More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4200 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4200  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 275 aa  520  1e-146  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3137  ABC-2 type transporter  45.65 
 
 		 277 aa  213  3.9999999999999995e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.428202  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0096  ABC-2 type transporter  48.35 
 
 		 247 aa  199  5e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1448  putative ABC transporter transmembrane protein  46.91 
 
 		 252 aa  199  5e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3882  ABC-2 type transporter  42.55 
 
 		 278 aa  194  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1448  ABC-2 type transporter  41.56 
 
 		 251 aa  191  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0318973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3408  ABC-2 type transporter, permease protein  44.9 
 
 		 243 aa  177  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184246  normal  0.618546 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4170  ABC-2 type transporter  45.53 
 
 		 270 aa  172  5e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0786  ABC-2 type transporter  43.16 
 
 		 254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.585621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1533  ABC-2 type transporter  41.87 
 
 		 274 aa  165  6.9999999999999995e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2409  ABC-2 type transporter  40.08 
 
 		 253 aa  146  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0121  ABC-2 type transporter  42.17 
 
 		 252 aa  141  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0240531  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3247  ABC-2 type transporter  41.08 
 
 		 254 aa  132  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.590775 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1730  hypothetical protein  36.97 
 
 		 251 aa  132  6.999999999999999e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.45161 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1958  ABC-2 type transporter  39.37 
 
 		 250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00055396  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1123  ABC-2 type transporter  32.03 
 
 		 257 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1775  ABC transporter related protein  37.9 
 
 		 249 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.254288 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0966  ABC-2 type transporter  33.01 
 
 		 259 aa  103  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0497  ABC-2 type transporter  29.55 
 
 		 286 aa  100  3e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0014  ABC-2 type transporter  28.32 
 
 		 304 aa  97.1  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0062  ABC-2 type transporter  26.43 
 
 		 260 aa  95.9  7e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566487  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  31.88 
 
 		 261 aa  92.8  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000233601  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4106  ABC-2 type transporter  31.58 
 
 		 293 aa  92.4  6e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  30.62 
 
 		 250 aa  92.4  7e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2250  ABC-2 type transporter  32.78 
 
 		 256 aa  92  9e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.239998  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5103  ABC-2 type transporter  33.63 
 
 		 281 aa  92  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00233057  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1622  ABC-2 type transporter  26.67 
 
 		 278 aa  90.5  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6126  ABC-2 type transporter  32.74 
 
 		 275 aa  90.1  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0365687  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6787  ABC-2 type transporter  32.18 
 
 		 268 aa  89.4  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000212784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0918  ABC-2 type transporter  29.48 
 
 		 254 aa  88.6  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  29.77 
 
 		 251 aa  88.6  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  27.98 
 
 		 254 aa  86.7  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1483  ABC-2 type transporter  28.07 
 
 		 269 aa  85.1  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00140227  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1561  ABC-2 type transporter  29.73 
 
 		 252 aa  84  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.403911  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  28.14 
 
 		 269 aa  83.6  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1380  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.09 
 
 		 256 aa  83.2  0.000000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000932687  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1426  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.09 
 
 		 256 aa  83.2  0.000000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0562869  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4031  ABC-2 type transporter  31.08 
 
 		 289 aa  82.4  0.000000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.246164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0476  ABC transporter  24.78 
 
 		 261 aa  82  0.000000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0918062 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0666  ABC-2 type transporter  28.76 
 
 		 285 aa  81.6  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18340  ABC-type multidrug transport system, permease component  33.49 
 
 		 282 aa  81.6  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.823039 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23570  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  25.56 
 
 		 267 aa  82  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.24456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0042  ABC-2 type transporter  27.5 
 
 		 266 aa  81.6  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1683  ABC-2 type transporter  28.94 
 
 		 274 aa  80.9  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000181652  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3253  ABC transporter related  26.54 
 
 		 265 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00665342  normal  0.245763 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2100  ABC-2 type transporter  30.43 
 
 		 267 aa  80.1  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  29.58 
 
 		 288 aa  79.7  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0215  ABC-2 type transporter  28.19 
 
 		 275 aa  79.3  0.00000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.716105  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  28.11 
 
 		 270 aa  79.3  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0746  ABC-2 type transporter  27.05 
 
