More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0786 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0786  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 254 aa  496  1e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.585621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2409  ABC-2 type transporter  48.03 
 
 		 253 aa  217  2e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3247  ABC-2 type transporter  47.04 
 
 		 254 aa  199  5e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.590775 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1533  ABC-2 type transporter  43.87 
 
 		 274 aa  187  1e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1730  hypothetical protein  40 
 
 		 251 aa  165  6.9999999999999995e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.45161 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0121  ABC-2 type transporter  46.93 
 
 		 252 aa  161  9e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0240531  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3882  ABC-2 type transporter  41.13 
 
 		 278 aa  157  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3408  ABC-2 type transporter, permease protein  39.37 
 
 		 243 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184246  normal  0.618546 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1958  ABC-2 type transporter  35.69 
 
 		 250 aa  144  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00055396  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1448  ABC-2 type transporter  37.3 
 
 		 251 aa  143  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0318973  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4200  ABC-2 type transporter  41.2 
 
 		 275 aa  142  5e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1123  ABC-2 type transporter  34.52 
 
 		 257 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3137  ABC-2 type transporter  36.4 
 
 		 277 aa  137  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.428202  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1448  putative ABC transporter transmembrane protein  36.21 
 
 		 252 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0096  ABC-2 type transporter  39.17 
 
 		 247 aa  135  9e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1775  ABC transporter related protein  39.6 
 
 		 249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.254288 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4170  ABC-2 type transporter  36.48 
 
 		 270 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0966  ABC-2 type transporter  33.04 
 
 		 259 aa  118  9e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0014  ABC-2 type transporter  33.19 
 
 		 304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0062  ABC-2 type transporter  28.79 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566487  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3547  ABC-2 type transporter  30.49 
 
 		 259 aa  104  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.369986 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1203  ABC-2 type transporter  30.4 
 
 		 251 aa  101  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0595438 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0497  ABC-2 type transporter  30.18 
 
 		 286 aa  99  7e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4106  ABC-2 type transporter  30.63 
 
 		 293 aa  98.6  8e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0192  hypothetical protein  29.32 
 
 		 295 aa  97.1  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.144906 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3861  ABC-2 type transporter  28.51 
 
 		 291 aa  97.1  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.92497  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.25 
 
 		 255 aa  94.4  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.65 
 
 		 249 aa  94  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0476  ABC transporter  28.96 
 
 		 261 aa  93.2  4e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0918062 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3518  ABC-2 type transporter  27.98 
 
 		 298 aa  92  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2588  ABC-2 type transporter  27.98 
 
 		 298 aa  92.4  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.98 
 
 		 254 aa  90.5  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1170  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.82 
 
 		 253 aa  90.5  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  29.34 
 
 		 269 aa  90.5  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1426  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  30.04 
 
 		 256 aa  90.1  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0562869  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1380  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  30.04 
 
 		 256 aa  89.4  5e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000932687  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4873  ABC-2 type transporter  27.98 
 
 		 298 aa  89  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.97 
 
 		 253 aa  89  6e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1478  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 254 aa  88.6  1e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0559  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.71 
 
 		 264 aa  87  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  30.56 
 
 		 253 aa  87  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23570  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  27.63 
 
 		 267 aa  87.4  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.24456  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0538  ABC-2 type transporter  28.63 
 
 		 267 aa  87  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.690834  hitchhiker  0.000010786 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.52 
 
 		 249 aa  86.7  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.74 
 
 		 249 aa  86.7  4e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  28.33 
 
 		 270 aa  86.3  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0230  ABC-2 type transporter  28.05 
 
 		 256 aa  85.9  5e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  29.02 
 
 		 253 aa  85.9  6e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0918  ABC-2 type transporter  29.36 
 
 		 254 aa  85.5  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  28.44 
 
 		 251 aa  85.5  8e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1483  ABC-2 type transporter  26.43 
 
 		 269 aa  85.5  8e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00140227  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.55 
 
 		 253 aa  85.1  9e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2171  ABC-2 type transporter  28.31 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2561  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  30.86 
 
