More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3245 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 250 aa  489  1e-137  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  50.2 
 
 		 249 aa  259  3e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  48.79 
 
 		 249 aa  257  1e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  50 
 
 		 249 aa  257  1e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1528  hypothetical protein  50.4 
 
 		 249 aa  244  8e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2561  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  52.42 
 
 		 249 aa  241  7.999999999999999e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  48.61 
 
 		 253 aa  236  2e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0037  ABC-2 type transporter  48.16 
 
 		 255 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1459  ABC-2 type transporter  49.19 
 
 		 249 aa  224  9e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  41.53 
 
 		 254 aa  202  3e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2298  daunorubicin resistance ABC transporter membrane protein  43.89 
 
 		 264 aa  199  3e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.207913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  42.86 
 
 		 254 aa  193  3e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  43.95 
 
 		 251 aa  191  8e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0559  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  43.24 
 
 		 264 aa  187  2e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0426  ABC-2 type transporter  40.64 
 
 		 256 aa  180  2e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0300  ABC-2 type transporter  42.06 
 
 		 270 aa  175  6e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  38.87 
 
 		 253 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  37.3 
 
 		 255 aa  169  3e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  40.93 
 
 		 284 aa  169  5e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1125  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  38.89 
 
 		 260 aa  168  8e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.742933  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4031  ABC-2 type transporter  41.86 
 
 		 289 aa  167  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.246164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  38.43 
 
 		 253 aa  167  2e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  37.7 
 
 		 253 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1170  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  36.48 
 
 		 253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1426  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  38.59 
 
 		 256 aa  161  1e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0562869  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1380  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  38.59 
 
 		 256 aa  161  1e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000932687  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  38.53 
 
 		 288 aa  158  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2221  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  40.26 
 
 		 273 aa  155  6e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000454003  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5103  ABC-2 type transporter  37.26 
 
 		 281 aa  150  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00233057  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2893  ABC-2 type transporter  33.76 
 
 		 270 aa  150  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0062  ABC-2 type transporter  38.46 
 
 		 260 aa  144  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566487  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0476  ABC transporter  32.26 
 
 		 261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0918062 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2499  ABC-2 transporter component  39.62 
 
 		 276 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0215  ABC-2 type transporter  36.14 
 
 		 275 aa  134  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.716105  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0380  ABC-2 type transporter  34.6 
 
 		 280 aa  128  7.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2250  ABC-2 type transporter  34.35 
 
 		 256 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.239998  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0251  ABC-2 type transporter  32.95 
 
 		 255 aa  124  1e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.452318 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2328  transporter, putative  37.16 
 
 		 246 aa  123  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.117528  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1561  ABC-2 type transporter  33.19 
 
 		 252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.403911  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  34.35 
 
 		 261 aa  118  7e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000233601  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0242  ABC-2 type transporter  29.96 
 
 		 278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0427  ABC-2 type transporter  29.44 
 
 		 278 aa  116  3e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.469533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0899  ABC transporter, inner membrane subunit  34.84 
 
 		 287 aa  115  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.208954  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0950  ABC-2 type transporter  34.39 
 
 		 288 aa  112  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0948  ABC-2 type transporter  34.39 
 
 		 287 aa  112  6e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0389515  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1861  ABC-2 type transporter  32.23 
 
 		 258 aa  112  6e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0685  ABC transporter, permease protein  29.37 
 
 		 277 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.537478  normal  0.14182 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2515  ABC transporter, permease protein  31.82 
 
 		 278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1203  ABC-2 type transporter  33.65 
 
 		 251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0595438 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4739  ABC-2 type transporter  32.57 
 
 		 285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0945  ABC transporter related  35.44 
 
 		 665 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2613  ABC-2 type transporter  31.08 
 
 		 270 aa  110  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.937981  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1789  ABC-2 type transporter  35.09 
 
 		 261 aa  109  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1478  ABC-2 type transporter  30.2 
 
 		 254 aa  109  4.0000000000000004e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1796  ABC-2 type transporter  30.14 
 
