More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6126 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6126  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 275 aa  527  1e-149  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0365687  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0966  ABC-2 type transporter  51.42 
 
 		 259 aa  250  2e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1123  ABC-2 type transporter  46.53 
 
 		 257 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3547  ABC-2 type transporter  42.86 
 
 		 259 aa  180  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.369986 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0062  ABC-2 type transporter  28.85 
 
 		 260 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566487  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0014  ABC-2 type transporter  33.6 
 
 		 304 aa  119  7e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4106  ABC-2 type transporter  34.51 
 
 		 293 aa  108  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1478  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 254 aa  105  6e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1533  ABC-2 type transporter  31.69 
 
 		 274 aa  103  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3882  ABC-2 type transporter  35.41 
 
 		 278 aa  103  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0497  ABC-2 type transporter  32.02 
 
 		 286 aa  102  5e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0786  ABC-2 type transporter  31.03 
 
 		 254 aa  98.6  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.585621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0340  ABC-2 type transporter  29.76 
 
 		 273 aa  98.2  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.171685  hitchhiker  0.00234396 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05121  putative multidrug efflux ABC transporter  30.7 
 
 		 274 aa  97.8  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2588  ABC-2 type transporter  33.95 
 
 		 298 aa  96.3  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3518  ABC-2 type transporter  33.95 
 
 		 298 aa  96.3  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1448  ABC-2 type transporter  31.16 
 
 		 251 aa  95.1  9e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0318973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0449  putative multidrug efflux ABC transporter  32.34 
 
 		 274 aa  94.7  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.603097  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05051  putative multidrug efflux ABC transporter  31.46 
 
 		 274 aa  94.7  1e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.507008  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4873  ABC-2 type transporter  34.78 
 
 		 298 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0363  ABC-2 type transporter  29.66 
 
 		 289 aa  94  2e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1342  ABC-2 type transporter  31.22 
 
 		 279 aa  94  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.333729  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04741  putative multidrug efflux ABC transporter  32.34 
 
 		 274 aa  94.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1426  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.1 
 
 		 256 aa  92  8e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0562869  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  27.62 
 
 		 261 aa  91.7  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000233601  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1380  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.1 
 
 		 256 aa  91.7  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000932687  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3861  ABC-2 type transporter  35.19 
 
 		 291 aa  91.3  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.92497  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.2 
 
 		 253 aa  90.9  2e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3137  ABC-2 type transporter  30.56 
 
 		 277 aa  90.1  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.428202  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1448  putative ABC transporter transmembrane protein  31.58 
 
 		 252 aa  90.5  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2250  ABC-2 type transporter  29.35 
 
 		 256 aa  90.5  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.239998  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1203  ABC-2 type transporter  32 
 
 		 251 aa  89.7  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0595438 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.28 
 
 		 249 aa  90.1  4e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1766  multidrug ABC transporter, permease protein  28.02 
 
 		 242 aa  89.4  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.32 
 
 		 253 aa  89.4  6e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  31.19 
 
 		 253 aa  89  7e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0192  hypothetical protein  33.82 
 
 		 295 aa  89  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.144906 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3922  ABC-2 type transporter  27.95 
 
 		 266 aa  89  9e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0348636  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0476  ABC transporter  27.01 
 
 		 261 aa  87.8  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0918062 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2409  ABC-2 type transporter  30.58 
 
 		 253 aa  87.4  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1123  ABC-2 type transporter  32.93 
 
 		 275 aa  87.4  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1122  ABC-2 type transporter  27.09 
 
 		 285 aa  87.4  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1079  ABC-2 type transporter  33.5 
 
 		 296 aa  87.8  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  30.09 
 
 		 270 aa  87.8  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  29.74 
 
 		 290 aa  86.7  4e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4023  ABC-2 type transporter  27.86 
 
 		 267 aa  86.7  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.293949  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4056  ABC-2 type transporter  27.86 
 
 		 267 aa  86.7  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0096  ABC-2 type transporter  31.8 
 
 		 247 aa  85.9  7e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3916  ABC transporter, inner membrane subunit  27.86 
 
 		 267 aa  85.9  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0538  ABC-2 type transporter  30.62 
 
