More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2864 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  100 
 
 
290 aa  573  1.0000000000000001e-163  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0363  ABC-2 type transporter  66.43 
 
 
289 aa  389  1e-107  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0251  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 
255 aa  149  5e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.452318 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  32.66 
 
 
255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0062  ABC-2 type transporter  32.59 
 
 
260 aa  136  5e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566487  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0476  ABC transporter  31.16 
 
 
261 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0918062 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0242  ABC-2 type transporter  33.62 
 
 
278 aa  125  7e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  31.8 
 
 
253 aa  124  2e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0230  ABC-2 type transporter  28.36 
 
 
256 aa  124  2e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  30.31 
 
 
261 aa  123  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000233601  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  30.96 
 
 
253 aa  123  3e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2250  ABC-2 type transporter  31.64 
 
 
256 aa  123  4e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.239998  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1170  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  30.23 
 
 
253 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1766  multidrug ABC transporter, permease protein  30.25 
 
 
242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2515  ABC transporter, permease protein  34.02 
 
 
278 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  31.38 
 
 
253 aa  119  6e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1561  ABC-2 type transporter  33.19 
 
 
252 aa  119  7e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.403911  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  30.58 
 
 
251 aa  119  9e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0685  ABC transporter, permease protein  31.23 
 
 
277 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.537478  normal  0.14182 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  31.17 
 
 
288 aa  116  6e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1123  ABC-2 type transporter  32.5 
 
 
257 aa  115  6e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2171  ABC-2 type transporter  30.55 
 
 
256 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1380  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  31.95 
 
 
256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000932687  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.86 
 
 
254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2056  ABC-2 type transporter  30.61 
 
 
241 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.794734  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1426  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  31.54 
 
 
256 aa  113  3e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0562869  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2013  ABC-2 type transporter  30.58 
 
 
256 aa  112  7.000000000000001e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.0000119274  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1034  ABC-2 type transporter  30.58 
 
 
256 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.150436 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1478  ABC-2 type transporter  28.79 
 
 
254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0427  ABC-2 type transporter  30.58 
 
 
278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.469533  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  28.51 
 
 
284 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0426  ABC-2 type transporter  29.92 
 
 
256 aa  110  3e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2298  daunorubicin resistance ABC transporter membrane protein  29.41 
 
 
264 aa  108  8.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.207913  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  33.33 
 
 
249 aa  107  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2794  hypothetical protein  28.98 
 
 
276 aa  107  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0995371 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1203  ABC-2 type transporter  30.6 
 
 
251 aa  106  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0595438 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5103  ABC-2 type transporter  37.28 
 
 
281 aa  106  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00233057  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2561  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  31.31 
 
 
249 aa  105  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  28.46 
 
 
250 aa  103  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0300  ABC-2 type transporter  27.63 
 
 
270 aa  99  7e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1528  hypothetical protein  30.65 
 
 
249 aa  99  8e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0192  hypothetical protein  30.47 
 
 
295 aa  99  9e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.144906 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0014  ABC-2 type transporter  28.8 
 
 
304 aa  99  9e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0176  hypothetical protein  35 
 
 
241 aa  98.6  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.67071  normal  0.0449558 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4106  ABC-2 type transporter  28.74 
 
 
293 aa  97.8  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0497  ABC-2 type transporter  31.6 
 
 
286 aa  97.1  3e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  25 
 
 
253 aa  97.1  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1258  ABC-2 type transporter  31.47 
 
 
366 aa  96.3  5e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.793324  normal  0.287343 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4031  ABC-2 type transporter  30.13 
 
 
289 aa  96.3  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.246164  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.77 
 
 
249 aa  96.3  5e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3861  ABC-2 type transporter  27.89 
 
 
291 aa  95.9  7e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.92497  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2893  ABC-2 type transporter  28.08 
 
 
270 aa  95.5  9e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2221  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  33.66 
 
 
273 aa  94.4  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000454003  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05121  putative multidrug efflux ABC transporter  29.2 
 