 		 280 aa  79  0.00000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0393  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 274 aa  78.2  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1851  ABC-2 type transporter  26.34 
 
 		 297 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.894723 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1203  ABC-2 type transporter  29.36 
 
 		 251 aa  78.6  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0595438 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2016  ABC-2 type transporter  29.69 
 
 		 268 aa  78.6  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0300  ABC-2 type transporter  30.18 
 
 		 270 aa  78.2  0.0000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0426  ABC-2 type transporter  26.07 
 
 		 256 aa  78.6  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3103  ABC transporter protein  30.43 
 
 		 280 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849207 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2186  ABC-2 type transporter  26.34 
 
 		 297 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.189047 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2716  ABC-2 type transporter  31.4 
 
 		 254 aa  78.2  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3328  ABC-2 type transporter  29.39 
 
 		 281 aa  77.8  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.45338  normal  0.334159 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1878  ABC-2 type transporter  31.7 
 
 		 273 aa  77.4  0.0000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0451  ABC-type multidrug transport system, permease component  28.3 
 
 		 269 aa  76.6  0.0000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0034336  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0340  ABC-2 type transporter  26.95 
 
 		 273 aa  76.3  0.0000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.171685  hitchhiker  0.00234396 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1123  ABC-2 type transporter  29.65 
 
 		 275 aa  76.3  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2294  ABC-2 type transporter  29.91 
 
 		 277 aa  76.3  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.911135  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1170  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  23.98 
 
 		 253 aa  75.9  0.0000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0363  ABC-2 type transporter  25.37 
 
 		 289 aa  75.5  0.0000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1478  ABC-2 type transporter  22.91 
 
 		 254 aa  74.7  0.000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1802  ABC-2 type transporter  25.45 
 
 		 293 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217297  normal  0.454939 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  24.19 
 
 		 249 aa  75.1  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35420  ABC-type multidrug transport system, permease component  25.75 
 
 		 257 aa  74.7  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  28.63 
 
 		 284 aa  74.7  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.66 
 
 		 253 aa  73.9  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0723  ABC-2 type transporter  28.87 
 
 		 272 aa  73.6  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0756908 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0538  ABC-2 type transporter  27.1 
 
 		 267 aa  73.2  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.690834  hitchhiker  0.000010786 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0937  ABC-2 type transporter  26.05 
 
 		 269 aa  73.6  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1351  ABC-2 type transporter  27.01 
 
 		 272 aa  73.2  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0414359  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0230  ABC-2 type transporter  26.61 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1528  hypothetical protein  25.63 
 
 		 249 aa  72.8  0.000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.09 
 
 		 253 aa  72.8  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4023  ABC-2 type transporter  28.14 
 
 		 267 aa  72.8  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.293949  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4056  ABC-2 type transporter  28.14 
 
 		 267 aa  72.8  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.04 
 
 		 253 aa  72  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30730  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  26.15 
 
 		 277 aa  72  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.364162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4551  ABC-2 type transporter  28.26 
 
 		 264 aa  72  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1766  multidrug ABC transporter, permease protein  30.91 
 
 		 242 aa  71.6  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3916  ABC transporter, inner membrane subunit  28.14 
 
 		 267 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1122  ABC-2 type transporter  25.52 
 
 		 285 aa  70.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408605  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3547  ABC-2 type transporter  27.49 
 
 		 259 aa  70.9  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.369986 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1459  ABC-2 type transporter  28.35 
 
 		 249 aa  71.2  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2221  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  27.06 
 
 		 273 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000454003  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.49 
 
 		 254 aa  70.9  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.05 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1839  ABC-2 type transporter  26.7 
 
 		 266 aa  70.5  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0895  ABC-2 type transporter  28.52 
 
 		 266 aa  70.1  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2897  ABC-2 type transporter  27.12 
 
 		 274 aa  70.1  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.643507  normal  0.323486 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3922  ABC-2 type transporter  24.71 
 
 		 266 aa  69.7  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0348636  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1697  ABC-2 type transporter  23.36 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2499  ABC-2 transporter component  30.24 
 
 		 276 aa  69.3  0.00000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2261  ABC-2 type transporter  25.7 
 
 		 260 aa  68.9  0.00000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.121091  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>