More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1958 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1958  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 250 aa  479  1e-134  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00055396  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1730  hypothetical protein  47.37 
 
 		 251 aa  193  3e-48  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.45161 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0786  ABC-2 type transporter  35.69 
 
 		 254 aa  150  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.585621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2409  ABC-2 type transporter  35.55 
 
 		 253 aa  134  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3137  ABC-2 type transporter  39.21 
 
 		 277 aa  128  8.000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.428202  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3247  ABC-2 type transporter  35.18 
 
 		 254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.590775 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1533  ABC-2 type transporter  33.06 
 
 		 274 aa  122  4e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3882  ABC-2 type transporter  33.07 
 
 		 278 aa  117  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4200  ABC-2 type transporter  39.81 
 
 		 275 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1775  ABC transporter related protein  38.53 
 
 		 249 aa  112  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.254288 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0096  ABC-2 type transporter  35.81 
 
 		 247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1448  putative ABC transporter transmembrane protein  37.56 
 
 		 252 aa  110  3e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1448  ABC-2 type transporter  30 
 
 		 251 aa  110  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0318973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0121  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 252 aa  109  5e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0240531  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4170  ABC-2 type transporter  38.36 
 
 		 270 aa  105  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3408  ABC-2 type transporter, permease protein  34.26 
 
 		 243 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184246  normal  0.618546 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1123  ABC-2 type transporter  30.77 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0966  ABC-2 type transporter  34.29 
 
 		 259 aa  99.8  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1384  ABC-2 type transporter  29.08 
 
 		 269 aa  95.9  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23570  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  31.06 
 
 		 267 aa  94.7  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.24456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0042  ABC-2 type transporter  26.23 
 
 		 266 aa  93.6  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0340  ABC-2 type transporter  30.37 
 
 		 273 aa  93.2  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.171685  hitchhiker  0.00234396 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2021  hypothetical protein  26.58 
 
 		 289 aa  85.9  6e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.290119  normal  0.988573 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0918  ABC-2 type transporter  29.06 
 
 		 254 aa  85.1  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1122  ABC-2 type transporter  24.05 
 
 		 285 aa  84.7  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4656  ABC-2 type transporter  24.3 
 
 		 285 aa  82.8  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.890125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5259  ABC-2 type transporter  25.3 
 
 		 277 aa  79  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6250  ABC-2 type transporter  24.78 
 
 		 285 aa  78.6  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243116  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0393  ABC-2 type transporter  26.79 
 
 		 274 aa  78.6  0.00000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4551  ABC-2 type transporter  28.97 
 
 		 264 aa  78.2  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1504  ABC-2 type transporter  27.16 
 
 		 272 aa  77.8  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.457097  normal  0.179064 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1755  ABC-2 type transporter  31.09 
 
 		 264 aa  77.4  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.586856  decreased coverage  0.00328589 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1937  ABC-2 type transporter  28.44 
 
 		 284 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.008119  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3103  ABC transporter protein  25.1 
 
 		 280 aa  75.9  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849207 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3861  ABC-2 type transporter  30.04 
 
 		 291 aa  74.7  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.92497  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0666  ABC-2 type transporter  30.18 
 
 		 285 aa  74.7  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0014  ABC-2 type transporter  26.41 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35420  ABC-type multidrug transport system, permease component  26.59 
 
 		 257 aa  74.7  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1766  multidrug ABC transporter, permease protein  28.9 
 
 		 242 aa  73.9  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1622  ABC-2 type transporter  23.29 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1683  ABC-2 type transporter  32.27 
 
 		 274 aa  73.9  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000181652  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0538  ABC-2 type transporter  26.85 
 
 		 267 aa  74.3  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.690834  hitchhiker  0.000010786 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4106  ABC-2 type transporter  26.85 
 
 		 293 aa  74.3  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3547  ABC-2 type transporter  29 
 
 		 259 aa  73.6  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.369986 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1351  ABC-2 type transporter  26.19 
 
 		 272 aa  72.8  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0414359  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0451  ABC-type multidrug transport system, permease component  25.48 
 
 		 269 aa  72  0.000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0034336  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2775  ABC-2 type transporter  25.73 
 
 		 278 aa  72  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00783625  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8158  ABC-2 type transporter  28.18 
 
