More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1448 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1448  ABC-2 type transporter  100 
 
 
251 aa  497  1e-140  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0318973  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3882  ABC-2 type transporter  55.78 
 
 
278 aa  281  7.000000000000001e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3137  ABC-2 type transporter  55.16 
 
 
277 aa  277  1e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.428202  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0096  ABC-2 type transporter  54.55 
 
 
247 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1448  putative ABC transporter transmembrane protein  52.44 
 
 
252 aa  266  2e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4170  ABC-2 type transporter  54 
 
 
270 aa  246  3e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4200  ABC-2 type transporter  43.66 
 
 
275 aa  150  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0786  ABC-2 type transporter  37.3 
 
 
254 aa  143  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.585621  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1533  ABC-2 type transporter  35.18 
 
 
274 aa  135  6.0000000000000005e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3408  ABC-2 type transporter, permease protein  32.26 
 
 
243 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184246  normal  0.618546 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3247  ABC-2 type transporter  34.41 
 
 
254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.590775 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0121  ABC-2 type transporter  32.94 
 
 
252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0240531  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1730  hypothetical protein  31.14 
 
 
251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.45161 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0062  ABC-2 type transporter  28.85 
 
 
260 aa  105  9e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566487  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1123  ABC-2 type transporter  31.02 
 
 
257 aa  104  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1958  ABC-2 type transporter  29.13 
 
 
250 aa  103  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00055396  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2409  ABC-2 type transporter  31.84 
 
 
253 aa  99.8  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0966  ABC-2 type transporter  32.08 
 
 
259 aa  99.4  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0014  ABC-2 type transporter  32.63 
 
 
304 aa  97.8  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1775  ABC transporter related protein  33.18 
 
 
249 aa  97.1  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.254288 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0497  ABC-2 type transporter  30.45 
 
 
286 aa  93.6  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.94 
 
 
249 aa  90.1  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  30.99 
 
 
250 aa  89.7  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4106  ABC-2 type transporter  32.61 
 
 
293 aa  89.7  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.83 
 
 
249 aa  86.3  4e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  32.86 
 
 
288 aa  85.9  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.97 
 
 
249 aa  84.7  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1426  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  32.61 
 
 
256 aa  83.6  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0562869  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  28.97 
 
 
270 aa  83.2  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1380  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  32.61 
 
 
256 aa  83.2  0.000000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000932687  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1528  hypothetical protein  26.6 
 
 
249 aa  83.2  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  27.97 
 
 
269 aa  81.3  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1561  ABC-2 type transporter  28.43 
 
 
252 aa  80.5  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.403911  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0476  ABC transporter  28.05 
 
 
261 aa  80.1  0.00000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0918062 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2250  ABC-2 type transporter  30.43 
 
 
256 aa  80.1  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.239998  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0037  ABC-2 type transporter  29.95 
 
 
255 aa  80.1  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5103  ABC-2 type transporter  29.87 
 
 
281 aa  79.7  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00233057  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1766  multidrug ABC transporter, permease protein  28.81 
 
 
242 aa  79.3  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1170  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.81 
 
 
253 aa  79  0.00000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  28.97 
 
 
253 aa  78.2  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.06 
 
 
253 aa  77.8  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19160  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  28.43 
 
 
319 aa  77  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.338631 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2561  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.96 
 
 
249 aa  76.6  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.57 
 
 
253 aa  76.6  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4031  ABC-2 type transporter  29.6 
 
 
289 aa  76.6  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.246164  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.17 
 
 
254 aa  76.3  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  29.33 
 
 
284 aa  76.3  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  25 
 
 
251 aa  75.9  0.0000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4551  ABC-2 type transporter  30.7 
 
 
264 aa  75.9  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.08 
 
 
253 aa  75.9  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2716  ABC-2 type transporter  30.66 
 
 
254 aa  75.5  0.0000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0937  ABC-2 type transporter  26.73 
 
 
269 aa  74.7  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1459  ABC-2 type transporter  27.14 
 
 
249 aa  74.3  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3922  ABC-2 type transporter  26.7 
 