 		 249 aa  84.7  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2250  ABC-2 type transporter  29.84 
 
 		 256 aa  84  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.239998  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6126  ABC-2 type transporter  30.23 
 
 		 275 aa  82.8  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0365687  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1079  ABC-2 type transporter  26.51 
 
 		 296 aa  82.8  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  25.49 
 
 		 254 aa  81.6  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2298  daunorubicin resistance ABC transporter membrane protein  28.39 
 
 		 264 aa  81.3  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.207913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1528  hypothetical protein  27.65 
 
 		 249 aa  81.3  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18340  ABC-type multidrug transport system, permease component  30.7 
 
 		 282 aa  80.9  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.823039 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5103  ABC-2 type transporter  28.07 
 
 		 281 aa  80.5  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00233057  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1937  ABC-2 type transporter  26.55 
 
 		 284 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.008119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  25.59 
 
 		 250 aa  79.3  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05051  putative multidrug efflux ABC transporter  28.38 
 
 		 274 aa  79.3  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.507008  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1342  ABC-2 type transporter  30.04 
 
 		 279 aa  79  0.00000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.333729  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0300  ABC-2 type transporter  28.51 
 
 		 270 aa  78.6  0.00000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1766  multidrug ABC transporter, permease protein  25.91 
 
 		 242 aa  78.6  0.00000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  26.32 
 
 		 261 aa  78.2  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000233601  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0449  putative multidrug efflux ABC transporter  27.95 
 
 		 274 aa  77.4  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.603097  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1459  ABC-2 type transporter  28.12 
 
 		 249 aa  77.4  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2716  ABC-2 type transporter  31.36 
 
 		 254 aa  77  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04741  putative multidrug efflux ABC transporter  27.95 
 
 		 274 aa  77.8  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0251  ABC-2 type transporter  27.48 
 
 		 255 aa  77.4  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.452318 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1750  putative multidrug efflux ABC transporter  27.04 
 
 		 277 aa  76.3  0.0000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0190039  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1125  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.09 
 
 		 260 aa  75.9  0.0000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.742933  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4551  ABC-2 type transporter  27.73 
 
 		 264 aa  75.9  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1755  ABC-2 type transporter  30.92 
 
 		 264 aa  75.9  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.586856  decreased coverage  0.00328589 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05121  putative multidrug efflux ABC transporter  27.51 
 
 		 274 aa  75.5  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1561  ABC-2 type transporter  29.21 
 
 		 252 aa  75.5  0.0000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.403911  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0037  ABC-2 type transporter  27.69 
 
 		 255 aa  75.1  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04481  putative multidrug efflux ABC transporter  26.46 
 
 		 284 aa  75.1  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.86864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  30 
 
 		 288 aa  75.1  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0375  ABC-2 type transporter  26.52 
 
 		 264 aa  73.9  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133292  hitchhiker  0.00534901 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0666  ABC-2 type transporter  26.75 
 
 		 285 aa  73.2  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0380  ABC-2 type transporter  27.59 
 
 		 280 aa  72.8  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1878  ABC-2 type transporter  28.15 
 
 		 273 aa  72.4  0.000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1123  ABC-2 type transporter  27.1 
 
 		 275 aa  72.4  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07250  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  27.39 
 
 		 265 aa  72  0.000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.307058 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2149  ABC-2 type transport system permease protein  31.75 
 
 		 286 aa  71.6  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.157353 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  26.97 
 
 		 360 aa  72  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  26.34 
 
 		 290 aa  70.5  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  27.5 
 
 		 339 aa  70.5  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3922  ABC-2 type transporter  27.23 
 
 		 266 aa  70.9  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0348636  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2221  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  24.19 
 
 		 273 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000454003  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4259  ABC-2 type transporter  25.22 
 
 		 282 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4345  ABC-2 type transporter  25.22 
 
 		 282 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0911686 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  26.97 
 
 		 360 aa  71.2  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4638  ABC-2 type transporter  25.22 
 
 		 282 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.619797  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0814  ABC transporter, permease protein  29.19 
 
 		 241 aa  70.5  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>