More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0721 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  100 
 
 
360 aa  713    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  93.06 
 
 
360 aa  655    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  92.33 
 
 
339 aa  609  1e-173  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  40.32 
 
 
375 aa  269  4e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  33.88 
 
 
366 aa  194  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0703  ABC-2 type transporter  29.92 
 
 
363 aa  171  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422501  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2148  putative ABC transporter, permease protein  30.19 
 
 
327 aa  159  9e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249033  normal  0.497773 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5132  ABC-2 type transporter  29.41 
 
 
358 aa  158  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.033585  normal  0.150856 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5840  ABC-2 type transporter  27.6 
 
 
367 aa  149  7e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.564028 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0285  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  27.86 
 
 
356 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0094  ABC-2 type transporter  27.25 
 
 
388 aa  143  5e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00282283  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3101  ABC-2 type transporter  29.81 
 
 
344 aa  143  5e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000558169  hitchhiker  0.0000121126 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_460  ABC-type transport system, permease component  27.95 
 
 
365 aa  133  6e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.185192  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0495  ABC-2 type transporter  26.55 
 
 
365 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0519  ABC transporter, permease protein, putative  26.91 
 
 
365 aa  125  1e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.180275  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0552  ABC-2 type transporter  28.44 
 
 
336 aa  122  7e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1067  putative ABC transporter, permease protein  27.4 
 
 
341 aa  120  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3069  ABC-2 type transporter  26.56 
 
 
373 aa  117  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.669525  normal  0.261942 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2919  ABC-2 type transporter  23.84 
 
 
368 aa  116  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.856849  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  25.51 
 
 
376 aa  114  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  24.73 
 
 
376 aa  112  7.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0113  ABC-2 type transporter  23.29 
 
 
376 aa  110  3e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.816984  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  23.68 
 
 
378 aa  106  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001402  ABC-type multidrug transport system permease component  26.2 
 
 
366 aa  106  5e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  25.75 
 
 
370 aa  106  8e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0255  ABC-2 type transporter  25 
 
 
373 aa  105  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  22.8 
 
 
366 aa  103  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  25.71 
 
 
367 aa  103  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  24.1 
 
 
371 aa  103  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2769  ABC-2 type transporter  24.52 
 
 
413 aa  103  6e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.160651  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0655  hypothetical protein  25.81 
 
 
376 aa  102  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126989 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  25.14 
 
 
369 aa  102  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0349  putative ABC transporter, permease protein  24.42 
 
 
364 aa  101  2e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2726  ABC-2 type transporter  26.39 
 
 
353 aa  100  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  20.86 
 
 
381 aa  99.8  7e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06359  hypothetical protein  25.63 
 
 
366 aa  99.4  8e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0112  ABC-2 type transporter  22.01 
 
 
372 aa  97.8  2e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0225544  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4746  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  33.5 
 
 
232 aa  98.6  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2815  ABC transporter, permease protein  26.28 
 
 
368 aa  97.8  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  22.69 
 
 
373 aa  97.4  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2903  ABC-2 type transporter  26.28 
 
 
368 aa  97.8  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.751562  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  23.96 
 
 
376 aa  96.7  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3272  ABC-2 type transporter  23.71 
 
 
376 aa  96.7  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  23.03 
 
 
377 aa  97.1  5e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7430  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.3 
 
 
359 aa  96.3  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.104702  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0132  ABC-2 type transporter  24.31 
 
 
370 aa  96.3  8e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5640  ABC-2 type transporter  21.8 
 
 
368 aa  95.9  9e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9333  hypothetical protein  31.09 
 
 
244 aa  95.9  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6512  ABC-2 type transporter  23.06 
 
 
359 aa  95.9  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102415  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4695  ABC-2 type transporter  25.4 
 
 
370 aa  95.1  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.595113 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  21.7 
 
 
376 aa  95.5  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1047  ABC-2 type transporter  25.97 
 
 
371 aa  95.5  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  24 
 
 
376 aa  95.5  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1721  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  23.27 
 