 
266 aa  73.9  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0348636  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0666  ABC-2 type transporter  27.93 
 
 
285 aa  74.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25.2 
 
 
255 aa  73.9  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6126  ABC-2 type transporter  30.52 
 
 
275 aa  73.9  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0365687  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07250  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  27.43 
 
 
265 aa  73.6  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.307058 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  28.45 
 
 
261 aa  73.2  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000233601  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1342  ABC-2 type transporter  28.7 
 
 
279 aa  73.2  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.333729  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0918  ABC-2 type transporter  28.85 
 
 
254 aa  73.2  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0426  ABC-2 type transporter  25.93 
 
 
256 aa  72  0.000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1203  ABC-2 type transporter  28.83 
 
 
251 aa  72  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0595438 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0746  ABC-2 type transporter  27.73 
 
 
280 aa  72  0.000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1478  ABC-2 type transporter  25.98 
 
 
254 aa  71.2  0.00000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1937  ABC-2 type transporter  25 
 
 
284 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.008119  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0363  ABC-2 type transporter  26.39 
 
 
289 aa  71.2  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0538  ABC-2 type transporter  29.91 
 
 
267 aa  70.9  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.690834  hitchhiker  0.000010786 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0300  ABC-2 type transporter  26.54 
 
 
270 aa  70.9  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2775  ABC-2 type transporter  28.92 
 
 
278 aa  70.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00783625  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6375  ABC-2 type transporter  27.05 
 
 
247 aa  71.2  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  27.64 
 
 
254 aa  70.5  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0327  ABC-2 type transporter  29.82 
 
 
251 aa  70.1  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.461338  normal  0.0259517 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1743  ABC-2 type transporter  27.36 
 
 
271 aa  70.1  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000246748 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  25.09 
 
 
290 aa  69.7  0.00000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2588  ABC-2 type transporter  30.23 
 
 
298 aa  69.3  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3518  ABC-2 type transporter  30.23 
 
 
298 aa  69.3  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3101  ABC-2 type transporter  26.32 
 
 
266 aa  68.9  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2298  daunorubicin resistance ABC transporter membrane protein  27.23 
 
 
264 aa  68.2  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.207913  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1384  ABC-2 type transporter  26.46 
 
 
269 aa  68.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78336  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1483  ABC-2 type transporter  25.46 
 
 
269 aa  68.2  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00140227  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23570  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  25.44 
 
 
267 aa  67.4  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.24456  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2973  multidrug ABC transporter inner membrane protein  29.82 
 
 
226 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0206648 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1125  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.7 
 
 
260 aa  67  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.742933  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0042  ABC-2 type transporter  28.87 
 
 
266 aa  67  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1351  ABC-2 type transporter  29.68 
 
 
272 aa  66.6  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0414359  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1878  ABC-2 type transporter  29.21 
 
 
273 aa  67  0.0000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0559  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  31.71 
 
 
264 aa  66.2  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3547  ABC-2 type transporter  25.1 
 
 
259 aa  66.6  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.369986 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6250  ABC-2 type transporter  26.19 
 
 
285 aa  66.2  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243116  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0251  ABC-2 type transporter  25.91 
 
 
255 aa  65.9  0.0000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.452318 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2893  ABC-2 type transporter  25.67 
 
 
270 aa  65.5  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  31.48 
 
 
339 aa  65.1  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2043  ABC-2 type transporter  28.24 
 
 
279 aa  64.7  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.167343  hitchhiker  0.00685853 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18340  ABC-type multidrug transport system, permease component  28.77 
 
 
282 aa  65.1  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.823039 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1839  ABC-2 type transporter  25.98 
 
 
266 aa  65.1  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3861  ABC-2 type transporter  27.92 
 
 
291 aa  64.7  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.92497  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2897  ABC-2 type transporter  25.93 
 
 
274 aa  64.7  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.643507  normal  0.323486 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2221  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  28.99 
 
 
273 aa  63.9  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000454003  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1683  ABC-2 type transporter  28.88 
 
 
274 aa  64.7  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000181652  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>