More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0785 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  100 
 
 
253 aa  497  1e-140  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  94.86 
 
 
253 aa  478  1e-134  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  94.86 
 
 
253 aa  478  1e-134  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1170  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  81.03 
 
 
253 aa  422  1e-117  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1380  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  57.03 
 
 
256 aa  288  6e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000932687  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1426  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  57.03 
 
 
256 aa  287  1e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0562869  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  54.51 
 
 
255 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  38.25 
 
 
249 aa  177  1e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  36.11 
 
 
249 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  38.1 
 
 
249 aa  172  5e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0426  ABC-2 type transporter  37.15 
 
 
256 aa  170  2e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  38.43 
 
 
250 aa  167  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2561  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  39.04 
 
 
249 aa  165  5e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  37.33 
 
 
253 aa  160  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1528  hypothetical protein  37.35 
 
 
249 aa  160  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2298  daunorubicin resistance ABC transporter membrane protein  38.99 
 
 
264 aa  158  7e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.207913  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  32.64 
 
 
254 aa  158  8e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  39.29 
 
 
288 aa  157  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0037  ABC-2 type transporter  34.55 
 
 
255 aa  158  1e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  36.33 
 
 
254 aa  156  4e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1459  ABC-2 type transporter  37.25 
 
 
249 aa  154  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  32.24 
 
 
251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  29.37 
 
 
284 aa  144  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0300  ABC-2 type transporter  31.92 
 
 
270 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5103  ABC-2 type transporter  33.78 
 
 
281 aa  138  7.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00233057  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2893  ABC-2 type transporter  32.3 
 
 
270 aa  138  8.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0062  ABC-2 type transporter  28.74 
 
 
260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566487  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0559  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  36.49 
 
 
264 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1125  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  34.68 
 
 
260 aa  133  3e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.742933  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0242  ABC-2 type transporter  32.23 
 
 
278 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1478  ABC-2 type transporter  34.68 
 
 
254 aa  128  1.0000000000000001e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1766  multidrug ABC transporter, permease protein  31.02 
 
 
242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4031  ABC-2 type transporter  29.92 
 
 
289 aa  125  9e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.246164  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0476  ABC transporter  29.13 
 
 
261 aa  125  9e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0918062 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0363  ABC-2 type transporter  29.28 
 
 
289 aa  124  1e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  31.8 
 
 
290 aa  124  2e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2221  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  33.48 
 
 
273 aa  123  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000454003  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0380  ABC-2 type transporter  31.86 
 
 
280 aa  123  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0427  ABC-2 type transporter  28.37 
 
 
278 aa  123  3e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.469533  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1203  ABC-2 type transporter  28.05 
 
 
251 aa  122  8e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0595438 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2250  ABC-2 type transporter  29.75 
 
 
256 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.239998  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0685  ABC transporter, permease protein  30.18 
 
 
277 aa  118  7.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.537478  normal  0.14182 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2056  ABC-2 type transporter  28.34 
 
 
241 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.794734  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  32.21 
 
 
261 aa  111  9e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000233601  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4739  ABC-2 type transporter  32.71 
 
 
285 aa  111  9e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2515  ABC transporter, permease protein  30.3 
 
 
278 aa  110  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0176  hypothetical protein  29.27 
 
 
241 aa  108  8.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.67071  normal  0.0449558 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0215  ABC-2 type transporter  32.57 
 
 
275 aa  108  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.716105  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1123  ABC-2 type transporter  31.72 
 
 
257 aa  106  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2499  ABC-2 transporter component  34.29 
 
 
276 aa  106  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0014  ABC-2 type transporter  30.38 
 
 
304 aa  103  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2794  hypothetical protein  27.66 
 
 
276 aa  103  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0995371 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1750  putative multidrug efflux ABC transporter  35.02 
 
 
277 aa  103  3e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0190039  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1561  ABC-2 type transporter  29.09 
 
 
252 aa  101  1e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.403911  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05051  putative multidrug efflux ABC transporter  36.41 
 
