More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1123 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1123  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 275 aa  528  1e-149  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18340  ABC-type multidrug transport system, permease component  50.45 
 
 		 282 aa  216  2e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.823039 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  35.31 
 
 		 270 aa  141  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0918  ABC-2 type transporter  36.4 
 
 		 254 aa  140  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1122  ABC-2 type transporter  34.86 
 
 		 285 aa  134  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  34.13 
 
 		 269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0666  ABC-2 type transporter  37.56 
 
 		 285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4056  ABC-2 type transporter  34.6 
 
 		 267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4023  ABC-2 type transporter  34.6 
 
 		 267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.293949  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3916  ABC transporter, inner membrane subunit  35.32 
 
 		 267 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1697  ABC-2 type transporter  33.64 
 
 		 271 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4656  ABC-2 type transporter  35.27 
 
 		 285 aa  123  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.890125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4106  ABC-2 type transporter  35.06 
 
 		 293 aa  122  5e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1878  ABC-2 type transporter  38.1 
 
 		 273 aa  122  5e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0393  ABC-2 type transporter  35.61 
 
 		 274 aa  122  9e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0042  ABC-2 type transporter  35.14 
 
 		 266 aa  122  9e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1839  ABC-2 type transporter  32.55 
 
 		 266 aa  121  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1622  ABC-2 type transporter  33.49 
 
 		 278 aa  120  3e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1483  ABC-2 type transporter  31.13 
 
 		 269 aa  119  7e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00140227  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23570  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  35.98 
 
 		 267 aa  118  9.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.24456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2100  ABC-2 type transporter  33.07 
 
 		 267 aa  118  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3328  ABC-2 type transporter  34.75 
 
 		 281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.45338  normal  0.334159 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3253  ABC transporter related  32.22 
 
 		 265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00665342  normal  0.245763 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0497  ABC-2 type transporter  33.64 
 
 		 286 aa  116  3e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1384  ABC-2 type transporter  35.86 
 
 		 269 aa  116  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6250  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 285 aa  116  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243116  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3103  ABC transporter protein  33.85 
 
 		 280 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849207 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2021  hypothetical protein  33.91 
 
 		 289 aa  115  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.290119  normal  0.988573 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0340  ABC-2 type transporter  33.8 
 
 		 273 aa  115  8.999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.171685  hitchhiker  0.00234396 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1351  ABC-2 type transporter  34.14 
 
 		 272 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0414359  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0014  ABC-2 type transporter  31.46 
 
 		 304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22030  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  34.78 
 
 		 281 aa  113  3e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4512  ABC-2 type transporter  30.74 
 
 		 281 aa  112  6e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1937  ABC-2 type transporter  30.08 
 
 		 284 aa  112  6e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.008119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5259  ABC-2 type transporter  32.33 
 
 		 277 aa  112  9e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2716  ABC-2 type transporter  35.59 
 
 		 254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3893  ABC-2 type transporter  33.06 
 
 		 242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0012751  normal  0.0102027 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2775  ABC-2 type transporter  30.86 
 
 		 278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00783625  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1476  ABC-2 type transporter  33.49 
 
 		 267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0538  ABC-2 type transporter  30.66 
 
 		 267 aa  110  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.690834  hitchhiker  0.000010786 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4551  ABC-2 type transporter  34.26 
 
 		 264 aa  108  8.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07250  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  30.56 
 
 		 265 aa  108  1e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.307058 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2897  ABC-2 type transporter  36.29 
 
 		 274 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.643507  normal  0.323486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6787  ABC-2 type transporter  35.12 
 
 		 268 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000212784  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3986  ABC-2 type transporter  34.86 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3922  ABC-2 type transporter  30.37 
 
 		 266 aa  106  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0348636  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2294  ABC-2 type transporter  35.32 
 
 		 277 aa  106  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.911135  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0966  ABC-2 type transporter  33.73 
 
 		 259 aa  106  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0746  ABC-2 type transporter  32.38 
 
 		 280 aa  105  6e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4795  ABC-2 type transporter  31.84 
 
 		 284 aa  105  7e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597944 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0937  ABC-2 type transporter  28.64 
 
 		 269 aa  105  8e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8873  ABC-2 type transporter  32.18 
 
 		 270 aa  104  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.53633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8158  ABC-2 type transporter  31.8 
 
