More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1342 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_1342  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 279 aa  538  9.999999999999999e-153  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.333729  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4106  ABC-2 type transporter  46.79 
 
 		 293 aa  241  1e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0497  ABC-2 type transporter  45.52 
 
 		 286 aa  231  1e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0014  ABC-2 type transporter  41.81 
 
 		 304 aa  213  3.9999999999999995e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0966  ABC-2 type transporter  32.08 
 
 		 259 aa  102  8e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1122  ABC-2 type transporter  28.64 
 
 		 285 aa  95.1  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0340  ABC-2 type transporter  30.54 
 
 		 273 aa  92.8  6e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.171685  hitchhiker  0.00234396 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  30.49 
 
 		 270 aa  92  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  27.07 
 
 		 261 aa  88.2  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000233601  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18340  ABC-type multidrug transport system, permease component  33.68 
 
 		 282 aa  88.6  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.823039 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1123  ABC-2 type transporter  31.33 
 
 		 275 aa  87.8  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1683  ABC-2 type transporter  30.9 
 
 		 274 aa  87.8  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000181652  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1123  ABC-2 type transporter  28.71 
 
 		 257 aa  87.4  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0666  ABC-2 type transporter  29.96 
 
 		 285 aa  87  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  31.02 
 
 		 269 aa  86.7  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1839  ABC-2 type transporter  29.17 
 
 		 266 aa  84  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2250  ABC-2 type transporter  27.91 
 
 		 256 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.239998  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4656  ABC-2 type transporter  29.63 
 
 		 285 aa  80.5  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.890125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2021  hypothetical protein  30.52 
 
 		 289 aa  80.5  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.290119  normal  0.988573 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1483  ABC-2 type transporter  27.71 
 
 		 269 aa  80.5  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00140227  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23570  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  26.32 
 
 		 267 aa  80.5  0.00000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.24456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39010  ABC-type multidrug transport system, permease component  32.35 
 
 		 271 aa  79.7  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.436846 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0786  ABC-2 type transporter  30.04 
 
 		 254 aa  79  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.585621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5259  ABC-2 type transporter  27.92 
 
 		 277 aa  78.2  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0538  ABC-2 type transporter  28.83 
 
 		 267 aa  77.4  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.690834  hitchhiker  0.000010786 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3103  ABC transporter protein  32.28 
 
 		 280 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849207 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1478  ABC-2 type transporter  24.54 
 
 		 254 aa  78.2  0.0000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2775  ABC-2 type transporter  28.7 
 
 		 278 aa  78.2  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00783625  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0937  ABC-2 type transporter  29.15 
 
 		 269 aa  77  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0918  ABC-2 type transporter  27.73 
 
 		 254 aa  77.4  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0062  ABC-2 type transporter  26.29 
 
 		 260 aa  76.3  0.0000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566487  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1697  ABC-2 type transporter  29.44 
 
 		 271 aa  75.5  0.0000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6126  ABC-2 type transporter  31.22 
 
 		 275 aa  75.5  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0365687  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6787  ABC-2 type transporter  29.68 
 
 		 268 aa  75.5  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000212784  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0393  ABC-2 type transporter  27.8 
 
 		 274 aa  74.3  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3986  ABC-2 type transporter  28.64 
 
 		 280 aa  73.9  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5588  ABC-2 type transporter  29.05 
 
 		 261 aa  73.9  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6250  ABC-2 type transporter  28.64 
 
 		 285 aa  73.9  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1448  ABC-2 type transporter  28.7 
 
 		 251 aa  73.2  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0318973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1561  ABC-2 type transporter  27.65 
 
 		 252 aa  73.2  0.000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.403911  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1476  ABC-2 type transporter  25.83 
 
 		 267 aa  72.8  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2897  ABC-2 type transporter  30.93 
 
 		 274 aa  73.2  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.643507  normal  0.323486 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1755  ABC-2 type transporter  28.91 
 
 		 264 aa  72.8  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.586856  decreased coverage  0.00328589 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3922  ABC-2 type transporter  27.84 
 
 		 266 aa  72.8  0.000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0348636  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  24.23 
 
 		 254 aa  72.4  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1622  ABC-2 type transporter  27.31 
 
