More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0062 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0062  ABC-2 type transporter  100 
 
 
260 aa  520  1e-147  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566487  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0476  ABC transporter  38.55 
 
 
261 aa  190  2e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0918062 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1123  ABC-2 type transporter  31.92 
 
 
257 aa  149  4e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0242  ABC-2 type transporter  31.5 
 
 
278 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  34.43 
 
 
255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1478  ABC-2 type transporter  36.65 
 
 
254 aa  146  3e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  38.46 
 
 
250 aa  144  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  35.71 
 
 
253 aa  142  6e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4031  ABC-2 type transporter  33.96 
 
 
289 aa  140  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.246164  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1766  multidrug ABC transporter, permease protein  32.81 
 
 
242 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  32.61 
 
 
288 aa  139  6e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1426  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  31.76 
 
 
256 aa  137  1e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0562869  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1170  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.63 
 
 
253 aa  137  2e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.35 
 
 
253 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  32.59 
 
 
290 aa  136  4e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0559  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  37.55 
 
 
264 aa  136  4e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.74 
 
 
253 aa  136  4e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.02 
 
 
253 aa  136  4e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1380  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  31.37 
 
 
256 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000932687  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5103  ABC-2 type transporter  33.96 
 
 
281 aa  134  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00233057  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  33.8 
 
 
249 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  33.94 
 
 
284 aa  133  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  34.32 
 
 
261 aa  133  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000233601  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0966  ABC-2 type transporter  35.1 
 
 
259 aa  133  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0363  ABC-2 type transporter  32.2 
 
 
289 aa  132  6e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2298  daunorubicin resistance ABC transporter membrane protein  33.77 
 
 
264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.207913  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.12 
 
 
249 aa  130  3e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0300  ABC-2 type transporter  33.02 
 
 
270 aa  129  6e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2250  ABC-2 type transporter  33.19 
 
 
256 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.239998  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2515  ABC transporter, permease protein  31.25 
 
 
278 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  32.3 
 
 
251 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0685  ABC transporter, permease protein  28.31 
 
 
277 aa  125  5e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.537478  normal  0.14182 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0426  ABC-2 type transporter  29.96 
 
 
256 aa  125  5e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0230  ABC-2 type transporter  31.84 
 
 
256 aa  125  6e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0427  ABC-2 type transporter  30.37 
 
 
278 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.469533  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1203  ABC-2 type transporter  28.74 
 
 
251 aa  122  6e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0595438 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  31.76 
 
 
254 aa  120  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1125  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  31.56 
 
 
260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.742933  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  31.34 
 
 
249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0037  ABC-2 type transporter  31.22 
 
 
255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1034  ABC-2 type transporter  32.42 
 
 
256 aa  116  3e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.150436 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2013  ABC-2 type transporter  31.96 
 
 
256 aa  116  5e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.0000119274  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1528  hypothetical protein  30.52 
 
 
249 aa  115  6e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4106  ABC-2 type transporter  31.51 
 
 
293 aa  114  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1561  ABC-2 type transporter  31.28 
 
 
252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.403911  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0014  ABC-2 type transporter  32.59 
 
 
304 aa  113  4.0000000000000004e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2171  ABC-2 type transporter  30.59 
 
 
256 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2056  ABC-2 type transporter  33.18 
 
 
241 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.794734  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0786  ABC-2 type transporter  28.79 
 
 
254 aa  113  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.585621  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2588  ABC-2 type transporter  31.74 
 
 
298 aa  112  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2561  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  30.05 
 
 
249 aa  111  9e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3518  ABC-2 type transporter  31.3 
 
 
298 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0497  ABC-2 type transporter  32.74 
 
 
286 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0176  hypothetical protein  31.71 
 
 
241 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.67071  normal  0.0449558 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1750  putative multidrug efflux ABC transporter  33.33 
 
 
277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0190039  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0192  hypothetical protein  28.94 
 
