More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1755 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1755  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 264 aa  497  1e-140  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.586856  decreased coverage  0.00328589 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0340  ABC-2 type transporter  36.9 
 
 		 273 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.171685  hitchhiker  0.00234396 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0918  ABC-2 type transporter  36.8 
 
 		 254 aa  126  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  37.1 
 
 		 269 aa  119  3e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6787  ABC-2 type transporter  34.73 
 
 		 268 aa  118  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000212784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  35.45 
 
 		 270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0497  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 286 aa  116  3e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5259  ABC-2 type transporter  32.89 
 
 		 277 aa  112  5e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23570  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  29.73 
 
 		 267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.24456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2775  ABC-2 type transporter  30.29 
 
 		 278 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00783625  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4106  ABC-2 type transporter  30.93 
 
 		 293 aa  107  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0014  ABC-2 type transporter  32.85 
 
 		 304 aa  107  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0937  ABC-2 type transporter  33.85 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2021  hypothetical protein  32.02 
 
 		 289 aa  106  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.290119  normal  0.988573 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2716  ABC-2 type transporter  32.11 
 
 		 254 aa  106  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0654  ABC-2 type transporter  35.75 
 
 		 270 aa  105  6e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.122619  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0666  ABC-2 type transporter  33.2 
 
 		 285 aa  104  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1683  ABC-2 type transporter  33.61 
 
 		 274 aa  104  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000181652  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3388  ABC-2 type transporter  35.14 
 
 		 282 aa  103  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.264053 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4551  ABC-2 type transporter  32.71 
 
 		 264 aa  102  6e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0655  ABC-2 type transporter  33.08 
 
 		 273 aa  102  6e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.121363  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4023  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 267 aa  102  7e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.293949  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4056  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 267 aa  102  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1937  ABC-2 type transporter  31.01 
 
 		 284 aa  102  7e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.008119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4183  ABC-2 type transporter  33.63 
 
 		 269 aa  102  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1122  ABC-2 type transporter  27.02 
 
 		 285 aa  101  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3121  multidrug ABC transporter inner membrane protein  32.74 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.656441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30730  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  33.03 
 
 		 277 aa  101  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.364162  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2897  ABC-2 type transporter  33.46 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.643507  normal  0.323486 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3916  ABC transporter, inner membrane subunit  32.89 
 
 		 267 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4328  ABC-2 type transporter  37.39 
 
 		 259 aa  100  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0393  ABC-2 type transporter  32.46 
 
 		 274 aa  100  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2294  ABC-2 type transporter  35.75 
 
 		 277 aa  100  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.911135  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3132  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 248 aa  99.8  4e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.571081  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3737  ABC-2 type transporter  29.31 
 
 		 294 aa  99.8  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0746  ABC-2 type transporter  33.81 
 
 		 280 aa  99.8  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1351  ABC-2 type transporter  31.78 
 
 		 272 aa  99.8  5e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0414359  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3736  ABC-2 type transporter  32.7 
 
 		 263 aa  99  6e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3328  ABC-2 type transporter  33.76 
 
 		 281 aa  99  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.45338  normal  0.334159 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1352  ABC-2 type transporter  32.94 
 
 		 254 aa  98.2  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.137638  normal  0.090478 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1622  ABC-2 type transporter  27.52 
 
 		 278 aa  97.4  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3103  ABC transporter protein  32.57 
 
 		 280 aa  97.4  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849207 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4656  ABC-2 type transporter  29.48 
 
 		 285 aa  96.7  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.890125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2939  ABC-2 type transporter  29.3 
 
 		 286 aa  96.3  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.27677 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0674  ABC-2 type transporter  33.06 
 
 		 272 aa  96.3  5e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19160  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  34.31 
 
 		 319 aa  95.9  6e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.338631 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3922  ABC-2 type transporter  29.3 
 
 		 266 aa  95.5  8e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0348636  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1384  ABC-2 type transporter  31.85 
 
 		 269 aa  95.5  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0895  ABC-2 type transporter  32.77 
 
 		 266 aa  95.1  9e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8158  ABC-2 type transporter  31.91 
 
 		 272 aa  94.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.880228 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6250  ABC-2 type transporter  30.04 
 
 		 285 aa  93.6  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0042  ABC-2 type transporter  29.57 
 
 		 266 aa  93.6  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1483  ABC-2 type transporter  34.39 
 
 		 269 aa  93.6  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00140227  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4795  ABC-2 type transporter  31.4 
 
