More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1775 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1775  ABC transporter related protein  100 
 
 		 249 aa  476  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.254288 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2409  ABC-2 type transporter  43.6 
 
 		 253 aa  168  7e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0786  ABC-2 type transporter  40.32 
 
 		 254 aa  167  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.585621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3247  ABC-2 type transporter  38.15 
 
 		 254 aa  149  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.590775 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3137  ABC-2 type transporter  40.36 
 
 		 277 aa  148  8e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.428202  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0096  ABC-2 type transporter  40.16 
 
 		 247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1533  ABC-2 type transporter  36.8 
 
 		 274 aa  145  4.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1730  hypothetical protein  35.89 
 
 		 251 aa  145  6e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.45161 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1958  ABC-2 type transporter  38.53 
 
 		 250 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00055396  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3882  ABC-2 type transporter  39.58 
 
 		 278 aa  136  4e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0121  ABC-2 type transporter  39.66 
 
 		 252 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0240531  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1448  ABC-2 type transporter  35.56 
 
 		 251 aa  126  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0318973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3408  ABC-2 type transporter, permease protein  34.15 
 
 		 243 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184246  normal  0.618546 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0966  ABC-2 type transporter  33.93 
 
 		 259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4200  ABC-2 type transporter  38.21 
 
 		 275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4170  ABC-2 type transporter  40.66 
 
 		 270 aa  119  6e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1448  putative ABC transporter transmembrane protein  36.36 
 
 		 252 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1123  ABC-2 type transporter  30.09 
 
 		 257 aa  112  5e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0014  ABC-2 type transporter  29.06 
 
 		 304 aa  95.1  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0062  ABC-2 type transporter  29.66 
 
 		 260 aa  92  9e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566487  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23570  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  30.22 
 
 		 267 aa  90.9  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.24456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4106  ABC-2 type transporter  29.81 
 
 		 293 aa  89.7  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3547  ABC-2 type transporter  32.44 
 
 		 259 aa  88.2  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.369986 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1683  ABC-2 type transporter  33.46 
 
 		 274 aa  87  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000181652  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0476  ABC transporter  26.18 
 
 		 261 aa  85.1  9e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0918062 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  31.05 
 
 		 254 aa  85.1  9e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0497  ABC-2 type transporter  27.09 
 
 		 286 aa  84.7  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0340  ABC-2 type transporter  28.1 
 
 		 273 aa  84.3  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.171685  hitchhiker  0.00234396 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  27.47 
 
 		 261 aa  80.9  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000233601  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1478  ABC-2 type transporter  25.79 
 
 		 254 aa  80.5  0.00000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2221  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  30.15 
 
 		 273 aa  80.1  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000454003  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.76 
 
 		 255 aa  80.5  0.00000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2775  ABC-2 type transporter  28.24 
 
 		 278 aa  79.3  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00783625  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  27.6 
 
 		 250 aa  79  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  26.45 
 
 		 270 aa  77  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  30.5 
 
 		 251 aa  77  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0559  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  31.61 
 
 		 264 aa  76.6  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  30 
 
 		 253 aa  75.9  0.0000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3861  ABC-2 type transporter  31.07 
 
 		 291 aa  75.5  0.0000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.92497  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0300  ABC-2 type transporter  29.7 
 
 		 270 aa  75.1  0.0000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0192  hypothetical protein  30.54 
 
 		 295 aa  75.1  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.144906 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1426  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.65 
 
 		 256 aa  74.7  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0562869  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1380  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.65 
 
 		 256 aa  74.7  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000932687  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  28.99 
 
 		 269 aa  74.3  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  33.55 
 
 		 249 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.94 
 
 		 253 aa  74.3  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4551  ABC-2 type transporter  29.22 
 
 		 264 aa  74.3  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6126  ABC-2 type transporter  32.06 
 
 		 275 aa  73.2  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0365687  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.94 
 
 		 253 aa  72.8  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0666  ABC-2 type transporter  31.14 
 
 		 285 aa  72.4  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1483  ABC-2 type transporter  26.01 
 
 		 269 aa  72  0.000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00140227  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  31.22 
 
 		 288 aa  72  0.000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1766  multidrug ABC transporter, permease protein  26.97 
 
