More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1448 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1448  putative ABC transporter transmembrane protein  100 
 
 		 252 aa  489  1e-137  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4170  ABC-2 type transporter  65.59 
 
 		 270 aa  308  5.9999999999999995e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3882  ABC-2 type transporter  59.27 
 
 		 278 aa  293  3e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3137  ABC-2 type transporter  58.3 
 
 		 277 aa  269  2.9999999999999997e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.428202  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0096  ABC-2 type transporter  57.44 
 
 		 247 aa  269  4e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1448  ABC-2 type transporter  52.44 
 
 		 251 aa  266  2.9999999999999995e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0318973  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4200  ABC-2 type transporter  46.79 
 
 		 275 aa  160  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0786  ABC-2 type transporter  36.21 
 
 		 254 aa  135  7.000000000000001e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.585621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3408  ABC-2 type transporter, permease protein  35.92 
 
 		 243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184246  normal  0.618546 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1533  ABC-2 type transporter  32 
 
 		 274 aa  119  4.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0014  ABC-2 type transporter  32.71 
 
 		 304 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1730  hypothetical protein  30.42 
 
 		 251 aa  109  5e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.45161 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1958  ABC-2 type transporter  37.56 
 
 		 250 aa  106  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00055396  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2409  ABC-2 type transporter  32.13 
 
 		 253 aa  106  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0121  ABC-2 type transporter  33.2 
 
 		 252 aa  105  5e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0240531  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4106  ABC-2 type transporter  33.8 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1123  ABC-2 type transporter  29.53 
 
 		 257 aa  98.6  8e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0497  ABC-2 type transporter  30 
 
 		 286 aa  97.8  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0062  ABC-2 type transporter  28.79 
 
 		 260 aa  97.8  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566487  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3247  ABC-2 type transporter  34.58 
 
 		 254 aa  97.1  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.590775 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0966  ABC-2 type transporter  31.05 
 
 		 259 aa  96.3  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1122  ABC-2 type transporter  27.92 
 
 		 285 aa  92.8  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.98 
 
 		 253 aa  92  8e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1775  ABC transporter related protein  36.54 
 
 		 249 aa  91.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.254288 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0476  ABC transporter  28.45 
 
 		 261 aa  90.9  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0918062 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  29.05 
 
 		 250 aa  89.4  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.98 
 
 		 253 aa  89  8e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1380  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.27 
 
 		 256 aa  88.2  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000932687  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1766  multidrug ABC transporter, permease protein  29.58 
 
 		 242 aa  88.2  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1426  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.27 
 
 		 256 aa  87.8  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0562869  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1170  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.4 
 
 		 253 aa  87.4  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  30.14 
 
 		 253 aa  87.8  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1561  ABC-2 type transporter  31.11 
 
 		 252 aa  86.7  3e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.403911  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4031  ABC-2 type transporter  32.52 
 
 		 289 aa  85.9  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.246164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.84 
 
 		 249 aa  86.3  5e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0746  ABC-2 type transporter  31.53 
 
 		 280 aa  85.9  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2250  ABC-2 type transporter  30.41 
 
 		 256 aa  85.5  7e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.239998  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.16 
 
 		 253 aa  85.5  7e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2716  ABC-2 type transporter  30.88 
 
 		 254 aa  85.1  9e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1966  ABC-2 type transporter  29.44 
 
 		 318 aa  84.7  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.115517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0340  ABC-2 type transporter  30.59 
 
 		 273 aa  85.1  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.171685  hitchhiker  0.00234396 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  28.37 
 
 		 288 aa  84  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6250  ABC-2 type transporter  25.42 
 
 		 285 aa  83.6  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2021  hypothetical protein  27.02 
 
 		 289 aa  83.6  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.290119  normal  0.988573 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1622  ABC-2 type transporter  24.57 
 
 		 278 aa  83.6  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0393  ABC-2 type transporter  28.4 
 
 		 274 aa  83.6  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1123  ABC-2 type transporter  29.49 
 
 		 275 aa  83.6  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4739  ABC-2 type transporter  31.36 
 
 		 285 aa  83.2  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  27.31 
 
 		 251 aa  83.2  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1483  ABC-2 type transporter  27.65 
 
 		 269 aa  83.2  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00140227  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  28.02 
 
