478  ABC-2 type transporter  24.55 
 
 
254 aa  73.6  0.000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  31.68 
 
 
254 aa  73.6  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1743  ABC-2 type transporter  28.32 
 
 
271 aa  73.2  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000246748 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4259  ABC-2 type transporter  23.89 
 
 
282 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4345  ABC-2 type transporter  23.89 
 
 
282 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0911686 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4638  ABC-2 type transporter  23.89 
 
 
282 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.619797  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0230  ABC-2 type transporter  27.63 
 
 
256 aa  72.8  0.000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1697  ABC-2 type transporter  26.09 
 
 
271 aa  73.2  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3103  ABC transporter protein  26.87 
 
 
280 aa  72.8  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00849207 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1170  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.03 
 
 
253 aa  72.8  0.000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1561  ABC-2 type transporter  30.39 
 
 
252 aa  72.8  0.000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.403911  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1622  ABC-2 type transporter  24.9 
 
 
278 aa  72.4  0.000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2939  ABC-2 type transporter  29.83 
 
 
286 aa  72.4  0.000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.27677 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6250  ABC-2 type transporter  23.94 
 
 
285 aa  72.4  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243116  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0176  hypothetical protein  27.31 
 
 
241 aa  71.6  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.67071  normal  0.0449558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4551  ABC-2 type transporter  29.06 
 
 
264 aa  71.6  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4739  ABC-2 type transporter  30.61 
 
 
285 aa  72  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1683  ABC-2 type transporter  29.46 
 
 
274 aa  71.2  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000181652  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0215  ABC-2 type transporter  32.72 
 
 
275 aa  72  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.716105  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0042  ABC-2 type transporter  26.22 
 
 
266 aa  71.6  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1351  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 
272 aa  71.2  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0414359  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0426  ABC-2 type transporter  27.4 
 
 
256 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4795  ABC-2 type transporter  25.88 
 
 
284 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.597944 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39010  ABC-type multidrug transport system, permease component  26.5 
 
 
271 aa  70.9  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.436846 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>