 
295 aa  110  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.144906 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2794  hypothetical protein  25.77 
 
 
276 aa  108  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0995371 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3861  ABC-2 type transporter  29.18 
 
 
291 aa  107  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.92497  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3882  ABC-2 type transporter  32.42 
 
 
278 aa  107  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4739  ABC-2 type transporter  30.91 
 
 
285 aa  106  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0612  putative multidrug efflux ABC transporter  32.88 
 
 
284 aa  105  5e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2221  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  33.63 
 
 
273 aa  106  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000454003  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2893  ABC-2 type transporter  27.99 
 
 
270 aa  105  6e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0287  hypothetical protein  32.53 
 
 
241 aa  105  8e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.301015  normal  0.184502 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1448  ABC-2 type transporter  28.85 
 
 
251 aa  105  9e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0318973  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1079  ABC-2 type transporter  31.84 
 
 
296 aa  104  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06471  putative multidrug efflux ABC transporter  35.03 
 
 
284 aa  104  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.620136 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3547  ABC-2 type transporter  31.01 
 
 
259 aa  103  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.369986 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4873  ABC-2 type transporter  29.31 
 
 
298 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2261  ABC-2 type transporter  27.73 
 
 
260 aa  103  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.121091  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0449  putative multidrug efflux ABC transporter  30 
 
 
274 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.603097  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04741  putative multidrug efflux ABC transporter  29.41 
 
 
274 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0380  ABC-2 type transporter  31.11 
 
 
280 aa  102  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05051  putative multidrug efflux ABC transporter  29.04 
 
 
274 aa  102  6e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.507008  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1459  ABC-2 type transporter  29.58 
 
 
249 aa  100  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  27.67 
 
 
254 aa  100  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3408  ABC-2 type transporter, permease protein  26.36 
 
 
243 aa  99.8  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184246  normal  0.618546 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3261  ABC-2 type transporter  29.36 
 
 
249 aa  99.4  6e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0723  ABC-2 type transporter  29.55 
 
 
272 aa  99  7e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0756908 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1796  ABC-2 type transporter  30.13 
 
 
280 aa  98.6  8e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000116393 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1448  putative ABC transporter transmembrane protein  28.79 
 
 
252 aa  97.8  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2409  ABC-2 type transporter  27.78 
 
 
253 aa  97.8  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0340  ABC-2 type transporter  29.96 
 
 
273 aa  98.2  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.171685  hitchhiker  0.00234396 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05121  putative multidrug efflux ABC transporter  29.86 
 
 
274 aa  97.4  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1861  ABC-2 type transporter  29.39 
 
 
258 aa  96.7  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6126  ABC-2 type transporter  29.6 
 
 
275 aa  97.1  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0365687  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4170  ABC-2 type transporter  30.18 
 
 
270 aa  95.1  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3036  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 
295 aa  94  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2499  ABC-2 transporter component  30.58 
 
 
276 aa  94.4  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  29.91 
 
 
270 aa  94.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1358  ABC-2 type transporter  26.96 
 
 
294 aa  93.2  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.624692  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1533  ABC-2 type transporter  25 
 
 
274 aa  92  8e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3137  ABC-2 type transporter  29.54 
 
 
277 aa  91.7  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.428202  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1781  putative multidrug efflux ABC transporter  27.48 
 
 
284 aa  91.7  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2149  ABC-2 type transport system permease protein  26.5 
 
 
286 aa  91.3  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.157353 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0215  ABC-2 type transporter  30.6 
 
 
275 aa  91.7  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.716105  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05041  putative multidrug efflux ABC transporter  27.48 
 
 
284 aa  91.7  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.112221 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0096  ABC-2 type transporter  31.63 
 
 
247 aa  90.9  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1894  putative daunorubicin resistance ABC transporter, permease protein  28.38 
 
 
260 aa  90.9  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00976323  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04481  putative multidrug efflux ABC transporter  30.32 
 
 
284 aa  90.5  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.86864  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>