More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1686 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  100 
 
 		 280 aa  547  1e-155  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  65.52 
 
 		 276 aa  353  1e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4005  ABC-2 type transporter  46.62 
 
 		 280 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101832  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3623  ABC-2 type transporter  47.33 
 
 		 280 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7344  ABC-2 type transporter  47.69 
 
 		 306 aa  243  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0101042 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2681  ABC-2 type transporter  44.19 
 
 		 285 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0511  ABC-2 type transporter  48.46 
 
 		 266 aa  237  1e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4396  ABC-2 type transporter  47.67 
 
 		 272 aa  231  8.000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  46.49 
 
 		 281 aa  228  9e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0671  ABC-2 type transporter  45.49 
 
 		 278 aa  227  1e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000519244  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0348  ABC-2 type transporter  47.67 
 
 		 284 aa  223  4e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0113875  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29920  ABC-type multidrug transport system, permease component  46.36 
 
 		 285 aa  221  8e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.207401  normal  0.6858 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3172  ABC-2 type transporter  43.66 
 
 		 279 aa  215  5e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1028  ABC-2 type transporter  41.41 
 
 		 275 aa  168  7e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.321996  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7157  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  29.66 
 
 		 278 aa  112  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.024158 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33060  ABC-type multidrug transport system, permease component  30.57 
 
 		 287 aa  108  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.486477  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4560  ABC-2 type transporter  33.2 
 
 		 257 aa  105  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3163  ABC-2 type transporter  32.45 
 
 		 283 aa  104  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0455914 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3388  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 283 aa  99  9e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.270773  normal  0.0856253 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4303  ABC-2 type transporter  30.38 
 
 		 287 aa  97.1  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  30.22 
 
 		 261 aa  90.5  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1192  ABC-2 type transporter  28.95 
 
 		 257 aa  82  0.000000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2399  ABC-2 type transporter  31.19 
 
 		 241 aa  79.7  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000992199  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2079  ABC-2 type transporter  29.1 
 
 		 269 aa  78.6  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.524343  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1123  ABC-2 type transporter  29.8 
 
 		 257 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0143  ABC-2 type transporter  25.19 
 
 		 285 aa  75.9  0.0000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.1102 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3543  ABC-2 type transporter  31.64 
 
 		 246 aa  75.5  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187999  normal  0.524655 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0096  ABC-2 type transporter  29.49 
 
 		 247 aa  75.1  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  27.59 
 
 		 253 aa  74.3  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2250  ABC-2 type transporter  28.88 
 
 		 275 aa  74.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130225 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3298  ABC-2 type transporter  30.59 
 
 		 257 aa  74.7  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2484  ABC-2 type transporter  31.25 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.308148  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  26.82 
 
 		 375 aa  73.9  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0825  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  26.1 
 
 		 261 aa  73.6  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0363  ABC-2 type transporter  29.8 
 
 		 289 aa  73.2  0.000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  26.55 
 
 		 251 aa  73.2  0.000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2219  ABC-2 type transporter  28.24 
 
 		 261 aa  72.8  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000229601  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2945  ABC-2 type transporter  30.46 
 
 		 378 aa  72.8  0.000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.485374  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00759  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  30.46 
 
 		 368 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2850  ABC-2 type transporter  30.46 
 
 		 368 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.146675  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0856  ABC-2 type transporter, permease protein  30.46 
 
 		 368 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00776  hypothetical protein  30.46 
 
 		 368 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1518  ABC-2 type transporter  29.8 
 
 		 378 aa  71.2  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0939  ABC-2 type transporter, permease protein  30.46 
 
 		 368 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0846  ABC-2 type transporter, permease protein  30.46 
 
 		 368 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0814  ABC-2 type transporter, permease protein  30.46 
 
 		 368 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547864  normal  0.91145 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  29.82 
 
 		 366 aa  71.2  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2851  ABC-2 type transporter  30.46 
 
 		 368 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579888 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2561  ABC-2 type transporter, permease protein  30.46 
 
 		 368 aa  70.9  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0275  ABC-2 type transporter  27.96 
 
 		 231 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2100  ABC-2 type transporter  28.23 
 
 		 252 aa  70.9  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0910  ABC transporter permease  29.8 
 
