More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3261 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_3261  ABC-2 type transporter  100 
 
 
249 aa  484  1e-136  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3849  ABC-2 type transporter  47.76 
 
 
252 aa  212  3.9999999999999995e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0062  ABC-2 type transporter  29.36 
 
 
260 aa  105  6e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566487  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0497  ABC-2 type transporter  27.68 
 
 
286 aa  90.9  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.51 
 
 
254 aa  87.8  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1122  ABC-2 type transporter  27.75 
 
 
285 aa  86.7  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408605  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1123  ABC-2 type transporter  28.64 
 
 
257 aa  85.9  6e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4106  ABC-2 type transporter  28.95 
 
 
293 aa  85.5  8e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2588  ABC-2 type transporter  30.62 
 
 
298 aa  83.2  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3518  ABC-2 type transporter  30.62 
 
 
298 aa  83.2  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2056  ABC-2 type transporter  27.92 
 
 
241 aa  83.2  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.794734  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1203  ABC-2 type transporter  28.95 
 
 
251 aa  82  0.000000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0595438 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1766  multidrug ABC transporter, permease protein  27.67 
 
 
242 aa  81.6  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  29.3 
 
 
250 aa  80.5  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  28.64 
 
 
253 aa  79.7  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0427  ABC-2 type transporter  24.63 
 
 
278 aa  79.3  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.469533  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1861  ABC-2 type transporter  26.22 
 
 
258 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0476  ABC transporter  25.12 
 
 
261 aa  75.5  0.0000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0918062 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0380  ABC-2 type transporter  23.83 
 
 
280 aa  74.7  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5103  ABC-2 type transporter  25.91 
 
 
281 aa  74.7  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00233057  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0300  ABC-2 type transporter  28.24 
 
 
270 aa  74.3  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2328  transporter, putative  29.89 
 
 
246 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.117528  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4873  ABC-2 type transporter  27.75 
 
 
298 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2515  ABC transporter, permease protein  23.38 
 
 
278 aa  72.8  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35420  ABC-type multidrug transport system, permease component  26.47 
 
 
257 aa  72.8  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0014  ABC-2 type transporter  26.18 
 
 
304 aa  72.8  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0242  ABC-2 type transporter  27.59 
 
 
278 aa  72.4  0.000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1206  ABC-2 type transporter  25.3 
 
 
243 aa  72  0.000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1459  ABC-2 type transporter  32.51 
 
 
249 aa  71.6  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  30.95 
 
 
251 aa  71.2  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0176  hypothetical protein  24.69 
 
 
241 aa  70.5  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.67071  normal  0.0449558 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  23.72 
 
 
253 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4656  ABC-2 type transporter  26.54 
 
 
285 aa  70.1  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.890125  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1528  hypothetical protein  31.56 
 
 
249 aa  70.1  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2794  hypothetical protein  26.09 
 
 
276 aa  70.1  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0995371 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1478  ABC-2 type transporter  24.77 
 
 
254 aa  70.5  0.00000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05121  putative multidrug efflux ABC transporter  26.37 
 
 
274 aa  70.1  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0449  putative multidrug efflux ABC transporter  27.23 
 
 
274 aa  69.7  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.603097  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2021  hypothetical protein  27.01 
 
 
289 aa  70.1  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.290119  normal  0.988573 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1622  ABC-2 type transporter  25 
 
 
278 aa  69.7  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6250  ABC-2 type transporter  26.79 
 
 
285 aa  69.7  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243116  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05051  putative multidrug efflux ABC transporter  27.23 
 
 
274 aa  70.1  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.507008  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  25.82 
 
 
290 aa  69.3  0.00000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04741  putative multidrug efflux ABC transporter  26.73 
 
 
274 aa  69.3  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0042  ABC-2 type transporter  24.3 
 
 
266 aa  68.9  0.00000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2298  daunorubicin resistance ABC transporter membrane protein  28.43 
 
 
264 aa  69.3  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.207913  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1504  ABC-2 type transporter  24.06 
 
 
272 aa  68.9  0.00000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.457097  normal  0.179064 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1561  ABC-2 type transporter  25.51 
 
 
252 aa  68.9  0.00000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.403911  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.57 
 
 
249 aa  68.6  0.00000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  23.5 
 
 
253 aa  67.8  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2043  ABC-2 type transporter  28.16 
 