 		 284 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597944 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4383  ABC-2 type transporter  30.16 
 
 		 253 aa  93.6  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2830  ABC transporter, DrrB efflux protein  31.73 
 
 		 269 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.578929  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1839  ABC-2 type transporter  29.62 
 
 		 266 aa  93.2  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2874  multidrug ABC transporter inner membrane protein  31.73 
 
 		 269 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.189586 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2859  multidrug ABC transporter inner membrane protein  31.73 
 
 		 269 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.464408  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1525  ABC-2 type transporter  39.04 
 
 		 290 aa  92.8  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00118323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4936  ABC-2 type transporter  28.41 
 
 		 280 aa  92.4  7e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.707728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4259  ABC-2 type transporter  30.65 
 
 		 282 aa  92.4  7e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4345  ABC-2 type transporter  30.65 
 
 		 282 aa  92.4  7e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0911686 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4638  ABC-2 type transporter  30.65 
 
 		 282 aa  92.4  7e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.619797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12952  daunorubicin-dim-transport integral membrane protein ABC transporter drrC  34.68 
 
 		 276 aa  92.4  7e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0375  ABC-2 type transporter  34.91 
 
 		 264 aa  92  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133292  hitchhiker  0.00534901 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4081  ABC-2 type transporter  30.73 
 
 		 274 aa  92  9e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.431533 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0039  ABC-2 type transporter  31.31 
 
 		 267 aa  92  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0058  ABC-2 type transporter  29.46 
 
 		 271 aa  91.7  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1504  ABC-2 type transporter  27.82 
 
 		 272 aa  91.7  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.457097  normal  0.179064 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35420  ABC-type multidrug transport system, permease component  31.15 
 
 		 257 aa  91.3  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1123  ABC-2 type transporter  35.44 
 
 		 257 aa  91.3  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4512  ABC-2 type transporter  28.89 
 
 		 281 aa  91.3  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22030  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  32.06 
 
 		 281 aa  90.5  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0538  ABC-2 type transporter  30.77 
 
 		 267 aa  89.4  5e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.690834  hitchhiker  0.000010786 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1236  ABC-2 type transporter  33.64 
 
 		 281 aa  89  7e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3986  ABC-2 type transporter  34.67 
 
 		 280 aa  89  7e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3239  ABC transporter efflux permease  27.92 
 
 		 249 aa  89  8e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3492  ABC transporter permease  27.92 
 
 		 249 aa  89  8e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.799548  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3453  ABC transporter, efflux permease protein  27.92 
 
 		 249 aa  89  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3467  ABC transporter, efflux permease protein  28.15 
 
 		 249 aa  88.6  9e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000810233  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1966  ABC-2 type transporter  30.04 
 
 		 318 aa  88.6  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.115517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1697  ABC-2 type transporter  26.47 
 
 		 271 aa  87.4  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3149  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  27.73 
 
 		 249 aa  87  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0286068  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3387  multidrug ABC transporter inner membrane protein  30.62 
 
 		 281 aa  87  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.169242 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3718  ABC-2 type transporter  31.92 
 
 		 260 aa  86.7  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282288  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3166  ABC-2 type transporter  31.3 
 
 		 245 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.591825 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0542  ABC-2 type transporter  26.69 
 
 		 253 aa  86.3  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8873  ABC-2 type transporter  28.98 
 
 		 270 aa  85.9  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.53633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2829  daunorubicin resistance protein C  31.21 
 
 		 287 aa  85.9  6e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.212712  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2873  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit C  31.21 
 
 		 287 aa  85.9  6e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.716211  normal  0.118774 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2858  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit C  31.21 
 
 		 287 aa  85.9  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.375686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7215  ABC transporter (permease)  32.74 
 
 		 247 aa  85.5  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1034  ABC-2 type transporter  28.17 
 
 		 254 aa  85.5  8e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.489208  normal  0.0976555 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07250  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  26.79 
 
 		 265 aa  85.1  9e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.307058 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4874  ABC-2 type transporter  29.48 
 
 		 253 aa  85.5  9e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0328295 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2065  ABC-2 type transporter  34.8 
 
 		 254 aa  85.1  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1808  ABC transporter, efflux permease protein  26.58 
 
 		 249 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0121  ABC-2 type transporter  33.68 
 
 		 252 aa  85.1  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0240531  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1878  ABC-2 type transporter  33.04 
 
 		 273 aa  85.1  0.000000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>