More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1533 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1533  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 274 aa  543  1e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0121  ABC-2 type transporter  79.68 
 
 		 252 aa  358  4e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0240531  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3408  ABC-2 type transporter, permease protein  42.46 
 
 		 243 aa  199  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184246  normal  0.618546 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0786  ABC-2 type transporter  43.87 
 
 		 254 aa  198  9e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.585621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2409  ABC-2 type transporter  41.37 
 
 		 253 aa  177  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3247  ABC-2 type transporter  41.5 
 
 		 254 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.590775 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1730  hypothetical protein  36.18 
 
 		 251 aa  152  5e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.45161 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1448  ABC-2 type transporter  35.57 
 
 		 251 aa  145  6e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0318973  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4200  ABC-2 type transporter  43.11 
 
 		 275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1123  ABC-2 type transporter  33.48 
 
 		 257 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3137  ABC-2 type transporter  34.65 
 
 		 277 aa  138  7e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.428202  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1448  putative ABC transporter transmembrane protein  34 
 
 		 252 aa  129  6e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1958  ABC-2 type transporter  33.06 
 
 		 250 aa  126  5e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00055396  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1775  ABC transporter related protein  36.8 
 
 		 249 aa  126  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.254288 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3882  ABC-2 type transporter  30.86 
 
 		 278 aa  123  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0966  ABC-2 type transporter  31.88 
 
 		 259 aa  122  5e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0096  ABC-2 type transporter  35.48 
 
 		 247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4170  ABC-2 type transporter  32.55 
 
 		 270 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0014  ABC-2 type transporter  30.15 
 
 		 304 aa  111  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0062  ABC-2 type transporter  26.85 
 
 		 260 aa  99.4  5e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566487  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0497  ABC-2 type transporter  29.03 
 
 		 286 aa  98.6  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4106  ABC-2 type transporter  30.59 
 
 		 293 aa  93.2  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  29.63 
 
 		 251 aa  92.8  5e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3547  ABC-2 type transporter  28.63 
 
 		 259 aa  91.7  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.369986 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  30.7 
 
 		 250 aa  90.5  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6126  ABC-2 type transporter  32.86 
 
 		 275 aa  90.5  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0365687  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0230  ABC-2 type transporter  28.4 
 
 		 256 aa  89.7  4e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23570  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  28.81 
 
 		 267 aa  88.2  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.24456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  29.41 
 
 		 288 aa  86.3  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  28.07 
 
 		 253 aa  86.3  6e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.64 
 
 		 255 aa  85.9  7e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0666  ABC-2 type transporter  25.29 
 
 		 285 aa  84  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0426  ABC-2 type transporter  24.8 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1483  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 269 aa  84  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00140227  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  27.15 
 
 		 270 aa  84.7  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5103  ABC-2 type transporter  27.76 
 
 		 281 aa  83.6  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00233057  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1839  ABC-2 type transporter  28.44 
 
 		 266 aa  83.2  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2775  ABC-2 type transporter  31.65 
 
 		 278 aa  82.8  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00783625  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.91 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.72 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07250  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  26.58 
 
 		 265 aa  82.4  0.000000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.307058 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.29 
 
 		 253 aa  82.4  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1755  ABC-2 type transporter  29.02 
 
 		 264 aa  81.6  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.586856  decreased coverage  0.00328589 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0476  ABC transporter  27.8 
 
 		 261 aa  82  0.00000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0918062 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6250  ABC-2 type transporter  26.05 
 
 		 285 aa  80.9  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0340  ABC-2 type transporter  26.09 
 
 		 273 aa  81.3  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.171685  hitchhiker  0.00234396 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1622  ABC-2 type transporter  23.28 
 
 		 278 aa  80.9  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1122  ABC-2 type transporter  25.71 
 
 		 285 aa  81.3  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25.82 
 
 		 253 aa  80.5  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  25.23 
 
 		 261 aa  80.1  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000233601  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2021  hypothetical protein  25.32 
 
 		 289 aa  80.1  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.290119  normal  0.988573 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.29 
 