 		 284 aa  82.8  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3103  ABC transporter protein  29.66 
 
 		 280 aa  82.4  0.000000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849207 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0037  ABC-2 type transporter  29.63 
 
 		 255 aa  82  0.000000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  30.05 
 
 		 269 aa  80.5  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.23 
 
 		 255 aa  80.9  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0380  ABC-2 type transporter  30.37 
 
 		 280 aa  80.1  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2939  ABC-2 type transporter  30.32 
 
 		 286 aa  80.1  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.27677 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1203  ABC-2 type transporter  26.48 
 
 		 251 aa  79  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0595438 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1697  ABC-2 type transporter  25.69 
 
 		 271 aa  78.6  0.00000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4551  ABC-2 type transporter  29.33 
 
 		 264 aa  78.6  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18340  ABC-type multidrug transport system, permease component  27.85 
 
 		 282 aa  78.6  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.823039 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0937  ABC-2 type transporter  27.48 
 
 		 269 aa  78.2  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0042  ABC-2 type transporter  27.19 
 
 		 266 aa  78.2  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3547  ABC-2 type transporter  28.94 
 
 		 259 aa  78.2  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.369986 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.91 
 
 		 249 aa  77.4  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0300  ABC-2 type transporter  27.88 
 
 		 270 aa  77.4  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1351  ABC-2 type transporter  27.04 
 
 		 272 aa  77  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0414359  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2775  ABC-2 type transporter  27.66 
 
 		 278 aa  76.6  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00783625  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35420  ABC-type multidrug transport system, permease component  28.23 
 
 		 257 aa  76.3  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30730  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  28.63 
 
 		 277 aa  76.6  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.364162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4936  ABC-2 type transporter  28.17 
 
 		 280 aa  76.6  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.707728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0666  ABC-2 type transporter  26.56 
 
 		 285 aa  75.9  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4656  ABC-2 type transporter  26.64 
 
 		 285 aa  75.9  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.890125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1459  ABC-2 type transporter  28.33 
 
 		 249 aa  75.5  0.0000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.44 
 
 		 254 aa  75.5  0.0000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0363  ABC-2 type transporter  24.31 
 
 		 289 aa  75.1  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  30.41 
 
 		 254 aa  74.7  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.32 
 
 		 249 aa  75.1  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  28.96 
 
 		 270 aa  74.7  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4092  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 290 aa  74.7  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0130357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0242  ABC-2 type transporter  27.43 
 
 		 278 aa  75.1  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1478  ABC-2 type transporter  26.64 
 
 		 254 aa  74.7  0.000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2294  ABC-2 type transporter  29.55 
 
 		 277 aa  75.1  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.911135  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4873  ABC-2 type transporter  30.63 
 
 		 298 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1528  hypothetical protein  26.05 
 
 		 249 aa  74.3  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3861  ABC-2 type transporter  29.49 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.92497  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2897  ABC-2 type transporter  27.03 
 
 		 274 aa  73.6  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.643507  normal  0.323486 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2056  ABC-2 type transporter  30.1 
 
 		 241 aa  73.6  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.794734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1079  ABC-2 type transporter  31.16 
 
 		 296 aa  73.6  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4056  ABC-2 type transporter  25.42 
 
 		 267 aa  72.8  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4023  ABC-2 type transporter  25.42 
 
 		 267 aa  72.8  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.293949  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6126  ABC-2 type transporter  28.64 
 
 		 275 aa  73.2  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0365687  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0685  ABC transporter, permease protein  24.66 
 
 		 277 aa  72.8  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.537478  normal  0.14182 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2794  hypothetical protein  27.23 
 
 		 276 aa  72.8  0.000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0995371 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3253  ABC transporter related  29.21 
 
 		 265 aa  72.8  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00665342  normal  0.245763 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1683  ABC-2 type transporter  29.03 
 
 		 274 aa  72.4  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000181652  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0192  hypothetical protein  29.3 
 
 		 295 aa  72.4  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.144906 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1236  ABC-2 type transporter  32.34 
 
 		 281 aa  72.4  0.000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1878  ABC-2 type transporter  30.41 
 
 		 273 aa  72.4  0.000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04481  putative multidrug efflux ABC transporter  28.06 
 
 		 284 aa  72  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.86864  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>