More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0380 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_0380  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 280 aa  536  1e-151  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  44.2 
 
 		 284 aa  231  1e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  43.48 
 
 		 288 aa  219  5e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0300  ABC-2 type transporter  43.4 
 
 		 270 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4031  ABC-2 type transporter  41.51 
 
 		 289 aa  201  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.246164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5103  ABC-2 type transporter  41.54 
 
 		 281 aa  192  5e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00233057  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4739  ABC-2 type transporter  40.6 
 
 		 285 aa  187  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2298  daunorubicin resistance ABC transporter membrane protein  38.99 
 
 		 264 aa  163  3e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.207913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  30.92 
 
 		 254 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  35.85 
 
 		 250 aa  144  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0426  ABC-2 type transporter  37.05 
 
 		 256 aa  143  4e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  36.67 
 
 		 249 aa  142  5e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2221  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  32.63 
 
 		 273 aa  138  7.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000454003  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0559  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  40.28 
 
 		 264 aa  137  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  30.41 
 
 		 251 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1380  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  34.17 
 
 		 256 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000932687  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1426  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  34.17 
 
 		 256 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0562869  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  34.76 
 
 		 253 aa  132  5e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  34.35 
 
 		 253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1125  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  38.43 
 
 		 260 aa  130  3e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.742933  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  33.48 
 
 		 253 aa  128  8.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  33.48 
 
 		 253 aa  126  5e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  32.08 
 
 		 249 aa  126  5e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1170  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  32.55 
 
 		 253 aa  125  6e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2893  ABC-2 type transporter  34.84 
 
 		 270 aa  125  6e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0215  ABC-2 type transporter  35.07 
 
 		 275 aa  125  8.000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.716105  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  31.28 
 
 		 255 aa  124  1e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2561  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  33.65 
 
 		 249 aa  124  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1459  ABC-2 type transporter  33.65 
 
 		 249 aa  123  4e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1528  hypothetical protein  32.38 
 
 		 249 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0037  ABC-2 type transporter  36.41 
 
 		 255 aa  120  3e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0062  ABC-2 type transporter  33.78 
 
 		 260 aa  117  3e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566487  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2499  ABC-2 transporter component  35.96 
 
 		 276 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.14 
 
 		 249 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0476  ABC transporter  27.85 
 
 		 261 aa  110  3e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0918062 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1203  ABC-2 type transporter  31.02 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0595438 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2328  transporter, putative  35.41 
 
 		 246 aa  107  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.117528  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1561  ABC-2 type transporter  32.24 
 
 		 252 aa  105  6e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.403911  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  30.14 
 
 		 254 aa  104  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1766  multidrug ABC transporter, permease protein  28.51 
 
 		 242 aa  103  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1789  ABC-2 type transporter  36.41 
 
 		 261 aa  101  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0242  ABC-2 type transporter  29.35 
 
 		 278 aa  100  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0899  ABC transporter, inner membrane subunit  35.11 
 
 		 287 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.208954  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0948  ABC-2 type transporter  35.11 
 
 		 287 aa  97.4  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0389515  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0950  ABC-2 type transporter  35.11 
 
 		 288 aa  97.1  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0945  ABC transporter related  34.3 
 
 		 665 aa  95.9  7e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2056  ABC-2 type transporter  31.94 
 
 		 241 aa  95.5  9e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.794734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0427  ABC-2 type transporter  28.7 
 
 		 278 aa  92.4  7e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.469533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1478  ABC-2 type transporter  23.67 
 
 		 254 aa  91.7  1e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5948  ABC transporter permease  26.97 
 
 		 284 aa  91.3  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0673459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1448  putative ABC transporter transmembrane protein  32.55 
 
 		 252 aa  91.3  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3931  ABC-2 type transporter  27.56 
 
 		 263 aa  90.5  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.284935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4106  ABC-2 type transporter  31.78 
 
 		 293 aa  90.5  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2613  ABC-2 type transporter  28.33 
 
 		 270 aa  89.7  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.937981  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0010  ABC-2 type transporter  28.38 
 
 		 280 aa  89  8e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2794  hypothetical protein  28.05 
 