 		 253 aa  80.5  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1478  ABC-2 type transporter  25.23 
 
 		 254 aa  78.2  0.0000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0538  ABC-2 type transporter  25.56 
 
 		 267 aa  78.2  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.690834  hitchhiker  0.000010786 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1380  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25.11 
 
 		 256 aa  78.2  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000932687  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0042  ABC-2 type transporter  24.14 
 
 		 266 aa  78.2  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1426  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25.11 
 
 		 256 aa  77.4  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0562869  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3328  ABC-2 type transporter  27.43 
 
 		 281 aa  77.4  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.45338  normal  0.334159 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.42 
 
 		 254 aa  77  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4031  ABC-2 type transporter  28.46 
 
 		 289 aa  77  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.246164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39010  ABC-type multidrug transport system, permease component  25.97 
 
 		 271 aa  75.9  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.436846 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  25.81 
 
 		 269 aa  75.5  0.0000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0918  ABC-2 type transporter  25.51 
 
 		 254 aa  75.5  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4056  ABC-2 type transporter  27.45 
 
 		 267 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0393  ABC-2 type transporter  27.39 
 
 		 274 aa  74.7  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3922  ABC-2 type transporter  26.39 
 
 		 266 aa  74.7  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0348636  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1766  multidrug ABC transporter, permease protein  25.51 
 
 		 242 aa  74.7  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4023  ABC-2 type transporter  27.45 
 
 		 267 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.293949  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2250  ABC-2 type transporter  27.6 
 
 		 256 aa  75.1  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.239998  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0363  ABC-2 type transporter  22.3 
 
 		 289 aa  75.1  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.21 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1342  ABC-2 type transporter  29.03 
 
 		 279 aa  74.3  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.333729  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3916  ABC transporter, inner membrane subunit  27.45 
 
 		 267 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0937  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 269 aa  74.3  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1459  ABC-2 type transporter  28.71 
 
 		 249 aa  74.3  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  29.11 
 
 		 254 aa  73.9  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0746  ABC-2 type transporter  26.99 
 
 		 280 aa  73.6  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  24.01 
 
 		 290 aa  73.6  0.000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1170  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  23.56 
 
 		 253 aa  73.6  0.000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30730  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  25.21 
 
 		 277 aa  72.8  0.000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.364162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2013  ABC-2 type transporter  25.82 
 
 		 256 aa  72.4  0.000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.0000119274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1528  hypothetical protein  25 
 
 		 249 aa  72  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1236  ABC-2 type transporter  27.75 
 
 		 281 aa  71.6  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1034  ABC-2 type transporter  25.82 
 
 		 256 aa  72  0.00000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.150436 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2065  ABC-2 type transporter  25.39 
 
 		 254 aa  71.6  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0251  ABC-2 type transporter  24.29 
 
 		 255 aa  71.6  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.452318 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0192  hypothetical protein  29.83 
 
 		 295 aa  71.2  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.144906 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1125  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.52 
 
 		 260 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.742933  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0176  hypothetical protein  25.14 
 
 		 241 aa  70.5  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.67071  normal  0.0449558 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3103  ABC transporter protein  27.03 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849207 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05051  putative multidrug efflux ABC transporter  24.58 
 
 		 274 aa  70.5  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.507008  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0449  putative multidrug efflux ABC transporter  25.52 
 
 		 274 aa  69.7  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.603097  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1079  ABC-2 type transporter  26.73 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2221  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  23.72 
 
 		 273 aa  69.7  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000454003  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0300  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 		 270 aa  69.3  0.00000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4551  ABC-2 type transporter  27.54 
 
 		 264 aa  69.3  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1525  ABC-2 type transporter  26.39 
 
 		 290 aa  69.3  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00118323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04741  putative multidrug efflux ABC transporter  24.35 
 
 		 274 aa  69.3  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0380  ABC-2 type transporter  28.07 
 
 		 280 aa  68.6  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3861  ABC-2 type transporter  27.52 
 
 		 291 aa  68.6  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.92497  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>