 		 368 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.881818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0942  ABC-2 type transporter, permease  29.8 
 
 		 368 aa  69.7  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0820172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0850  ABC-2 type transporter, permease protein  29.8 
 
 		 368 aa  69.7  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0963  ABC-2 type transporter permease  29.8 
 
 		 368 aa  69.7  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0878  ABC-2 type transporter, permease protein  29.8 
 
 		 368 aa  69.7  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2903  ABC-2 type transporter  29.8 
 
 		 368 aa  69.7  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.751562  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2815  ABC transporter, permease protein  29.8 
 
 		 368 aa  69.7  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3004  ABC-2 type transporter  25.8 
 
 		 259 aa  69.3  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000399849  hitchhiker  0.000157522 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2584  ABC-2 type transporter  27.24 
 
 		 251 aa  68.9  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  normal  0.0868823 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0497  ABC-2 type transporter  24.88 
 
 		 286 aa  68.6  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1326  ABC-2 type transporter  29.8 
 
 		 368 aa  68.6  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  23.87 
 
 		 360 aa  68.2  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3695  ABC-2 type transporter  26.51 
 
 		 250 aa  68.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.869493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3044  ABC-2 type transporter  26.96 
 
 		 269 aa  68.2  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.375207 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1283  ABC-2 type transporter  29.05 
 
 		 368 aa  68.6  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2343  ABC-2 type transporter  28.14 
 
 		 304 aa  67.8  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.299179 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0966  ABC-2 type transporter  26.36 
 
 		 259 aa  68.2  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24940  ABC-type multidrug transport system, permease component  25.46 
 
 		 284 aa  67.4  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.484855 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3145  ABC-2 type transporter  26.12 
 
 		 283 aa  67.4  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000295495  normal  0.0421989 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3137  ABC-2 type transporter  26.78 
 
 		 277 aa  67.8  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.428202  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0014  ABC-2 type transporter  26.85 
 
 		 304 aa  67.4  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9333  hypothetical protein  27.2 
 
 		 244 aa  67  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0327  ABC-2 type transporter  29.3 
 
 		 251 aa  67  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.461338  normal  0.0259517 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3408  ABC-2 type transporter, permease protein  26.39 
 
 		 243 aa  67  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184246  normal  0.618546 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2429  ABC-2 type transporter  26.73 
 
 		 251 aa  67  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0140653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06320  ABC-2 type transporter  28.24 
 
 		 271 aa  66.6  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.458659  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  23.42 
 
 		 339 aa  66.2  0.0000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.57 
 
 		 254 aa  64.7  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4064  ABC-2 type transporter  33.55 
 
 		 371 aa  64.7  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0655  ABC-2 type transporter  27.19 
 
 		 273 aa  64.7  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.121363  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  24.72 
 
 		 360 aa  64.7  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_718  ABC transporter, permease protein  25.85 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000115983  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0062  ABC-2 type transporter  25.71 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566487  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3574  ABC-2 type transporter  24.69 
 
 		 443 aa  63.9  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2514  ABC-2 type transporter  27.7 
 
 		 374 aa  63.5  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.936785  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2544  ABC-2 type transporter  24.63 
 
 		 265 aa  63.5  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.408574  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2803  ABC-2 type transporter  32.27 
 
 		 252 aa  63.9  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363524  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4081  ABC-2 type transporter  24.51 
 
 		 274 aa  63.5  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.431533 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2367  hypothetical protein  31.29 
 
 		 370 aa  63.5  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.175245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1079  ABC-2 type transporter  32.82 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  24.88 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0734  ABC-2 type transporter  26.34 
 
 		 241 aa  63.2  0.000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00105629  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1448  putative ABC transporter transmembrane protein  27.62 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2794  hypothetical protein  28.95 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0995371 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1483  ABC-2 type transporter  23.19 
 
 		 269 aa  63.2  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00140227  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3986  ABC-2 type transporter  28.35 
 
 		 280 aa  62.8  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3106  ABC-2 type transporter  26.55 
 
 		 278 aa  62.8  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708923  hitchhiker  0.000220198 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  26.15 
 
 		 269 aa  62.4  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2829  daunorubicin resistance protein C  27.49 
 
 		 287 aa  62.4  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.212712  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>