 		 242 aa  71.6  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2588  ABC-2 type transporter  28 
 
 		 298 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3518  ABC-2 type transporter  28 
 
 		 298 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.74 
 
 		 253 aa  71.6  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2250  ABC-2 type transporter  28.17 
 
 		 256 aa  71.6  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.239998  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4031  ABC-2 type transporter  28.51 
 
 		 289 aa  71.6  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.246164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2298  daunorubicin resistance ABC transporter membrane protein  31.31 
 
 		 264 aa  70.9  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.207913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0393  ABC-2 type transporter  28.17 
 
 		 274 aa  70.5  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1203  ABC-2 type transporter  29.02 
 
 		 251 aa  70.1  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0595438 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6787  ABC-2 type transporter  27.85 
 
 		 268 aa  70.1  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000212784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2043  ABC-2 type transporter  26.02 
 
 		 279 aa  70.1  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.167343  hitchhiker  0.00685853 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  30.21 
 
 		 284 aa  70.1  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1528  hypothetical protein  29.44 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0042  ABC-2 type transporter  27.82 
 
 		 266 aa  69.7  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1561  ABC-2 type transporter  28.7 
 
 		 252 aa  70.1  0.00000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.403911  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0746  ABC-2 type transporter  31 
 
 		 280 aa  69.7  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  27.2 
 
 		 290 aa  69.3  0.00000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4936  ABC-2 type transporter  27.14 
 
 		 280 aa  69.3  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.707728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05121  putative multidrug efflux ABC transporter  28.84 
 
 		 274 aa  69.3  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05051  putative multidrug efflux ABC transporter  28.91 
 
 		 274 aa  69.3  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.507008  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0449  putative multidrug efflux ABC transporter  28.91 
 
 		 274 aa  68.9  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.603097  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2716  ABC-2 type transporter  31.67 
 
 		 254 aa  68.9  0.00000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06471  putative multidrug efflux ABC transporter  31.53 
 
 		 284 aa  68.6  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.620136 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04741  putative multidrug efflux ABC transporter  28.91 
 
 		 274 aa  68.6  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1122  ABC-2 type transporter  28.81 
 
 		 285 aa  68.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1342  ABC-2 type transporter  28.22 
 
 		 279 aa  67.8  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.333729  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1079  ABC-2 type transporter  28.85 
 
 		 296 aa  66.6  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0251  ABC-2 type transporter  26.56 
 
 		 255 aa  67  0.0000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.452318 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0363  ABC-2 type transporter  29.82 
 
 		 289 aa  67  0.0000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.1 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2294  ABC-2 type transporter  28.93 
 
 		 277 aa  66.6  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.911135  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6375  ABC-2 type transporter  25.97 
 
 		 247 aa  66.2  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1236  ABC-2 type transporter  25.33 
 
 		 281 aa  66.2  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1170  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.38 
 
 		 253 aa  65.9  0.0000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0215  ABC-2 type transporter  31.15 
 
 		 275 aa  65.9  0.0000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.716105  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30730  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  25 
 
 		 277 aa  65.9  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.364162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0037  ABC-2 type transporter  28.12 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0538  ABC-2 type transporter  25.71 
 
 		 267 aa  65.9  0.0000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.690834  hitchhiker  0.000010786 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3328  ABC-2 type transporter  28.77 
 
 		 281 aa  65.5  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.45338  normal  0.334159 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2561  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.57 
 
 		 249 aa  65.5  0.0000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1351  ABC-2 type transporter  28.37 
 
 		 272 aa  65.5  0.0000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0414359  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1697  ABC-2 type transporter  26.96 
 
 		 271 aa  65.5  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04481  putative multidrug efflux ABC transporter  29.82 
 
 		 284 aa  65.5  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.86864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5103  ABC-2 type transporter  28.23 
 
 		 281 aa  65.1  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00233057  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1750  putative multidrug efflux ABC transporter  30.49 
 
 		 277 aa  64.7  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0190039  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0612  putative multidrug efflux ABC transporter  30.43 
 
 		 284 aa  64.7  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35420  ABC-type multidrug transport system, permease component  27.23 
 
 		 257 aa  65.1  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1622  ABC-2 type transporter  26.11 
 
 		 278 aa  65.1  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>