 		 272 aa  72  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.880228 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1352  ABC-2 type transporter  29.6 
 
 		 254 aa  71.6  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.137638  normal  0.090478 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  27.2 
 
 		 270 aa  71.6  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0497  ABC-2 type transporter  24.54 
 
 		 286 aa  71.6  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0192  hypothetical protein  28.25 
 
 		 295 aa  70.5  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.144906 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1750  putative multidrug efflux ABC transporter  30.49 
 
 		 277 aa  71.2  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0190039  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1380  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.57 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000932687  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0062  ABC-2 type transporter  23.81 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566487  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4873  ABC-2 type transporter  29.02 
 
 		 298 aa  69.7  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0937  ABC-2 type transporter  27.06 
 
 		 269 aa  70.1  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2716  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 254 aa  69.3  0.00000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1483  ABC-2 type transporter  28.7 
 
 		 269 aa  69.3  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00140227  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4795  ABC-2 type transporter  26.15 
 
 		 284 aa  69.3  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597944 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0746  ABC-2 type transporter  25.93 
 
 		 280 aa  69.3  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1426  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.57 
 
 		 256 aa  68.9  0.00000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0562869  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2065  ABC-2 type transporter  28.63 
 
 		 254 aa  68.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1079  ABC-2 type transporter  31.16 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2897  ABC-2 type transporter  25.69 
 
 		 274 aa  68.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.643507  normal  0.323486 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3239  ABC transporter efflux permease  28.06 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1839  ABC-2 type transporter  27.78 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18340  ABC-type multidrug transport system, permease component  27.98 
 
 		 282 aa  67.4  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.823039 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3492  ABC transporter permease  28.06 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.799548  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3453  ABC transporter, efflux permease protein  28.06 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2939  ABC-2 type transporter  27.93 
 
 		 286 aa  67.4  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.27677 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3893  ABC-2 type transporter  23.85 
 
 		 242 aa  67.8  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0012751  normal  0.0102027 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  26.07 
 
 		 269 aa  66.6  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1476  ABC-2 type transporter  24.12 
 
 		 267 aa  67  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0176  hypothetical protein  24.69 
 
 		 241 aa  66.6  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.67071  normal  0.0449558 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2016  ABC-2 type transporter  26.88 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1743  ABC-2 type transporter  26.53 
 
 		 271 aa  66.2  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000246748 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1478  ABC-2 type transporter  27.32 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0375  ABC-2 type transporter  29.27 
 
 		 264 aa  65.9  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133292  hitchhiker  0.00534901 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0449  putative multidrug efflux ABC transporter  28.18 
 
 		 274 aa  65.5  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.603097  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24940  ABC-type multidrug transport system, permease component  28.5 
 
 		 284 aa  65.5  0.0000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.484855 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1264  ABC-2 type transporter  30.16 
 
 		 244 aa  65.5  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.351658  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0230  ABC-2 type transporter  23.83 
 
 		 256 aa  65.5  0.0000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4259  ABC-2 type transporter  27.1 
 
 		 282 aa  65.1  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573247  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3101  ABC-2 type transporter  23.74 
 
 		 266 aa  65.5  0.0000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4345  ABC-2 type transporter  27.1 
 
 		 282 aa  65.1  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0911686 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4638  ABC-2 type transporter  27.1 
 
 		 282 aa  65.1  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.619797  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3149  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  28.94 
 
 		 249 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0286068  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3922  ABC-2 type transporter  26.94 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0348636  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1170  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  23.39 
 
 		 253 aa  64.3  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4023  ABC-2 type transporter  24.59 
 
 		 267 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.293949  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3467  ABC transporter, efflux permease protein  28.94 
 
 		 249 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000810233  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1203  ABC-2 type transporter  25.48 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0595438 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6787  ABC-2 type transporter  28.77 
 
 		 268 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000212784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  25.24 
 
 		 251 aa  63.9  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4056  ABC-2 type transporter  24.59 
 
 		 267 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1697  ABC-2 type transporter  23.58 
 
 		 271 aa  63.9  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4936  ABC-2 type transporter  25.57 
 
 		 280 aa  63.9  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.707728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3916  ABC transporter, inner membrane subunit  24.59 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04741  putative multidrug efflux ABC transporter  27.73 
 
 		 274 aa  63.5  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>