More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0300 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0300  ABC-2 type transporter  100 
 
 
270 aa  521  1e-147  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  56.93 
 
 
288 aa  300  1e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  52.96 
 
 
284 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4031  ABC-2 type transporter  54.51 
 
 
289 aa  279  3e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.246164  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5103  ABC-2 type transporter  50 
 
 
281 aa  259  2e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00233057  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2298  daunorubicin resistance ABC transporter membrane protein  51.38 
 
 
264 aa  231  1e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.207913  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4739  ABC-2 type transporter  40.89 
 
 
285 aa  202  4e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  45.09 
 
 
254 aa  195  6e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0559  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  43.01 
 
 
264 aa  193  3e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0380  ABC-2 type transporter  43.4 
 
 
280 aa  186  5e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  44.71 
 
 
249 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  45.19 
 
 
249 aa  179  4e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  42.06 
 
 
250 aa  175  6e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  41.59 
 
 
251 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  38.03 
 
 
249 aa  170  3e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1125  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  45.5 
 
 
260 aa  169  6e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.742933  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2893  ABC-2 type transporter  39.04 
 
 
270 aa  165  5.9999999999999996e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0037  ABC-2 type transporter  40.69 
 
 
255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  37.16 
 
 
253 aa  162  4.0000000000000004e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1528  hypothetical protein  41.23 
 
 
249 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2561  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  40.76 
 
 
249 aa  160  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1459  ABC-2 type transporter  41.63 
 
 
249 aa  154  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0426  ABC-2 type transporter  39.91 
 
 
256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2221  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  37.79 
 
 
273 aa  144  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000454003  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  34.86 
 
 
255 aa  144  1e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  33.08 
 
 
253 aa  142  6e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  31.92 
 
 
253 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  34.53 
 
 
254 aa  138  7.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  31.92 
 
 
253 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0215  ABC-2 type transporter  35.98 
 
 
275 aa  135  5e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.716105  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1426  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  34.47 
 
 
256 aa  135  8e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0562869  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1380  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  34.47 
 
 
256 aa  135  8e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000932687  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2499  ABC-2 transporter component  36.29 
 
 
276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0062  ABC-2 type transporter  33.02 
 
 
260 aa  129  7.000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566487  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0476  ABC transporter  30.42 
 
 
261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0918062 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1170  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  33.33 
 
 
253 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2250  ABC-2 type transporter  32.05 
 
 
256 aa  122  5e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.239998  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2613  ABC-2 type transporter  30.84 
 
 
270 aa  122  8e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.937981  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0899  ABC transporter, inner membrane subunit  39.23 
 
 
287 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.208954  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3931  ABC-2 type transporter  31 
 
 
263 aa  120  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.284935  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1245  ABC-2 type transporter  33.48 
 
 
292 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0464218  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0249  hypothetical protein  33.33 
 
 
281 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2587  ABC multidrug efflux transporter, inner membrane subunit  33.48 
 
 
286 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1478  ABC-2 type transporter  31.11 
 
 
254 aa  119  6e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5948  ABC transporter permease  33.64 
 
 
284 aa  119  7.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0673459  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1789  ABC-2 type transporter  39.25 
 
 
261 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1861  ABC-2 type transporter  32.74 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0948  ABC-2 type transporter  38.76 
 
 
287 aa  116  5e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0389515  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0242  ABC-2 type transporter  32 
 
 
278 aa  115  5e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2328  transporter, putative  37.07 
 
 
246 aa  116  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.117528  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0025  ABC-2 type transporter  31.76 
 
 
290 aa  116  5e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0950  ABC-2 type transporter  38.76 
 
 
288 aa  116  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0010  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 
280 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2261  ABC-2 type transporter  32.13 
 
 
260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.121091  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2186  ABC-2 type transporter  30.04 
 
 
297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.189047 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1851  ABC-2 type transporter  30.04 
 
