More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3916 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_3916  ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
267 aa  526  1e-148  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4056  ABC-2 type transporter  98.88 
 
 
267 aa  520  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4023  ABC-2 type transporter  98.88 
 
 
267 aa  520  1e-146  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.293949  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0746  ABC-2 type transporter  59.22 
 
 
280 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30730  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  57.25 
 
 
277 aa  301  5.000000000000001e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.364162  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1236  ABC-2 type transporter  55.64 
 
 
281 aa  290  1e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1966  ABC-2 type transporter  57.98 
 
 
318 aa  286  2e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.115517  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3328  ABC-2 type transporter  54.31 
 
 
281 aa  281  9e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.45338  normal  0.334159 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2294  ABC-2 type transporter  53.96 
 
 
277 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.911135  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3253  ABC transporter related  51.97 
 
 
265 aa  270  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00665342  normal  0.245763 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4936  ABC-2 type transporter  51.35 
 
 
280 aa  262  4.999999999999999e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.707728  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2100  ABC-2 type transporter  50.94 
 
 
267 aa  253  3e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2775  ABC-2 type transporter  46.72 
 
 
278 aa  247  2e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00783625  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2939  ABC-2 type transporter  50.79 
 
 
286 aa  246  2e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.27677 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1122  ABC-2 type transporter  43.9 
 
 
285 aa  228  7e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408605  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1622  ABC-2 type transporter  43.54 
 
 
278 aa  228  1e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0042  ABC-2 type transporter  45.35 
 
 
266 aa  225  5.0000000000000005e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1351  ABC-2 type transporter  47.74 
 
 
272 aa  218  6e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0414359  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1697  ABC-2 type transporter  42.01 
 
 
271 aa  212  4.9999999999999996e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2043  ABC-2 type transporter  42.19 
 
 
279 aa  209  4e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.167343  hitchhiker  0.00685853 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1384  ABC-2 type transporter  41.9 
 
 
269 aa  206  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78336  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4656  ABC-2 type transporter  43.85 
 
 
285 aa  206  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.890125  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3103  ABC transporter protein  41.06 
 
 
280 aa  204  1e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00849207 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2716  ABC-2 type transporter  47.26 
 
 
254 aa  204  2e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22030  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  49.09 
 
 
281 aa  203  2e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6787  ABC-2 type transporter  46.92 
 
 
268 aa  201  9e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000212784  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3893  ABC-2 type transporter  43.15 
 
 
242 aa  200  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0012751  normal  0.0102027 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5259  ABC-2 type transporter  41.2 
 
 
277 aa  199  5e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0393  ABC-2 type transporter  41.37 
 
 
274 aa  197  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2897  ABC-2 type transporter  47.13 
 
 
274 aa  193  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.643507  normal  0.323486 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2021  hypothetical protein  41.91 
 
 
289 aa  191  1e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.290119  normal  0.988573 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6250  ABC-2 type transporter  40.65 
 
 
285 aa  190  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243116  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23570  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  39.62 
 
 
267 aa  188  7e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.24456  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1352  ABC-2 type transporter  45.15 
 
 
254 aa  185  7e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.137638  normal  0.090478 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4551  ABC-2 type transporter  42.26 
 
 
264 aa  181  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1683  ABC-2 type transporter  40.15 
 
 
274 aa  179  4e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000181652  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  39.84 
 
 
269 aa  175  7e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  41.25 
 
 
270 aa  174  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0918  ABC-2 type transporter  40.5 
 
 
254 aa  173  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35420  ABC-type multidrug transport system, permease component  40.24 
 
 
257 aa  173  2.9999999999999996e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0937  ABC-2 type transporter  39.76 
 
 
269 aa  172  5.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1504  ABC-2 type transporter  35.8 
 
 
272 aa  167  2e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.457097  normal  0.179064 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0451  ABC-type multidrug transport system, permease component  38.37 
 
 
269 aa  167  2e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0034336  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0538  ABC-2 type transporter  41.27 
 
 
267 aa  165  5.9999999999999996e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.690834  hitchhiker  0.000010786 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0340  ABC-2 type transporter  38.38 
 
 
273 aa  157  2e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.171685  hitchhiker  0.00234396 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1937  ABC-2 type transporter  34.78 
 
 
284 aa  155  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.008119  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1483  ABC-2 type transporter  38.46 
 