 		 276 aa  88.6  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0995371 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0685  ABC transporter, permease protein  25.79 
 
 		 277 aa  87.8  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.537478  normal  0.14182 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1750  putative multidrug efflux ABC transporter  31.28 
 
 		 277 aa  87.4  2e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0190039  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0249  hypothetical protein  27.98 
 
 		 281 aa  86.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0287  hypothetical protein  29.44 
 
 		 241 aa  85.9  7e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.301015  normal  0.184502 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0014  ABC-2 type transporter  27.8 
 
 		 304 aa  85.9  7e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  28.81 
 
 		 290 aa  85.9  8e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3136  ABC-2 type transporter  28.71 
 
 		 263 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0613  ABC-2 type transporter  32.09 
 
 		 369 aa  85.5  8e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2171  ABC-2 type transporter  27.43 
 
 		 256 aa  85.5  8e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0230  ABC-2 type transporter  27.35 
 
 		 256 aa  85.5  9e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2250  ABC-2 type transporter  30.54 
 
 		 256 aa  85.1  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.239998  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0363  ABC-2 type transporter  24.1 
 
 		 289 aa  84.7  0.000000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3137  ABC-2 type transporter  29.41 
 
 		 277 aa  84  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.428202  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04481  putative multidrug efflux ABC transporter  30.17 
 
 		 284 aa  83.6  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.86864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2515  ABC transporter, permease protein  28.51 
 
 		 278 aa  81.6  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1861  ABC-2 type transporter  23.45 
 
 		 258 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1123  ABC-2 type transporter  32.34 
 
 		 275 aa  81.6  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3882  ABC-2 type transporter  31.4 
 
 		 278 aa  81.3  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0786  ABC-2 type transporter  27.2 
 
 		 254 aa  81.3  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.585621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1448  ABC-2 type transporter  32.11 
 
 		 251 aa  80.5  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0318973  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2667  ABC transporter  27.75 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0137793  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1894  putative daunorubicin resistance ABC transporter, permease protein  25.57 
 
 		 260 aa  79.7  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00976323  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3261  ABC-2 type transporter  25.7 
 
 		 249 aa  79.7  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2261  ABC-2 type transporter  27.91 
 
 		 260 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.121091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0025  ABC-2 type transporter  22.12 
 
 		 290 aa  79.3  0.00000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2186  ABC-2 type transporter  24.56 
 
 		 297 aa  79.3  0.00000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.189047 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1802  ABC-2 type transporter  23.32 
 
 		 293 aa  79  0.00000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217297  normal  0.454939 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2587  ABC multidrug efflux transporter, inner membrane subunit  25.41 
 
 		 286 aa  79  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1034  ABC-2 type transporter  28.19 
 
 		 256 aa  78.6  0.0000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.150436 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0176  hypothetical protein  27.31 
 
 		 241 aa  78.6  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.67071  normal  0.0449558 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3096  ABC-2 type transporter  27.75 
 
 		 263 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2845  ABC-2 type transporter  29.36 
 
 		 269 aa  78.2  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0354167  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0096  ABC-2 type transporter  30.28 
 
 		 247 aa  78.2  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1123  ABC-2 type transporter  29.38 
 
 		 257 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2013  ABC-2 type transporter  27.75 
 
 		 256 aa  77.8  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.0000119274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0723  ABC-2 type transporter  24.38 
 
 		 272 aa  77.8  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0756908 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1245  ABC-2 type transporter  25.53 
 
 		 292 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0464218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1851  ABC-2 type transporter  24.12 
 
 		 297 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.894723 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 270 aa  77  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1937  ABC-2 type transporter  26.58 
 
 		 284 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.008119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05051  putative multidrug efflux ABC transporter  26.19 
 
 		 274 aa  76.6  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.507008  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0192  hypothetical protein  29.11 
 
 		 295 aa  76.3  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.144906 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04741  putative multidrug efflux ABC transporter  26.19 
 
 		 274 aa  76.6  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0612  putative multidrug efflux ABC transporter  31.28 
 
 		 284 aa  76.3  0.0000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>