 
297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.894723 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1281  ABC transporter, permease protein  34.22 
 
 
267 aa  113  3e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.640698  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1802  ABC-2 type transporter  28.76 
 
 
293 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217297  normal  0.454939 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3136  ABC-2 type transporter  32.03 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1894  putative daunorubicin resistance ABC transporter, permease protein  30.34 
 
 
260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00976323  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0723  ABC-2 type transporter  30.83 
 
 
272 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0756908 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2171  ABC-2 type transporter  31.22 
 
 
256 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1766  multidrug ABC transporter, permease protein  28.45 
 
 
242 aa  109  5e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0230  ABC-2 type transporter  28.89 
 
 
256 aa  108  9.000000000000001e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1936  ABC-2 type transporter  32.29 
 
 
286 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0685  ABC transporter, permease protein  27.82 
 
 
277 aa  108  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.537478  normal  0.14182 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5312  ABC-2 type transporter  29.87 
 
 
292 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.91396  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  29.81 
 
 
261 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000233601  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0945  ABC transporter related  35.32 
 
 
665 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5008  ABC-2 type transporter  29.61 
 
 
290 aa  106  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0701746  normal  0.113041 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1561  ABC-2 type transporter  32.67 
 
 
252 aa  105  7e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.403911  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2667  ABC transporter  32.6 
 
 
263 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0137793  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3096  ABC-2 type transporter  32.6 
 
 
263 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3036  ABC-2 type transporter  30.7 
 
 
295 aa  104  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1034  ABC-2 type transporter  29.57 
 
 
256 aa  103  2e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.150436 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0030  ABC-2 type transporter  31.31 
 
 
272 aa  104  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2668  putative ABC-2 type transporter  30.04 
 
 
263 aa  104  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.149875  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2716  ABC-2 type transporter  30.56 
 
 
297 aa  103  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.722099  normal  0.404026 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0427  ABC-2 type transporter  27.9 
 
 
278 aa  102  5e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.469533  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0251  ABC-2 type transporter  29.17 
 
 
255 aa  101  1e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.452318 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2845  ABC-2 type transporter  32.17 
 
 
269 aa  101  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0354167  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2794  hypothetical protein  29.41 
 
 
276 aa  101  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0995371 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2013  ABC-2 type transporter  28.38 
 
 
256 aa  100  3e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.0000119274  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1796  ABC-2 type transporter  30.13 
 
 
280 aa  99.8  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000116393 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  27.63 
 
 
290 aa  99  6e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0010  ABC-2 type transporter  32.05 
 
 
277 aa  99  7e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0265688  normal  0.974707 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2515  ABC transporter, permease protein  27.17 
 
 
278 aa  97.1  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2590  efflux ABC transporter, permease protein  30.84 
 
 
275 aa  94  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.717698  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2251  putative ABC transport system, membrane protein  37.56 
 
 
246 aa  92.8  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.713684  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2056  ABC-2 type transporter, permease protein  37.56 
 
 
246 aa  92.8  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2111  ABC-2 type transporter, permease protein  37.56 
 
 
246 aa  92.8  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1203  ABC-2 type transporter  24.19 
 
 
251 aa  90.5  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0595438 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0998  transporter, putative  36.59 
 
 
246 aa  89  7e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.19161  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0287  hypothetical protein  26.37 
 
 
241 aa  89  8e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.301015  normal  0.184502 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1945  ABC-2 type transporter  32.03 
 
 
263 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0850168  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4979  ABC-2 type transporter  31.84 
 
 
274 aa  87.4  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2056  ABC-2 type transporter  28.23 
 
 
241 aa  86.7  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.794734  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0014  ABC-2 type transporter  29.57 
 
 
304 aa  86.7  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0462  nodulation protein J  29.86 
 
 
268 aa  85.5  7e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.266154  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0176  hypothetical protein  29.17 
 
 
241 aa  83.2  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.67071  normal  0.0449558 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>