More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3247 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3247  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 254 aa  491  9.999999999999999e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.590775 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0786  ABC-2 type transporter  47.04 
 
 		 254 aa  221  9e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.585621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2409  ABC-2 type transporter  42.69 
 
 		 253 aa  192  6e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1533  ABC-2 type transporter  41.5 
 
 		 274 aa  177  1e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1730  hypothetical protein  37.35 
 
 		 251 aa  151  8.999999999999999e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.45161 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3408  ABC-2 type transporter, permease protein  35.32 
 
 		 243 aa  146  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184246  normal  0.618546 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0121  ABC-2 type transporter  40.32 
 
 		 252 aa  142  7e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0240531  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4200  ABC-2 type transporter  41.99 
 
 		 275 aa  135  4e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1958  ABC-2 type transporter  35.18 
 
 		 250 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00055396  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3882  ABC-2 type transporter  35.56 
 
 		 278 aa  133  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1448  ABC-2 type transporter  34.43 
 
 		 251 aa  130  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0318973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3137  ABC-2 type transporter  35.45 
 
 		 277 aa  129  7.000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.428202  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0096  ABC-2 type transporter  38.25 
 
 		 247 aa  128  7.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1775  ABC transporter related protein  38.15 
 
 		 249 aa  125  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.254288 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1448  putative ABC transporter transmembrane protein  34.58 
 
 		 252 aa  113  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1123  ABC-2 type transporter  32.34 
 
 		 257 aa  110  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4170  ABC-2 type transporter  34.85 
 
 		 270 aa  104  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0966  ABC-2 type transporter  30 
 
 		 259 aa  102  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0918  ABC-2 type transporter  31.06 
 
 		 254 aa  94.4  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0497  ABC-2 type transporter  31.02 
 
 		 286 aa  92.8  5e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  30.57 
 
 		 270 aa  89.4  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0014  ABC-2 type transporter  31.2 
 
 		 304 aa  88.6  8e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.51 
 
 		 249 aa  87.8  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1839  ABC-2 type transporter  28.64 
 
 		 266 aa  87.4  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0062  ABC-2 type transporter  25.69 
 
 		 260 aa  87.4  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566487  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1483  ABC-2 type transporter  27.71 
 
 		 269 aa  85.5  7e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00140227  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1459  ABC-2 type transporter  30.49 
 
 		 249 aa  84  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4106  ABC-2 type transporter  28.96 
 
 		 293 aa  84  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.86 
 
 		 255 aa  83.2  0.000000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  28.96 
 
 		 269 aa  82.4  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.38 
 
 		 249 aa  82.4  0.000000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1528  hypothetical protein  27.6 
 
 		 249 aa  82  0.000000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.06 
 
 		 249 aa  82  0.000000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3547  ABC-2 type transporter  27.39 
 
 		 259 aa  78.6  0.00000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.369986 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8873  ABC-2 type transporter  28.12 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.53633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2561  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.51 
 
 		 249 aa  77  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0476  ABC transporter  26.7 
 
 		 261 aa  75.9  0.0000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0918062 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0666  ABC-2 type transporter  28.83 
 
 		 285 aa  75.9  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23570  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  28.88 
 
 		 267 aa  74.7  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.24456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1478  ABC-2 type transporter  25.99 
 
 		 254 aa  74.7  0.000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19160  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  28.05 
 
 		 319 aa  74.3  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.338631 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  23.29 
 
 		 250 aa  73.6  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3922  ABC-2 type transporter  29.82 
 
 		 266 aa  72.8  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0348636  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1170  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.19 
 
 		 253 aa  72.4  0.000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5259  ABC-2 type transporter  25.82 
 
 		 277 aa  72.4  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0375  ABC-2 type transporter  26.92 
 
 		 264 aa  72  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133292  hitchhiker  0.00534901 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1380  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.48 
 
 		 256 aa  71.2  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000932687  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1426  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.48 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0562869  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0538  ABC-2 type transporter  29.07 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.690834  hitchhiker  0.000010786 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18340  ABC-type multidrug transport system, permease component  27.82 
 