 		 267 aa  85.5  8e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.690834  hitchhiker  0.000010786 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1750  putative multidrug efflux ABC transporter  33.83 
 
 		 277 aa  85.5  9e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0190039  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4551  ABC-2 type transporter  32.2 
 
 		 264 aa  85.5  9e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  26.43 
 
 		 254 aa  84.7  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2294  ABC-2 type transporter  27.59 
 
 		 277 aa  84.7  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.911135  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2056  ABC-2 type transporter  29.38 
 
 		 241 aa  84.3  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.794734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0746  ABC-2 type transporter  27.59 
 
 		 280 aa  84  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4170  ABC-2 type transporter  28.68 
 
 		 270 aa  84  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2775  ABC-2 type transporter  30.24 
 
 		 278 aa  84  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00783625  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0251  ABC-2 type transporter  27.41 
 
 		 255 aa  84.3  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.452318 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2149  ABC-2 type transport system permease protein  32.91 
 
 		 286 aa  83.6  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.157353 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04481  putative multidrug efflux ABC transporter  32.34 
 
 		 284 aa  83.2  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.86864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0723  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 		 272 aa  83.2  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0756908 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0230  ABC-2 type transporter  30.53 
 
 		 256 aa  83.2  0.000000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3408  ABC-2 type transporter, permease protein  30.86 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184246  normal  0.618546 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0039  ABC-2 type transporter  29.67 
 
 		 267 aa  82.8  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1483  ABC-2 type transporter  28.24 
 
 		 269 aa  82.8  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00140227  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0426  ABC-2 type transporter  28.18 
 
 		 256 aa  82.4  0.000000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0666  ABC-2 type transporter  28.77 
 
 		 285 aa  82.4  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1358  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 294 aa  82  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.624692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2939  ABC-2 type transporter  26.77 
 
 		 286 aa  81.6  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.27677 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0176  hypothetical protein  27.31 
 
 		 241 aa  81.3  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.67071  normal  0.0449558 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1170  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25.41 
 
 		 253 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1730  hypothetical protein  27.54 
 
 		 251 aa  80.9  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.45161 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1561  ABC-2 type transporter  25.79 
 
 		 252 aa  81.3  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.403911  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4200  ABC-2 type transporter  32.58 
 
 		 275 aa  80.5  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2716  ABC-2 type transporter  33.48 
 
 		 254 aa  80.1  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1525  ABC-2 type transporter  28.78 
 
 		 290 aa  80.1  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00118323  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4674  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 276 aa  80.1  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.348942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2171  ABC-2 type transporter  27.95 
 
 		 256 aa  80.1  0.00000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3253  ABC transporter related  27.48 
 
 		 265 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00665342  normal  0.245763 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8158  ABC-2 type transporter  29.8 
 
 		 272 aa  79.7  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.880228 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1459  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 249 aa  79.3  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  28.57 
 
 		 269 aa  79.3  0.00000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0895  ABC-2 type transporter  29.75 
 
 		 266 aa  79.3  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3103  ABC transporter protein  28.63 
 
 		 280 aa  79.3  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849207 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  27.49 
 
 		 251 aa  79.3  0.00000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1476  ABC-2 type transporter  28.4 
 
 		 267 aa  79  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  29.41 
 
 		 253 aa  78.6  0.00000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0918  ABC-2 type transporter  26.83 
 
 		 254 aa  78.6  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1839  ABC-2 type transporter  29.52 
 
 		 266 aa  79  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.91 
 
 		 255 aa  79  0.00000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0814  ABC transporter, permease protein  26.27 
 
 		 241 aa  78.2  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  31.92 
 
 		 250 aa  78.2  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0037  ABC-2 type transporter  29.34 
 
 		 255 aa  78.2  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1936  ABC-2 type transporter  29.72 
 
 		 286 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0937  ABC-2 type transporter  26.17 
 
 		 269 aa  77.8  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4739  ABC-2 type transporter  29.3 
 
 		 285 aa  77.4  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_718  ABC transporter, permease protein  25.74 
 
 		 260 aa  77.4  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000115983  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.7 
 
 		 249 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2561  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.11 
 
 		 249 aa  77.4  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.760407 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>