269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1750 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1750  putative multidrug efflux ABC transporter  100 
 
 		 277 aa  520  1e-147  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0190039  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0612  putative multidrug efflux ABC transporter  90.44 
 
 		 284 aa  429  1e-119  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06471  putative multidrug efflux ABC transporter  86.45 
 
 		 284 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.620136 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04481  putative multidrug efflux ABC transporter  77.15 
 
 		 284 aa  399  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.86864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0449  putative multidrug efflux ABC transporter  72.73 
 
 		 274 aa  378  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.603097  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04741  putative multidrug efflux ABC transporter  71.22 
 
 		 274 aa  376  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05051  putative multidrug efflux ABC transporter  71.59 
 
 		 274 aa  372  1e-102  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.507008  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05121  putative multidrug efflux ABC transporter  72.73 
 
 		 274 aa  373  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1781  putative multidrug efflux ABC transporter  72.63 
 
 		 284 aa  360  1e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05041  putative multidrug efflux ABC transporter  71.48 
 
 		 284 aa  359  3e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.112221 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1079  ABC-2 type transporter  63.43 
 
 		 296 aa  320  9.999999999999999e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4873  ABC-2 type transporter  62.23 
 
 		 298 aa  317  2e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2588  ABC-2 type transporter  60.51 
 
 		 298 aa  313  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3518  ABC-2 type transporter  60.51 
 
 		 298 aa  312  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0192  hypothetical protein  62.01 
 
 		 295 aa  312  3.9999999999999997e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.144906 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3861  ABC-2 type transporter  61.09 
 
 		 291 aa  306  2.0000000000000002e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.92497  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2149  ABC-2 type transport system permease protein  62.64 
 
 		 286 aa  301  9e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.157353 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1358  ABC-2 type transporter  64.23 
 
 		 294 aa  294  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.624692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0062  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566487  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1123  ABC-2 type transporter  32.31 
 
 		 257 aa  106  5e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  31 
 
 		 284 aa  105  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  35.02 
 
 		 253 aa  103  3e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1766  multidrug ABC transporter, permease protein  31.75 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  34.39 
 
 		 288 aa  101  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  33.64 
 
 		 253 aa  99.4  5e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  34.39 
 
 		 253 aa  97.4  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0363  ABC-2 type transporter  29.3 
 
 		 289 aa  96.7  3e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1380  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.4 
 
 		 256 aa  95.9  6e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000932687  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1170  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  32.88 
 
 		 253 aa  95.9  6e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1478  ABC-2 type transporter  29.63 
 
 		 254 aa  95.5  8e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  32.6 
 
 		 251 aa  95.1  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0966  ABC-2 type transporter  34.56 
 
 		 259 aa  95.1  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1426  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.4 
 
 		 256 aa  94.4  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0562869  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2056  ABC-2 type transporter  31.96 
 
 		 241 aa  92.8  5e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.794734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5103  ABC-2 type transporter  30.04 
 
 		 281 aa  90.9  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00233057  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1203  ABC-2 type transporter  31.09 
 
 		 251 aa  88.6  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0595438 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.36 
 
 		 255 aa  87.8  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0476  ABC transporter  28.97 
 
 		 261 aa  87  3e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0918062 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0014  ABC-2 type transporter  28.22 
 
 		 304 aa  85.9  7e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  28.88 
 
 		 290 aa  84.3  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4739  ABC-2 type transporter  30.83 
 
 		 285 aa  84.7  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0176  hypothetical protein  30.18 
 
 		 241 aa  83.6  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.67071  normal  0.0449558 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  29.56 
 
 		 250 aa  82.4  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0426  ABC-2 type transporter  32.44 
 
 		 256 aa  80.9  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4106  ABC-2 type transporter  30.84 
 
 		 293 aa  80.1  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  27.68 
 
 		 261 aa  79.7  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000233601  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2221  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  30 
 
 		 273 aa  79.3  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000454003  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  29.82 
 
 		 254 aa  78.2  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.44 
 
 		 249 aa  78.6  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1123  ABC-2 type transporter  32.11 
 
 		 275 aa  78.2  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23570  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  29.06 
 