 		 282 aa  71.2  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.823039 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0937  ABC-2 type transporter  26.91 
 
 		 269 aa  70.1  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  23.08 
 
 		 251 aa  70.5  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1079  ABC-2 type transporter  28.76 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1622  ABC-2 type transporter  27.49 
 
 		 278 aa  70.1  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39010  ABC-type multidrug transport system, permease component  28.51 
 
 		 271 aa  69.3  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.436846 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0039  ABC-2 type transporter  28.12 
 
 		 267 aa  69.3  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0300  ABC-2 type transporter  26.42 
 
 		 270 aa  68.9  0.00000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1683  ABC-2 type transporter  28.91 
 
 		 274 aa  68.6  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000181652  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  26.67 
 
 		 254 aa  68.6  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6126  ABC-2 type transporter  26.51 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0365687  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0230  ABC-2 type transporter  25.94 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3132  ABC-2 type transporter  28.02 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.571081  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2298  daunorubicin resistance ABC transporter membrane protein  24.89 
 
 		 264 aa  67.4  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.207913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0380  ABC-2 type transporter  26.92 
 
 		 280 aa  67.8  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5081  ABC transporter related protein  27.5 
 
 		 260 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.630665  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0340  ABC-2 type transporter  28.81 
 
 		 273 aa  67.8  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.171685  hitchhiker  0.00234396 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2016  ABC-2 type transporter  27.2 
 
 		 268 aa  66.6  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0251  ABC-2 type transporter  26.16 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.452318 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1351  ABC-2 type transporter  27.16 
 
 		 272 aa  66.6  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0414359  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24940  ABC-type multidrug transport system, permease component  28.32 
 
 		 284 aa  66.6  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.484855 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1034  ABC-2 type transporter  27.03 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.489208  normal  0.0976555 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  25.88 
 
 		 288 aa  66.2  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1123  ABC-2 type transporter  26.82 
 
 		 275 aa  65.9  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2716  ABC-2 type transporter  28.51 
 
 		 254 aa  65.9  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4183  ABC-2 type transporter  30.32 
 
 		 269 aa  65.9  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1937  ABC-2 type transporter  23.77 
 
 		 284 aa  65.9  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.008119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0426  ABC-2 type transporter  25.12 
 
 		 256 aa  65.5  0.0000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.22 
 
 		 253 aa  65.1  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  23.36 
 
 		 254 aa  65.1  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.22 
 
 		 253 aa  64.7  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0449  putative multidrug efflux ABC transporter  27.27 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.603097  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2328  transporter, putative  24.64 
 
 		 246 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.117528  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05051  putative multidrug efflux ABC transporter  27.73 
 
 		 274 aa  64.3  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.507008  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1203  ABC-2 type transporter  25.2 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0595438 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04741  putative multidrug efflux ABC transporter  27.27 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.22 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1525  ABC-2 type transporter  28.51 
 
 		 290 aa  63.9  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00118323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0363  ABC-2 type transporter  23.17 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  25.11 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07250  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  28.26 
 
 		 265 aa  62.4  0.000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.307058 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3261  ABC-2 type transporter  24.54 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0215  ABC-2 type transporter  25.58 
 
 		 275 aa  62.4  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.716105  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0192  hypothetical protein  27.8 
 
 		 295 aa  62.4  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.144906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1384  ABC-2 type transporter  24.8 
 
 		 269 aa  62.4  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78336  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4739  ABC-2 type transporter  27.33 
 
 		 285 aa  62.4  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0213  ABC transporter permease  27.17 
 
 		 257 aa  62  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4761  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 261 aa  62  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000109025  hitchhiker  0.000621886 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3861  ABC-2 type transporter  28.32 
 
 		 291 aa  62  0.000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.92497  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  25.61 
 
 		 284 aa  62  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1766  multidrug ABC transporter, permease protein  25.69 
 
 		 242 aa  61.6  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>