 		 280 aa  108  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000116393 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1766  multidrug ABC transporter, permease protein  26.61 
 
 		 242 aa  107  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1239  hypothetical protein  45.54 
 
 		 126 aa  107  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0798004 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0230  ABC-2 type transporter  29.41 
 
 		 256 aa  106  3e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1894  putative daunorubicin resistance ABC transporter, permease protein  30.74 
 
 		 260 aa  105  5e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00976323  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2794  hypothetical protein  31.19 
 
 		 276 aa  105  5e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0995371 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2171  ABC-2 type transporter  30.45 
 
 		 256 aa  105  6e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  28.46 
 
 		 290 aa  103  3e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0363  ABC-2 type transporter  28.36 
 
 		 289 aa  102  5e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3931  ABC-2 type transporter  29.03 
 
 		 263 aa  102  8e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.284935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2261  ABC-2 type transporter  30.33 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.121091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0025  ABC-2 type transporter  28.31 
 
 		 290 aa  100  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3036  ABC-2 type transporter  29.09 
 
 		 295 aa  97.1  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2845  ABC-2 type transporter  30.51 
 
 		 269 aa  97.8  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0354167  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1245  ABC-2 type transporter  31.67 
 
 		 292 aa  97.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0464218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2587  ABC multidrug efflux transporter, inner membrane subunit  31.67 
 
 		 286 aa  96.7  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1851  ABC-2 type transporter  27.73 
 
 		 297 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.894723 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0010  ABC-2 type transporter  27.43 
 
 		 280 aa  97.1  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2056  ABC-2 type transporter  29.91 
 
 		 241 aa  96.7  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.794734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2186  ABC-2 type transporter  27.73 
 
 		 297 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.189047 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5948  ABC transporter permease  29.55 
 
 		 284 aa  96.3  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0673459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5312  ABC-2 type transporter  28.37 
 
 		 292 aa  95.9  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.91396  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4106  ABC-2 type transporter  31.3 
 
 		 293 aa  96.3  5e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1802  ABC-2 type transporter  28.37 
 
 		 293 aa  95.9  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217297  normal  0.454939 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0176  hypothetical protein  28.71 
 
 		 241 aa  95.5  7e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.67071  normal  0.0449558 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0030  ABC-2 type transporter  29.41 
 
 		 272 aa  95.5  7e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2667  ABC transporter  29.22 
 
 		 263 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0137793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0249  hypothetical protein  28.31 
 
 		 281 aa  95.1  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_002936  DET0411  putative NodJ  31.12 
 
 		 255 aa  95.1  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_354  ABC-2 type transport system, permease protein  31.12 
 
 		 255 aa  94.7  1e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.216034  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5008  ABC-2 type transporter  28.44 
 
 		 290 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0701746  normal  0.113041 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0723  ABC-2 type transporter  30.09 
 
 		 272 aa  94.7  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0756908 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0014  ABC-2 type transporter  30.49 
 
 		 304 aa  94.4  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3136  ABC-2 type transporter  27.57 
 
 		 263 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1123  ABC-2 type transporter  30.28 
 
 		 257 aa  93.6  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2716  ABC-2 type transporter  27.78 
 
 		 297 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.722099  normal  0.404026 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1936  ABC-2 type transporter  30.77 
 
 		 286 aa  94  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3096  ABC-2 type transporter  29.22 
 
 		 263 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2013  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 256 aa  93.2  4e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.0000119274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1034  ABC-2 type transporter  28.12 
 
 		 256 aa  92.4  5e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.150436 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2588  ABC-2 type transporter  33 
 
 		 298 aa  92  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3518  ABC-2 type transporter  33 
 
 		 298 aa  92  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2668  putative ABC-2 type transporter  29.46 
 
 		 263 aa  91.7  9e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.149875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05051  putative multidrug efflux ABC transporter  28.23 
 
 		 274 aa  90.9  2e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.507008  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2251  putative ABC transport system, membrane protein  32.89 
 
 		 246 aa  90.5  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.713684  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2056  ABC-2 type transporter, permease protein  32.89 
 
 		 246 aa  90.5  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>