 		 278 aa  72.4  0.000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4023  ABC-2 type transporter  28.92 
 
 		 267 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.293949  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0476  ABC transporter  25.78 
 
 		 261 aa  71.6  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0918062 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4056  ABC-2 type transporter  28.92 
 
 		 267 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3916  ABC transporter, inner membrane subunit  28.92 
 
 		 267 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0039  ABC-2 type transporter  28.5 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0723  ABC-2 type transporter  27.31 
 
 		 272 aa  71.2  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0756908 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25 
 
 		 254 aa  70.9  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3137  ABC-2 type transporter  26.47 
 
 		 277 aa  70.9  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.428202  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1878  ABC-2 type transporter  28.1 
 
 		 273 aa  70.5  0.00000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0426  ABC-2 type transporter  27.07 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.06 
 
 		 253 aa  70.5  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0674  ABC-2 type transporter  24.8 
 
 		 272 aa  70.1  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0121  ABC-2 type transporter  34.57 
 
 		 252 aa  70.1  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0240531  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1281  ABC transporter, permease protein  26.99 
 
 		 267 aa  69.7  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.640698  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  27.46 
 
 		 253 aa  69.7  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3893  ABC-2 type transporter  26.64 
 
 		 242 aa  69.3  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0012751  normal  0.0102027 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07250  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  29.63 
 
 		 265 aa  69.3  0.00000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.307058 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0096  ABC-2 type transporter  27.56 
 
 		 247 aa  69.3  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0363  ABC-2 type transporter  26.79 
 
 		 289 aa  69.3  0.00000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.47 
 
 		 253 aa  68.9  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2716  ABC-2 type transporter  29.3 
 
 		 254 aa  68.9  0.00000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1533  ABC-2 type transporter  29.03 
 
 		 274 aa  68.9  0.00000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3132  ABC-2 type transporter  27.63 
 
 		 248 aa  68.6  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.571081  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1426  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.97 
 
 		 256 aa  68.6  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0562869  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35420  ABC-type multidrug transport system, permease component  27.91 
 
 		 257 aa  68.6  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3253  ABC transporter related  25.62 
 
 		 265 aa  68.9  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00665342  normal  0.245763 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1351  ABC-2 type transporter  28.35 
 
 		 272 aa  67.8  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0414359  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3101  ABC-2 type transporter  29.82 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0030  ABC-2 type transporter  28.11 
 
 		 272 aa  67.8  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3518  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 298 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1352  ABC-2 type transporter  30.61 
 
 		 254 aa  67  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.137638  normal  0.090478 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2588  ABC-2 type transporter  28.71 
 
 		 298 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3718  ABC-2 type transporter  29.73 
 
 		 260 aa  67  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282288  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.17 
 
 		 253 aa  67.4  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0746  ABC-2 type transporter  26.42 
 
 		 280 aa  66.6  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25.86 
 
 		 255 aa  67  0.0000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2939  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 286 aa  66.6  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.27677 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1937  ABC-2 type transporter  24.66 
 
 		 284 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.008119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0618  ABC-2 type transporter  25.47 
 
 		 267 aa  67  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.099686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1380  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.86 
 
 		 256 aa  66.6  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000932687  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19160  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  27.86 
 
 		 319 aa  66.2  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.338631 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2409  ABC-2 type transporter  29.46 
 
 		 253 aa  66.2  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  27.14 
 
 		 290 aa  65.9  0.0000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  24 
 
 		 251 aa  65.9  0.0000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4183  ABC-2 type transporter  26.58 
 
 		 269 aa  65.9  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0058  ABC-2 type transporter  26.32 
 
 		 271 aa  65.1  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4081  ABC-2 type transporter  25.93 
 
 		 274 aa  64.7  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.431533 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0242  ABC-2 type transporter  23.91 
 
 		 278 aa  65.1  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4936  ABC-2 type transporter  26.48 
 
 		 280 aa  64.7  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.707728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1203  ABC-2 type transporter  28.77 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0595438 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3882  ABC-2 type transporter  29 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1170  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  23.76 
 
 		 253 aa  64.3  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4873  ABC-2 type transporter  28.69 
 
 		 298 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.57 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>