 
279 aa  68.2  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.167343  hitchhiker  0.00685853 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3882  ABC-2 type transporter  23.7 
 
 
278 aa  68.2  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2561  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.27 
 
 
249 aa  68.2  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3861  ABC-2 type transporter  24.64 
 
 
291 aa  67  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.92497  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2897  ABC-2 type transporter  24.29 
 
 
274 aa  67  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.643507  normal  0.323486 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  26 
 
 
288 aa  67.4  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1342  ABC-2 type transporter  24.2 
 
 
279 aa  67  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.333729  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2250  ABC-2 type transporter  25.98 
 
 
256 aa  67  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.239998  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8158  ABC-2 type transporter  25.13 
 
 
272 aa  67  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.880228 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3893  ABC-2 type transporter  26.05 
 
 
242 aa  66.2  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0012751  normal  0.0102027 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  23.96 
 
 
253 aa  66.2  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0393  ABC-2 type transporter  24.31 
 
 
274 aa  66.6  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0215  ABC-2 type transporter  26.12 
 
 
275 aa  66.2  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.716105  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1750  putative multidrug efflux ABC transporter  27.14 
 
 
277 aa  66.2  0.0000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0190039  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0096  ABC-2 type transporter  22.07 
 
 
247 aa  65.9  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3137  ABC-2 type transporter  20.74 
 
 
277 aa  65.9  0.0000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.428202  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0340  ABC-2 type transporter  24.15 
 
 
273 aa  65.9  0.0000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.171685  hitchhiker  0.00234396 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0542  ABC-2 type transporter  24.18 
 
 
253 aa  65.5  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1448  putative ABC transporter transmembrane protein  22.86 
 
 
252 aa  64.7  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  24.75 
 
 
261 aa  64.7  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000233601  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0746  ABC-2 type transporter  26.46 
 
 
280 aa  64.7  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27 
 
 
249 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1894  putative daunorubicin resistance ABC transporter, permease protein  26.72 
 
 
260 aa  64.3  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00976323  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0192  hypothetical protein  23.72 
 
 
295 aa  63.9  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.144906 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6787  ABC-2 type transporter  24.19 
 
 
268 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000212784  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04481  putative multidrug efflux ABC transporter  27.86 
 
 
284 aa  63.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.86864  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2221  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  28.23 
 
 
273 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000454003  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0426  ABC-2 type transporter  26.58 
 
 
256 aa  63.9  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0037  ABC-2 type transporter  23.11 
 
 
255 aa  63.9  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  26.19 
 
 
284 aa  63.9  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2326  ABC-2 type transporter  26.75 
 
 
253 aa  64.3  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23570  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  24.88 
 
 
267 aa  63.9  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.24456  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2587  ABC multidrug efflux transporter, inner membrane subunit  23.47 
 
 
286 aa  63.9  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30730  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  25.64 
 
 
277 aa  63.5  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.364162  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0786  ABC-2 type transporter  26.32 
 
 
254 aa  63.2  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.585621  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1245  ABC-2 type transporter  23.47 
 
 
292 aa  63.5  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0464218  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0251  ABC-2 type transporter  30.09 
 
 
255 aa  63.2  0.000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.452318 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24940  ABC-type multidrug transport system, permease component  24.64 
 
 
284 aa  63.2  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.484855 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2939  ABC-2 type transporter  25.25 
 
 
286 aa  63.2  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.27677 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2499  ABC-2 transporter component  26.12 
 
 
276 aa  63.2  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1351  ABC-2 type transporter  25.6 
 
 
272 aa  63.2  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0414359  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0025  ABC-2 type transporter  24.53 
 
 
290 aa  63.2  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0959  ABC-2 type transporter  23.89 
 
 
256 aa  62.8  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00197586  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0685  ABC transporter, permease protein  21.85 
 
 
277 aa  62.4  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.537478  normal  0.14182 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1079  ABC-2 type transporter  26.7 
 
 
296 aa  62.4  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0375  ABC-2 type transporter  26.82 
 
 
264 aa  62.8  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133292  hitchhiker  0.00534901 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5948  ABC transporter permease  22.73 
 
 
284 aa  62.4  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0673459  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3328  ABC-2 type transporter  29.13 
 
 
281 aa  62.4  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.45338  normal  0.334159 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22030  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  26.67 
 
 
281 aa  62.4  0.000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0559  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.44 
 
 
264 aa  62  0.000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>