More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2250 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2250  ABC-2 type transporter  100 
 
 
256 aa  502  1e-141  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.239998  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  65.22 
 
 
261 aa  322  4e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000233601  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1478  ABC-2 type transporter  41.02 
 
 
254 aa  219  3e-56  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1561  ABC-2 type transporter  48.15 
 
 
252 aa  211  9e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.403911  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2298  daunorubicin resistance ABC transporter membrane protein  38.96 
 
 
264 aa  148  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.207913  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  34.58 
 
 
254 aa  146  3e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0476  ABC transporter  33.47 
 
 
261 aa  142  6e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0918062 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0363  ABC-2 type transporter  33.21 
 
 
289 aa  139  6e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0062  ABC-2 type transporter  33.19 
 
 
260 aa  138  8.999999999999999e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566487  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1766  multidrug ABC transporter, permease protein  33.89 
 
 
242 aa  135  9e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  34.35 
 
 
250 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1203  ABC-2 type transporter  35.55 
 
 
251 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0595438 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  31.64 
 
 
290 aa  132  6e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  34.48 
 
 
288 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  34.06 
 
 
251 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0559  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  39.66 
 
 
264 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0300  ABC-2 type transporter  32.05 
 
 
270 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.75 
 
 
253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  34.93 
 
 
284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1170  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  30.53 
 
 
253 aa  124  1e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2056  ABC-2 type transporter  36.84 
 
 
241 aa  123  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.794734  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  32.64 
 
 
255 aa  123  2e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0242  ABC-2 type transporter  35.81 
 
 
278 aa  122  4e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1380  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  32.13 
 
 
256 aa  122  8e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000932687  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  30.53 
 
 
253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  34.69 
 
 
253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  30.53 
 
 
253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0427  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 
278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.469533  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1426  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  32.13 
 
 
256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0562869  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0426  ABC-2 type transporter  30.61 
 
 
256 aa  119  4.9999999999999996e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.68 
 
 
249 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0685  ABC transporter, permease protein  30.04 
 
 
277 aa  118  7.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.537478  normal  0.14182 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5103  ABC-2 type transporter  31.62 
 
 
281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00233057  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0230  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 
256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4031  ABC-2 type transporter  31.89 
 
 
289 aa  116  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.246164  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0176  hypothetical protein  34.76 
 
 
241 aa  115  6e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.67071  normal  0.0449558 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0251  ABC-2 type transporter  31.93 
 
 
255 aa  115  8.999999999999998e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.452318 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1123  ABC-2 type transporter  31.7 
 
 
257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0287  hypothetical protein  31.15 
 
 
241 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.301015  normal  0.184502 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1125  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  33.88 
 
 
260 aa  112  8.000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.742933  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  31.22 
 
 
249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0966  ABC-2 type transporter  31.53 
 
 
259 aa  110  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  30.04 
 
 
254 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  34.12 
 
 
270 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2171  ABC-2 type transporter  32.05 
 
 
256 aa  107  1e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2515  ABC transporter, permease protein  32.54 
 
 
278 aa  108  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0497  ABC-2 type transporter  30.91 
 
 
286 aa  107  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2794  hypothetical protein  30.4 
 
 
276 aa  107  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0995371 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  31.65 
 
 
249 aa  106  3e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2893  ABC-2 type transporter  28.44 
 
 
270 aa  105  8e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2561  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.47 
 
 
249 aa  105  8e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2013  ABC-2 type transporter  32.16 
 
 
256 aa  105  1e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.0000119274  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1034  ABC-2 type transporter  32.16 
 
 
256 aa  103  2e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.150436 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4106  ABC-2 type transporter  29.49 
 
 
293 aa  103  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0037  ABC-2 type transporter  28.32 
 
 
255 aa  103  4e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4739  ABC-2 type transporter  32.84 
 
 
285 aa  103  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5259  ABC-2 type transporter  29.81 
 
 
277 aa  102  6e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  33.67 
 
 
269 aa  100  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1459  ABC-2 type transporter  29.47 
 
 
249 aa  100  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1622  ABC-2 type transporter  28.51 
 
 
278 aa  100  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1528  hypothetical protein  30.81 
 
 
249 aa  99.8  4e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0918  ABC-2 type transporter  30.84 
 
 
254 aa  99.8  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1122  ABC-2 type transporter  27.76 
 
 
285 aa  99  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408605  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0042  ABC-2 type transporter  30.63 
 
 
266 aa  96.7  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2897  ABC-2 type transporter  30.54 
 
 
274 aa  95.5  7e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.643507  normal  0.323486 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4170  ABC-2 type transporter  33.19 
 
 
270 aa  95.5  7e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  30.24 
 
 
339 aa  94  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  29.85 
 
 
360 aa  94.4  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  31.16 
 
 
360 aa  94.4  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0014  ABC-2 type transporter  29.74 
 
 
304 aa  93.6  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0723  ABC-2 type transporter  29.44 
 
 
272 aa  93.2  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0756908 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6787  ABC-2 type transporter  30.63 
 
 
268 aa  92.8  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000212784  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0786  ABC-2 type transporter  29.84 
 
 
254 aa  92  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.585621  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23570  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  28.9 
 
 
267 aa  92  7e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.24456  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  30.94 
 
 
375 aa  92.4  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3547  ABC-2 type transporter  30.96 
 
 
259 aa  91.3  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.369986 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1384  ABC-2 type transporter  28.7 
 
 
269 aa  90.9  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78336  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2588  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 
298 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2221  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  29.82 
 
 
273 aa  90.9  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000454003  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0010  ABC-2 type transporter  28.3 
 
 
280 aa  90.9  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3518  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 
298 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5948  ABC transporter permease  27.14 
 
 
284 aa  90.9  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0673459  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0393  ABC-2 type transporter  29.05 
 
 
274 aa  90.1  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2613  ABC-2 type transporter  29.15 
 
 
270 aa  89.7  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.937981  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0814  ABC transporter, permease protein  28.8 
 
 
241 aa  89.4  5e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2021  hypothetical protein  28.75 
 
 
289 aa  89.4  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.290119  normal  0.988573 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4873  ABC-2 type transporter  29.36 
 
 
298 aa  89.7  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1448  putative ABC transporter transmembrane protein  30.41 
 
 
252 aa  89  6e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1351  ABC-2 type transporter  32.19 
 
 
272 aa  89  6e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0414359  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1123  ABC-2 type transporter  28.31 
 
 
275 aa  89  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4023  ABC-2 type transporter  30.74 
 
 
267 aa  89  8e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.293949  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4056  ABC-2 type transporter  30.74 
 
 
267 aa  89  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3882  ABC-2 type transporter  30.8 
 
 
278 aa  88.6  8e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0192  hypothetical protein  28.51 
 
 
295 aa  88.6  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.144906 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3916  ABC transporter, inner membrane subunit  30.74 
 
 
267 aa  88.2  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1697  ABC-2 type transporter  27.87 
 
 
271 aa  88.2  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4936  ABC-2 type transporter  28.37 
 
 
280 aa  87.8  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.707728  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0538  ABC-2 type transporter  31.92 
 
 
267 aa  87.4  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.690834  hitchhiker  0.000010786 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_718  ABC transporter, permease protein  28.06 
 
 
260 aa  87  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000115983  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35420  ABC-type multidrug transport system, permease component  28.84 
 
 
257 aa  87  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>