 		 272 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.880228 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30730  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  33.94 
 
 		 277 aa  102  6e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.364162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1504  ABC-2 type transporter  28.98 
 
 		 272 aa  102  8e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.457097  normal  0.179064 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1342  ABC-2 type transporter  31.84 
 
 		 279 aa  101  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.333729  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0062  ABC-2 type transporter  29.32 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566487  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1755  ABC-2 type transporter  31.97 
 
 		 264 aa  101  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.586856  decreased coverage  0.00328589 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2939  ABC-2 type transporter  30.04 
 
 		 286 aa  100  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.27677 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0451  ABC-type multidrug transport system, permease component  30.77 
 
 		 269 aa  101  2e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0034336  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4259  ABC-2 type transporter  30.77 
 
 		 282 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4345  ABC-2 type transporter  30.77 
 
 		 282 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0911686 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4638  ABC-2 type transporter  30.77 
 
 		 282 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.619797  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3882  ABC-2 type transporter  32.51 
 
 		 278 aa  100  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0039  ABC-2 type transporter  30.56 
 
 		 267 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1123  ABC-2 type transporter  28.82 
 
 		 257 aa  99.4  5e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3718  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 260 aa  99  7e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282288  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4761  ABC-2 type transporter  31.2 
 
 		 261 aa  99  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000109025  hitchhiker  0.000621886 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0618  ABC-2 type transporter  34.74 
 
 		 267 aa  98.6  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.099686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4183  ABC-2 type transporter  29.92 
 
 		 269 aa  97.4  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0674  ABC-2 type transporter  29.24 
 
 		 272 aa  97.8  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1236  ABC-2 type transporter  35.17 
 
 		 281 aa  95.9  7e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1966  ABC-2 type transporter  33.8 
 
 		 318 aa  95.1  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.115517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1683  ABC-2 type transporter  32.83 
 
 		 274 aa  94.7  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000181652  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24940  ABC-type multidrug transport system, permease component  29.96 
 
 		 284 aa  94  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.484855 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1448  putative ABC transporter transmembrane protein  31.37 
 
 		 252 aa  93.2  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0096  ABC-2 type transporter  32.42 
 
 		 247 aa  93.2  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4170  ABC-2 type transporter  33.07 
 
 		 270 aa  93.2  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4936  ABC-2 type transporter  31.44 
 
 		 280 aa  92.8  6e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.707728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35420  ABC-type multidrug transport system, permease component  31.78 
 
 		 257 aa  92.8  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0786  ABC-2 type transporter  28.97 
 
 		 254 aa  92.4  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.585621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3137  ABC-2 type transporter  32.69 
 
 		 277 aa  92  8e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.428202  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0058  ABC-2 type transporter  30.34 
 
 		 271 aa  92.4  8e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39010  ABC-type multidrug transport system, permease component  30.81 
 
 		 271 aa  92  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.436846 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3149  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  31.08 
 
 		 249 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0286068  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1525  ABC-2 type transporter  31.54 
 
 		 290 aa  89.7  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00118323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  28.44 
 
 		 261 aa  89.7  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000233601  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3467  ABC transporter, efflux permease protein  30.74 
 
 		 249 aa  89  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000810233  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0375  ABC-2 type transporter  31.33 
 
 		 264 aa  88.6  9e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133292  hitchhiker  0.00534901 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3239  ABC transporter efflux permease  30.52 
 
 		 249 aa  87.4  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3492  ABC transporter permease  30.52 
 
 		 249 aa  87.4  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.799548  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6126  ABC-2 type transporter  34.43 
 
 		 275 aa  87.8  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0365687  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0363  ABC-2 type transporter  30 
 
 		 289 aa  87.8  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7215  ABC transporter (permease)  31.22 
 
 		 247 aa  87.8  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3453  ABC transporter, efflux permease protein  30.52 
 
 		 249 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1478  ABC-2 type transporter  27.1 
 
 		 254 aa  87  3e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3547  ABC-2 type transporter  31.23 
 
 		 259 aa  86.7  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.369986 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1352  ABC-2 type transporter  32.16 
 
 		 254 aa  86.7  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.137638  normal  0.090478 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2250  ABC-2 type transporter  27.85 
 
 		 256 aa  85.9  6e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.239998  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.64 
 
 		 255 aa  85.9  7e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>