 
269 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00140227  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0666  ABC-2 type transporter  36.73 
 
 
285 aa  151  8.999999999999999e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3922  ABC-2 type transporter  34.54 
 
 
266 aa  151  8.999999999999999e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0348636  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4092  ABC-2 type transporter  34.39 
 
 
290 aa  149  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0130357  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39010  ABC-type multidrug transport system, permease component  34.12 
 
 
271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.436846 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4259  ABC-2 type transporter  35.71 
 
 
282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4345  ABC-2 type transporter  35.71 
 
 
282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0911686 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4638  ABC-2 type transporter  35.71 
 
 
282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.619797  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1476  ABC-2 type transporter  37.4 
 
 
267 aa  147  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1839  ABC-2 type transporter  34.39 
 
 
266 aa  145  9e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1878  ABC-2 type transporter  38.75 
 
 
273 aa  143  3e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4795  ABC-2 type transporter  35.74 
 
 
284 aa  143  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.597944 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3718  ABC-2 type transporter  32.27 
 
 
260 aa  138  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282288  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4512  ABC-2 type transporter  33.46 
 
 
281 aa  134  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0618  ABC-2 type transporter  35.94 
 
 
267 aa  134  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.099686  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3101  ABC-2 type transporter  37.31 
 
 
266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07250  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  34.25 
 
 
265 aa  133  3e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.307058 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3986  ABC-2 type transporter  33.99 
 
 
280 aa  132  5e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0895  ABC-2 type transporter  40.09 
 
 
266 aa  131  9e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7215  ABC transporter (permease)  35.51 
 
 
247 aa  128  9.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19160  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  33.05 
 
 
319 aa  128  9.000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.338631 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0039  ABC-2 type transporter  34.13 
 
 
267 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2016  ABC-2 type transporter  33.89 
 
 
268 aa  126  5e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3132  ABC-2 type transporter  33.77 
 
 
248 aa  121  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.571081  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1743  ABC-2 type transporter  39.32 
 
 
271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000246748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4183  ABC-2 type transporter  34.34 
 
 
269 aa  119  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0674  ABC-2 type transporter  33.64 
 
 
272 aa  118  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4383  ABC-2 type transporter  32.92 
 
 
253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8859  ABC transporter permease  32.5 
 
 
253 aa  116  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0542  ABC-2 type transporter  30.86 
 
 
253 aa  115  8.999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0014  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 
304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1258  ABC-2 type transporter  34.21 
 
 
300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1034  ABC-2 type transporter  31.25 
 
 
254 aa  113  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.489208  normal  0.0976555 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24940  ABC-type multidrug transport system, permease component  30.04 
 
 
284 aa  112  4.0000000000000004e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.484855 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3467  ABC transporter, efflux permease protein  31.96 
 
 
249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000810233  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1123  ABC-2 type transporter  35.32 
 
 
275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3016  ABC-2 type transporter  32.08 
 
 
254 aa  110  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.021308 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0058  ABC-2 type transporter  33.02 
 
 
271 aa  109  4.0000000000000004e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3438  ABC transporter, efflux permease protein  32.88 
 
 
249 aa  109  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3149  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  31.96 
 
 
249 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0286068  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1808  ABC transporter, efflux permease protein  32.42 
 
 
249 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3147  ABC-2 type transporter  32.02 
 
 
249 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.145802  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3239  ABC transporter efflux permease  31.46 
 
 
249 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3453  ABC transporter, efflux permease protein  31.46 
 
 
249 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3492  ABC transporter permease  31.46 
 
 
249 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.799548  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0375  ABC-2 type transporter  30.96 
 
 
264 aa  107  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133292  hitchhiker  0.00534901 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1684  ABC-2 type transporter  31.82 
 
 
251 aa  106  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3446  ABC transporter, efflux permease protein  31.46 
 
 
249 aa  105  6e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00692281  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0497  ABC-2 type transporter  30.85 
 
 
286 aa  105  1e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8158  ABC-2 type transporter  29.92 
 
 
272 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.880228 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3212  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  31.96 
 
 
249 aa  104  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4761  ABC-2 type transporter  31.5 
 
 
261 aa  103  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000109025  hitchhiker  0.000621886 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4106  ABC-2 type transporter  33.18 
 
 
293 aa  103  4e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5654  ABC-2 type transporter  33.6 
 
 
267 aa  102  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>