 		 267 aa  78.6  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.24456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0497  ABC-2 type transporter  28.24 
 
 		 286 aa  77.8  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2261  ABC-2 type transporter  28.07 
 
 		 260 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.121091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0242  ABC-2 type transporter  31 
 
 		 278 aa  78.2  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25.91 
 
 		 254 aa  77.8  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4031  ABC-2 type transporter  30.77 
 
 		 289 aa  77  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.246164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2499  ABC-2 transporter component  33.64 
 
 		 276 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2250  ABC-2 type transporter  28.37 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.239998  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0786  ABC-2 type transporter  27.04 
 
 		 254 aa  76.3  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.585621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0287  hypothetical protein  27.93 
 
 		 241 aa  75.9  0.0000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.301015  normal  0.184502 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2171  ABC-2 type transporter  30.49 
 
 		 256 aa  75.5  0.0000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0380  ABC-2 type transporter  31.28 
 
 		 280 aa  75.5  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3408  ABC-2 type transporter, permease protein  33.03 
 
 		 243 aa  75.9  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184246  normal  0.618546 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2515  ABC transporter, permease protein  29.32 
 
 		 278 aa  75.5  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2794  hypothetical protein  29.01 
 
 		 276 aa  74.3  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0995371 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3547  ABC-2 type transporter  33.18 
 
 		 259 aa  73.9  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.369986 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0230  ABC-2 type transporter  30.63 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0685  ABC transporter, permease protein  26.96 
 
 		 277 aa  73.2  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.537478  normal  0.14182 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0427  ABC-2 type transporter  27.85 
 
 		 278 aa  72.8  0.000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.469533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8873  ABC-2 type transporter  30.64 
 
 		 270 aa  72.4  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.53633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1448  putative ABC transporter transmembrane protein  30 
 
 		 252 aa  71.6  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1894  putative daunorubicin resistance ABC transporter, permease protein  28.32 
 
 		 260 aa  71.2  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00976323  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1528  hypothetical protein  26.11 
 
 		 249 aa  71.2  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18340  ABC-type multidrug transport system, permease component  31.61 
 
 		 282 aa  71.2  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.823039 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1561  ABC-2 type transporter  26.98 
 
 		 252 aa  70.1  0.00000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.403911  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0613  ABC-2 type transporter  30.54 
 
 		 369 aa  69.7  0.00000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0918  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 		 254 aa  70.1  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0037  ABC-2 type transporter  28.19 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2298  daunorubicin resistance ABC transporter membrane protein  25.24 
 
 		 264 aa  68.9  0.00000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.207913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  25.74 
 
 		 253 aa  68.6  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  25.21 
 
 		 269 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0937  ABC-2 type transporter  27.31 
 
 		 269 aa  67.8  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1459  ABC-2 type transporter  27.32 
 
 		 249 aa  67  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0300  ABC-2 type transporter  27.14 
 
 		 270 aa  67.4  0.0000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3132  ABC-2 type transporter  30.87 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.571081  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6126  ABC-2 type transporter  31.5 
 
 		 275 aa  67.4  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0365687  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  27.59 
 
 		 270 aa  66.6  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4551  ABC-2 type transporter  27.8 
 
 		 264 aa  66.6  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0559  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.03 
 
 		 264 aa  67  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2667  ABC transporter  32.16 
 
 		 263 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0137793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1796  ABC-2 type transporter  30.25 
 
 		 280 aa  66.2  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000116393 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.29 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3882  ABC-2 type transporter  29.96 
 
 		 278 aa  65.9  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3137  ABC-2 type transporter  26.07 
 
 		 277 aa  65.9  0.0000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.428202  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25.73 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3096  ABC-2 type transporter  32.16 
 
 		 263 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0010  ABC-2 type transporter  25.68 
 
 		 280 aa  65.5  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8158  ABC-2 type transporter  29.39 
 
 		 272 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.880228 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0340  ABC-2 type transporter  30.63 
 
 		 273 aa  64.7  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.171685  hitchhiker  0.00234396 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1483  ABC-2 type transporter  27.12 
 
 		 269 aa  64.3  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00140227  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>