More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3137 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_3137  ABC-2 type transporter  100 
 
 
277 aa  538  9.999999999999999e-153  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.428202  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0096  ABC-2 type transporter  71.07 
 
 
247 aa  333  2e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1448  ABC-2 type transporter  55.16 
 
 
251 aa  287  1e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0318973  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3882  ABC-2 type transporter  56.32 
 
 
278 aa  286  2.9999999999999996e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1448  putative ABC transporter transmembrane protein  58.3 
 
 
252 aa  280  3e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4170  ABC-2 type transporter  58.17 
 
 
270 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4200  ABC-2 type transporter  47.98 
 
 
275 aa  172  5.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0786  ABC-2 type transporter  34.9 
 
 
254 aa  138  7.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.585621  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1533  ABC-2 type transporter  35.09 
 
 
274 aa  135  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3408  ABC-2 type transporter, permease protein  35.81 
 
 
243 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184246  normal  0.618546 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1958  ABC-2 type transporter  39.21 
 
 
250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00055396  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0014  ABC-2 type transporter  36.05 
 
 
304 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0121  ABC-2 type transporter  38.84 
 
 
252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0240531  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1775  ABC transporter related protein  40.36 
 
 
249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.254288 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1730  hypothetical protein  33.03 
 
 
251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.45161 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3247  ABC-2 type transporter  33.47 
 
 
254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.590775 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2409  ABC-2 type transporter  33.06 
 
 
253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4106  ABC-2 type transporter  33.61 
 
 
293 aa  108  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0497  ABC-2 type transporter  29.33 
 
 
286 aa  100  3e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1123  ABC-2 type transporter  30 
 
 
257 aa  99.8  5e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0966  ABC-2 type transporter  33.78 
 
 
259 aa  95.9  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  30 
 
 
253 aa  92  9e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0062  ABC-2 type transporter  29.54 
 
 
260 aa  91.7  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566487  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1483  ABC-2 type transporter  29.82 
 
 
269 aa  91.3  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00140227  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23570  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  30.45 
 
 
267 aa  91.3  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.24456  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.76 
 
 
255 aa  90.5  3e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  31.42 
 
 
269 aa  90.1  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  30.41 
 
 
251 aa  89  7e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0937  ABC-2 type transporter  30.49 
 
 
269 aa  89  9e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3547  ABC-2 type transporter  32.1 
 
 
259 aa  88.6  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.369986 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0666  ABC-2 type transporter  29.67 
 
 
285 aa  87.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  30.49 
 
 
270 aa  87.8  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1426  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.93 
 
 
256 aa  87.8  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0562869  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.51 
 
 
253 aa  87  3e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1478  ABC-2 type transporter  27.93 
 
 
254 aa  87  3e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1380  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.24 
 
 
256 aa  87.4  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000932687  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3922  ABC-2 type transporter  31.98 
 
 
266 aa  86.7  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0348636  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4551  ABC-2 type transporter  29.08 
 
 
264 aa  86.7  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2716  ABC-2 type transporter  31.96 
 
 
254 aa  86.7  4e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1170  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.77 
 
 
253 aa  86.3  5e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.55 
 
 
253 aa  85.9  6e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.91 
 
 
254 aa  84.7  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1878  ABC-2 type transporter  34.17 
 
 
273 aa  84  0.000000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1683  ABC-2 type transporter  29.55 
 
 
274 aa  83.6  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000181652  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0037  ABC-2 type transporter  27.9 
 
 
255 aa  84  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0363  ABC-2 type transporter  27.64 
 
 
289 aa  84  0.000000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  27.16 
 
 
250 aa  83.6  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4081  ABC-2 type transporter  29.53 
 
 
274 aa  83.2  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.431533 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0674  ABC-2 type transporter  31.02 
 
 
272 aa  83.2  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1123  ABC-2 type transporter  32.31 
 
 
275 aa  82.4  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  30.99 
 
 
253 aa  82.4  0.000000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0918  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 
254 aa  82  0.000000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  28.69 
 
 
288 aa  82  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0746  ABC-2 type transporter  28.24 
 
