More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0096 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0096  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 247 aa  479  1e-134  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3137  ABC-2 type transporter  71.07 
 
 		 277 aa  338  4e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.428202  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3882  ABC-2 type transporter  60.98 
 
 		 278 aa  294  9e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1448  putative ABC transporter transmembrane protein  57.44 
 
 		 252 aa  281  8.000000000000001e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1448  ABC-2 type transporter  54.55 
 
 		 251 aa  280  1e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0318973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4170  ABC-2 type transporter  56.38 
 
 		 270 aa  260  2e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4200  ABC-2 type transporter  48.55 
 
 		 275 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0786  ABC-2 type transporter  40.83 
 
 		 254 aa  137  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.585621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3408  ABC-2 type transporter, permease protein  33.06 
 
 		 243 aa  125  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184246  normal  0.618546 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1533  ABC-2 type transporter  34.29 
 
 		 274 aa  124  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1775  ABC transporter related protein  40.41 
 
 		 249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.254288 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3247  ABC-2 type transporter  37.93 
 
 		 254 aa  112  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.590775 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2409  ABC-2 type transporter  35.56 
 
 		 253 aa  109  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0121  ABC-2 type transporter  33.06 
 
 		 252 aa  108  8.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0240531  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0014  ABC-2 type transporter  32.33 
 
 		 304 aa  108  9.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1958  ABC-2 type transporter  32.65 
 
 		 250 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00055396  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1730  hypothetical protein  32.88 
 
 		 251 aa  103  3e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.45161 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0966  ABC-2 type transporter  35.14 
 
 		 259 aa  99.8  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4106  ABC-2 type transporter  31.62 
 
 		 293 aa  98.2  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  34.98 
 
 		 269 aa  97.4  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0497  ABC-2 type transporter  30.24 
 
 		 286 aa  97.1  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0937  ABC-2 type transporter  32.42 
 
 		 269 aa  93.6  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0062  ABC-2 type transporter  31.63 
 
 		 260 aa  90.1  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566487  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0746  ABC-2 type transporter  30.43 
 
 		 280 aa  86.3  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  31.08 
 
 		 270 aa  86.3  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1483  ABC-2 type transporter  28.25 
 
 		 269 aa  85.9  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00140227  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2775  ABC-2 type transporter  27.98 
 
 		 278 aa  84.7  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00783625  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1123  ABC-2 type transporter  29.92 
 
 		 257 aa  84  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18340  ABC-type multidrug transport system, permease component  31.6 
 
 		 282 aa  83.6  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.823039 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.28 
 
 		 253 aa  83.6  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4551  ABC-2 type transporter  29.74 
 
 		 264 aa  82.8  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1123  ABC-2 type transporter  31.34 
 
 		 275 aa  82.8  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.55 
 
 		 255 aa  82.8  0.000000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3547  ABC-2 type transporter  28.79 
 
 		 259 aa  82.4  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.369986 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1384  ABC-2 type transporter  28.8 
 
 		 269 aa  81.3  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4056  ABC-2 type transporter  28.05 
 
 		 267 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4023  ABC-2 type transporter  28.05 
 
 		 267 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.293949  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1426  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.28 
 
 		 256 aa  81.3  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0562869  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3916  ABC transporter, inner membrane subunit  28.05 
 
 		 267 aa  80.5  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 288 aa  80.5  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1380  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.28 
 
 		 256 aa  80.9  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000932687  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5103  ABC-2 type transporter  27.34 
 
 		 281 aa  80.5  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00233057  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1122  ABC-2 type transporter  26.42 
 
 		 285 aa  80.1  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0476  ABC transporter  26.89 
 
 		 261 aa  80.1  0.00000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0918062 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.67 
 
 		 254 aa  79.7  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23570  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  29.49 
 
 		 267 aa  79.7  0.00000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.24456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  32.14 
 
 		 253 aa  79.7  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2716  ABC-2 type transporter  29.67 
 
 		 254 aa  79.3  0.00000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.93 
 
 		 253 aa  79  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1203  ABC-2 type transporter  31.43 
 