 
380 aa  95.9  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1107  ABC-2 type transporter  23.35 
 
 
368 aa  95.5  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.502812 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0259  ABC transporter  25.6 
 
 
365 aa  94.7  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.474488  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2584  ABC-2 type transporter  30.81 
 
 
251 aa  94.7  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  normal  0.0868823 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1356  ABC-2 type transporter  26.52 
 
 
370 aa  95.1  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000392503  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  20.11 
 
 
384 aa  94.7  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2079  ABC-2 type transporter  32.69 
 
 
269 aa  95.1  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.524343  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0425  ABC-2 type transporter  25.21 
 
 
366 aa  95.1  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1079  putative ABC transporter ATP-binding protein or permease protein  23.77 
 
 
375 aa  94.4  3e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1491  ABC-2 type transporter  21.04 
 
 
375 aa  94  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5656  ABC-2 type transporter  22.78 
 
 
359 aa  94  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78729  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6021  ABC-2 type transporter  22.78 
 
 
359 aa  94  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.679719  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1265  ABC-type multidrug transport system, permease component  25.53 
 
 
365 aa  94  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000431089  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0857  hypothetical protein  24.44 
 
 
377 aa  93.6  5e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1975  ABC transporter protein  35.82 
 
 
263 aa  93.2  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0196  ABC-2 type transporter  32 
 
 
247 aa  93.2  7e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.168445  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0217  ABC-2 type transporter  21.29 
 
 
380 aa  92.8  8e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.623242  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4677  ABC-2 type transporter  25 
 
 
367 aa  92.8  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.521717  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5303  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  25.83 
 
 
385 aa  92.4  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0664808 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0977  ABC-2 type transporter  23.97 
 
 
376 aa  92.8  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.750139 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3151  ABC-2 type transporter  34.66 
 
 
247 aa  92.4  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  21.15 
 
 
384 aa  92.4  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  31.5 
 
 
261 aa  92.4  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5055  ABC-2 type transporter  24.17 
 
 
371 aa  92.4  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.863659 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1326  ABC-2 type transporter  25.77 
 
 
368 aa  91.3  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0539  ABC-2 type transporter  27.3 
 
 
361 aa  91.3  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  20.11 
 
 
382 aa  91.3  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2250  ABC-2 type transporter  31.53 
 
 
256 aa  91.3  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.239998  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  21.43 
 
 
384 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3308  ABC-2 type transporter  24.29 
 
 
380 aa  90.9  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4310  ABC-2 type transporter  23.06 
 
 
390 aa  90.9  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0553  ABC-2 type transporter  26.99 
 
 
361 aa  91.3  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0093  ABC-2 type transporter  23.8 
 
 
356 aa  90.1  5e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.154072  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1407  ABC-2 type transporter  24.63 
 
 
390 aa  90.1  6e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0722893 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  22.35 
 
 
379 aa  89.7  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2907  ABC-2 type transporter  23.53 
 
 
376 aa  89.7  7e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  21.15 
 
 
384 aa  89.4  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1106  ABC-2 type transporter  19.42 
 
 
379 aa  89.4  9e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.762924 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  19.46 
 
 
387 aa  89.4  9e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3223  ABC-2 type transporter  24.01 
 
 
380 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0649112  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1518  ABC-2 type transporter  24.52 
 
 
378 aa  88.6  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2429  ABC-2 type transporter  27.19 
 
 
251 aa  89  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0140653  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1758  ABC-2 type transporter  23.5 
 
 
341 aa  89  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6131  ABC-2 type transporter  24.3 
 
 
358 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.862302  normal  0.0100987 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1203  ABC-2 type transporter  28.72 
 
 
251 aa  87.4  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0595438 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0131  ABC-2 type transporter  21.49 
 
 
378 aa  87.8  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.110874  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0737  ABC-type multidrug transport system, permease component  33.52 
 
 
377 aa  87.4  3e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00484474  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>