 
274 aa  93.6  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.97 
 
 
249 aa  93.2  4e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05051  putative multidrug efflux ABC transporter  28.57 
 
 
274 aa  92.4  7e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.507008  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0559  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  32.38 
 
 
264 aa  91.7  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1861  ABC-2 type transporter  26.85 
 
 
258 aa  91.7  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0449  putative multidrug efflux ABC transporter  28.74 
 
 
274 aa  90.9  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.603097  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1125  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  30.37 
 
 
260 aa  91.3  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.742933  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1459  ABC-2 type transporter  30.69 
 
 
249 aa  90.9  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0966  ABC-2 type transporter  27.5 
 
 
259 aa  90.5  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0287  hypothetical protein  34.38 
 
 
241 aa  90.1  4e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.301015  normal  0.184502 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0037  ABC-2 type transporter  26.19 
 
 
255 aa  89.7  5e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04741  putative multidrug efflux ABC transporter  27.76 
 
 
274 aa  89.7  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3518  ABC-2 type transporter  28.51 
 
 
298 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2588  ABC-2 type transporter  28.51 
 
 
298 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  30 
 
 
254 aa  87.8  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  25.2 
 
 
269 aa  87.8  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0613  ABC-2 type transporter  27.83 
 
 
369 aa  87.8  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4936  ABC-2 type transporter  32 
 
 
280 aa  86.3  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.707728  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4873  ABC-2 type transporter  28.63 
 
 
298 aa  86.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  24.14 
 
 
270 aa  86.7  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1079  ABC-2 type transporter  27.31 
 
 
296 aa  85.9  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1839  ABC-2 type transporter  27.83 
 
 
266 aa  85.9  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3547  ABC-2 type transporter  29 
 
 
259 aa  85.9  8e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.369986 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4739  ABC-2 type transporter  31.54 
 
 
285 aa  85.5  8e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0215  ABC-2 type transporter  34.43 
 
 
275 aa  85.1  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.716105  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1750  putative multidrug efflux ABC transporter  28.88 
 
 
277 aa  84.3  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0190039  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1796  ABC-2 type transporter  26.06 
 
 
280 aa  84.3  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000116393 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0025  ABC-2 type transporter  25.82 
 
 
290 aa  84.3  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0380  ABC-2 type transporter  28.65 
 
 
280 aa  84  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1622  ABC-2 type transporter  34.38 
 
 
278 aa  82.8  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1894  putative daunorubicin resistance ABC transporter, permease protein  26.82 
 
 
260 aa  82.8  0.000000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00976323  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2499  ABC-2 transporter component  28.74 
 
 
276 aa  82.4  0.000000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2613  ABC-2 type transporter  25.56 
 
 
270 aa  82.4  0.000000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.937981  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3931  ABC-2 type transporter  25.21 
 
 
263 aa  82.4  0.000000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.284935  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4761  ABC-2 type transporter  30.95 
 
 
261 aa  81.6  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000109025  hitchhiker  0.000621886 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1245  ABC-2 type transporter  26.94 
 
 
292 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0464218  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2587  ABC multidrug efflux transporter, inner membrane subunit  26.94 
 
 
286 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4979  ABC-2 type transporter  30.52 
 
 
274 aa  81.3  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5948  ABC transporter permease  27.56 
 
 
284 aa  80.9  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0673459  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2186  ABC-2 type transporter  25.42 
 
 
297 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.189047 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1851  ABC-2 type transporter  25.42 
 
 
297 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.894723 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2261  ABC-2 type transporter  26.12 
 
 
260 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.121091  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0723  ABC-2 type transporter  26.5 
 
 
272 aa  79.7  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0756908 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04481  putative multidrug efflux ABC transporter  27.16 
 
 
284 aa  79.7  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.86864  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1123  ABC-2 type transporter  27.5 
 
 
275 aa  79.3  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1802  ABC-2 type transporter  25 
 
 
293 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217297  normal  0.454939 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2775  ABC-2 type transporter  29.76 
 
 
278 aa  78.2  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00783625  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>