 
280 aa  81.6  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1622  ABC-2 type transporter  23.6 
 
 
278 aa  80.9  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4031  ABC-2 type transporter  32.26 
 
 
289 aa  80.9  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.246164  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3103  ABC transporter protein  28.37 
 
 
280 aa  80.5  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00849207 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1937  ABC-2 type transporter  26.72 
 
 
284 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.008119  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1351  ABC-2 type transporter  26.15 
 
 
272 aa  80.1  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0414359  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18340  ABC-type multidrug transport system, permease component  29.32 
 
 
282 aa  79.7  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.823039 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3101  ABC-2 type transporter  30.42 
 
 
266 aa  79.3  0.00000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1384  ABC-2 type transporter  26.61 
 
 
269 aa  79  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78336  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19160  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  32.8 
 
 
319 aa  78.2  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.338631 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1122  ABC-2 type transporter  27.45 
 
 
285 aa  78.2  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408605  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0300  ABC-2 type transporter  31.53 
 
 
270 aa  77.4  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  28.15 
 
 
284 aa  77.4  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2775  ABC-2 type transporter  28.7 
 
 
278 aa  77  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00783625  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.39 
 
 
249 aa  76.6  0.0000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5103  ABC-2 type transporter  27.93 
 
 
281 aa  76.6  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00233057  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1743  ABC-2 type transporter  29.86 
 
 
271 aa  76.3  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000246748 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0380  ABC-2 type transporter  28.99 
 
 
280 aa  75.9  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1352  ABC-2 type transporter  30 
 
 
254 aa  75.9  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.137638  normal  0.090478 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0192  hypothetical protein  29.24 
 
 
295 aa  75.5  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.144906 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1697  ABC-2 type transporter  25.63 
 
 
271 aa  75.5  0.0000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3239  ABC transporter efflux permease  28.69 
 
 
249 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  28 
 
 
254 aa  75.1  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3453  ABC transporter, efflux permease protein  28.69 
 
 
249 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3492  ABC transporter permease  28.69 
 
 
249 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.799548  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5259  ABC-2 type transporter  29.06 
 
 
277 aa  75.1  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1839  ABC-2 type transporter  27.88 
 
 
266 aa  75.1  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0340  ABC-2 type transporter  28.44 
 
 
273 aa  75.1  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.171685  hitchhiker  0.00234396 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4656  ABC-2 type transporter  26.84 
 
 
285 aa  75.5  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.890125  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0393  ABC-2 type transporter  27.53 
 
 
274 aa  74.3  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3467  ABC transporter, efflux permease protein  28.69 
 
 
249 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000810233  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2250  ABC-2 type transporter  30.59 
 
 
256 aa  74.3  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.239998  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4936  ABC-2 type transporter  26.76 
 
 
280 aa  73.9  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.707728  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07250  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  29.15 
 
 
265 aa  74.3  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.307058 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2021  hypothetical protein  26.24 
 
 
289 aa  73.9  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.290119  normal  0.988573 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1561  ABC-2 type transporter  28.5 
 
 
252 aa  73.9  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.403911  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1476  ABC-2 type transporter  30.59 
 
 
267 aa  74.3  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0042  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 
266 aa  73.9  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1528  hypothetical protein  26.67 
 
 
249 aa  73.6  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2939  ABC-2 type transporter  27.06 
 
 
286 aa  73.9  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.27677 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2294  ABC-2 type transporter  29.44 
 
 
277 aa  73.2  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.911135  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.54 
 
 
249 aa  72.8  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0476  ABC transporter  22.75 
 
 
261 aa  72.8  0.000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0918062 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0723  ABC-2 type transporter  27.2 
 
 
272 aa  72.4  0.000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0756908 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0538  ABC-2 type transporter  26.73 
 
 
267 aa  72.4  0.000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.690834  hitchhiker  0.000010786 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3149  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  27.85 
 
 
249 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0286068  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6126  ABC-2 type transporter  29.91 
 
 
275 aa  72  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0365687  normal  0.579785 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>