 
274 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.507008  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04741  putative multidrug efflux ABC transporter  35.94 
 
 
274 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2833  ABC transporter, inner membrane subunit  28.4 
 
 
258 aa  99.8  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0251  ABC-2 type transporter  29.73 
 
 
255 aa  99  6e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.452318 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0449  putative multidrug efflux ABC transporter  35.94 
 
 
274 aa  99  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.603097  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05121  putative multidrug efflux ABC transporter  35.48 
 
 
274 aa  96.7  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4873  ABC-2 type transporter  33.8 
 
 
298 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2588  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 
298 aa  95.5  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03454  hypothetical protein  27.95 
 
 
256 aa  95.5  7e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0849  ABC-type multidrug transport system, permease component  26.4 
 
 
254 aa  95.5  7e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.227676  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3518  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 
298 aa  95.5  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04481  putative multidrug efflux ABC transporter  33.94 
 
 
284 aa  95.1  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.86864  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0497  ABC-2 type transporter  28.11 
 
 
286 aa  94.7  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3861  ABC-2 type transporter  29.44 
 
 
291 aa  93.6  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.92497  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0652  hypothetical protein  26.59 
 
 
256 aa  92.8  4e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1012  ABC transporter, permease protein  25 
 
 
257 aa  92.4  6e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000447992  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1142  ABC transporter permease protein  25 
 
 
257 aa  92.4  6e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0101435  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0287  hypothetical protein  27.57 
 
 
241 aa  92  7e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.301015  normal  0.184502 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1448  putative ABC transporter transmembrane protein  27.98 
 
 
252 aa  92  8e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3137  ABC-2 type transporter  30 
 
 
277 aa  92  8e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.428202  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1079  ABC-2 type transporter  31.34 
 
 
296 aa  92  8e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2261  ABC-2 type transporter  26.83 
 
 
260 aa  91.7  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.121091  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4106  ABC-2 type transporter  24.18 
 
 
293 aa  91.3  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0666  ABC-2 type transporter  29.62 
 
 
262 aa  91.3  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.700678  normal  0.206902 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0723  ABC-2 type transporter  26.19 
 
 
256 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3588  ABC-2 type transporter  26.19 
 
 
256 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0782802  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3711  ABC-2 type transporter  26.19 
 
 
256 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3519  ABC-2 type transporter  26.19 
 
 
256 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.238751  normal  0.0167423 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2613  ABC-2 type transporter  25.71 
 
 
270 aa  90.5  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.937981  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0831  ABC-2 type transporter  26.19 
 
 
256 aa  90.9  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3801  ABC transporter, permease protein  26.59 
 
 
256 aa  90.1  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0192  hypothetical protein  29.44 
 
 
295 aa  90.1  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.144906 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2149  ABC-2 type transport system permease protein  32.52 
 
 
286 aa  90.1  3e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.157353 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0230  ABC-2 type transporter  26.17 
 
 
256 aa  89.7  4e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3408  ABC-2 type transporter, permease protein  26.02 
 
 
243 aa  89.7  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184246  normal  0.618546 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3231  ABC-2 type transporter  25.79 
 
 
256 aa  89.7  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0786  ABC-2 type transporter  28.97 
 
 
254 aa  89  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.585621  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002558  ABC-type multidrug transport system permease component  26.88 
 
 
256 aa  89  6e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.644442  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1471  ABC-2 type transporter  24.28 
 
 
259 aa  89  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3931  ABC-2 type transporter  26.58 
 
 
263 aa  89  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.284935  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0824  ABC-2 type transporter  27.35 
 
 
256 aa  89.4  6e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0795  ABC-2 type transporter  27.35 
 
 
256 aa  89.4  6e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2137  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 
257 aa  89  7e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0672016  normal  0.103113 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0121  putative permease  26.48 
 
 
256 aa  89  7e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4575  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  30.77 
 
 
370 aa  88.6  8e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.745541  normal  0.326628 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3143  ABC-2 type transporter  26.92 
 
 
256 aa  88.6  8e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>