 		 251 aa  77  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0595438 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.84 
 
 		 253 aa  77.8  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  28.64 
 
 		 251 aa  76.6  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0666  ABC-2 type transporter  29.87 
 
 		 285 aa  76.3  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2250  ABC-2 type transporter  28.85 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.239998  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3922  ABC-2 type transporter  27.63 
 
 		 266 aa  76.3  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0348636  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35420  ABC-type multidrug transport system, permease component  27.76 
 
 		 257 aa  75.9  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1766  multidrug ABC transporter, permease protein  27.57 
 
 		 242 aa  75.9  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1561  ABC-2 type transporter  27.63 
 
 		 252 aa  75.5  0.0000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.403911  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  29.49 
 
 		 280 aa  75.1  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0918  ABC-2 type transporter  28.11 
 
 		 254 aa  73.9  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  28.84 
 
 		 250 aa  73.6  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2939  ABC-2 type transporter  30.35 
 
 		 286 aa  73.6  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.27677 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0340  ABC-2 type transporter  28.63 
 
 		 273 aa  73.2  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.171685  hitchhiker  0.00234396 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4031  ABC-2 type transporter  27.95 
 
 		 289 aa  73.6  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.246164  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3861  ABC-2 type transporter  33.64 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.92497  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1878  ABC-2 type transporter  30.92 
 
 		 273 aa  73.2  0.000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0300  ABC-2 type transporter  28.5 
 
 		 270 aa  72  0.000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1966  ABC-2 type transporter  30.84 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.115517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2294  ABC-2 type transporter  29.8 
 
 		 277 aa  71.6  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.911135  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1697  ABC-2 type transporter  25.35 
 
 		 271 aa  71.6  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.3 
 
 		 249 aa  71.2  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0037  ABC-2 type transporter  27.91 
 
 		 255 aa  70.5  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  29.36 
 
 		 284 aa  70.9  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1459  ABC-2 type transporter  29.19 
 
 		 249 aa  70.5  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0192  hypothetical protein  32.71 
 
 		 295 aa  70.1  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.144906 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2021  hypothetical protein  23.36 
 
 		 289 aa  70.1  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.290119  normal  0.988573 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2367  hypothetical protein  33.99 
 
 		 370 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.175245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1743  ABC-2 type transporter  27.8 
 
 		 271 aa  70.1  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000246748 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0380  ABC-2 type transporter  27.49 
 
 		 280 aa  69.7  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0042  ABC-2 type transporter  27.23 
 
 		 266 aa  69.7  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  24.79 
 
 		 290 aa  69.7  0.00000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1839  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 266 aa  69.3  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1342  ABC-2 type transporter  27.48 
 
 		 279 aa  69.7  0.00000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.333729  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2298  daunorubicin resistance ABC transporter membrane protein  31.16 
 
 		 264 aa  69.3  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.207913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6250  ABC-2 type transporter  24.9 
 
 		 285 aa  68.9  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243116  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0393  ABC-2 type transporter  26.94 
 
 		 274 aa  69.3  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1937  ABC-2 type transporter  26.91 
 
 		 284 aa  68.9  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.008119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4936  ABC-2 type transporter  28.76 
 
 		 280 aa  68.9  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.707728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0559  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  31.31 
 
 		 264 aa  68.9  0.00000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6126  ABC-2 type transporter  29.15 
 
 		 275 aa  68.9  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0365687  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1683  ABC-2 type transporter  29.25 
 
 		 274 aa  68.9  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000181652  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2893  ABC-2 type transporter  24.03 
 
 		 270 aa  68.6  0.00000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  24.64 
 
 		 249 aa  68.6  0.00000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4656  ABC-2 type transporter  26.56 
 
 		 285 aa  67.8  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.890125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4873  ABC-2 type transporter  31.49 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1528  hypothetical protein  27.71 
 
 		 249 aa  68.2  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2056  ABC-2 type transporter  29.49 
 
 		 241 aa  68.2  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.794734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1170  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.61 
 
 		 253 aa  68.2  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2588  ABC-2 type transporter  33.17 
 
 		 298 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.38 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>