53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_06320 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_06320  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 271 aa  518  1e-146  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.458659  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3004  ABC-2 type transporter  36.14 
 
 		 259 aa  145  8.000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000399849  hitchhiker  0.000157522 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1722  ABC transporter protein  39.91 
 
 		 241 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.611167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0761  ABC-2 type transporter  28.7 
 
 		 241 aa  99  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.378108 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5036  ABC transporter, permease  28.21 
 
 		 244 aa  89.7  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5052  ABC transporter, permease  28.21 
 
 		 244 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1639  ABC-2 type transporter  30 
 
 		 246 aa  89.4  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5446  putative ABC transporter, permease protein  28.21 
 
 		 244 aa  89  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3873  ABC-2 type transporter  27.35 
 
 		 244 aa  89  7e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.249696  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5533  putative ABC transporter, permease protein  28.21 
 
 		 244 aa  89  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5152  ABC-2 type transporter  28.63 
 
 		 244 aa  89  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5202  ABC transporter permease  27.78 
 
 		 244 aa  88.6  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5599  ABC transporter permease  27.78 
 
 		 244 aa  88.6  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5477  putative ABC transporter, permease protein  28.76 
 
 		 244 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.975667  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5475  putative ABC transporter, permease protein  28.76 
 
 		 244 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.782818  hitchhiker  0.000000000276191 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5484  ABC transporter, permease protein, putative  27.78 
 
 		 244 aa  87  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0288  ABC-2 type transporter  28.34 
 
 		 265 aa  76.6  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311075  normal  0.205657 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01010  ABC-type multidrug transport system, permease component  28.35 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1408  ABC-2 type transporter  23.66 
 
 		 243 aa  71.6  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0360558  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1381  ABC-2 type transporter  23.66 
 
 		 243 aa  71.6  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000108587  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  27.96 
 
 		 280 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16230  ABC-2 type transporter  28.69 
 
 		 264 aa  69.3  0.00000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.362441  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0653  ABC-2 type transporter  26.36 
 
 		 250 aa  65.1  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0887  ABC transporter, permease protein  22.65 
 
 		 243 aa  63.5  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00136851  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1939  ABC-2 type transporter  30.47 
 
 		 242 aa  63.2  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1906  ABC-2 type transporter  24.04 
 
 		 250 aa  62.4  0.000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.228085 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  28.69 
 
 		 276 aa  60.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0193  ABC-2 type transporter  26.18 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.125467 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1905  ABC-2 type transporter  28.5 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0309  hypothetical protein  28.22 
 
 		 246 aa  55.8  0.0000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.572414  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1292  ABC-type multidrug transport system, permease component  25.23 
 
 		 245 aa  53.9  0.000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000120577  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1889  ABC-2 type transporter  27.84 
 
 		 413 aa  52.4  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7344  ABC-2 type transporter  24.88 
 
 		 306 aa  52.4  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0101042 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  28.28 
 
 		 281 aa  50.1  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3448  ABC-2 type transporter  33.66 
 
 		 271 aa  50.1  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0600663 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02220  ABC-2 type transporter  31.53 
 
 		 245 aa  49.7  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0256  ABC-2 type transporter  27.67 
 
 		 258 aa  48.9  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.32232 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4024  ABC-2 type transporter  27.72 
 
 		 266 aa  48.9  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.410206 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7215  ABC transporter (permease)  25 
 
 		 247 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3163  ABC-2 type transporter  29.94 
 
 		 283 aa  46.6  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0455914 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4668  ABC-type multidrug transport system, permease component  30.69 
 
 		 146 aa  45.4  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.380782  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36170  ABC-type multidrug transport system, permease component  30.1 
 
 		 258 aa  44.7  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14580  ABC-type multidrug transport system, permease component  27.34 
 
 		 264 aa  44.3  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3408  ABC-2 type transporter, permease protein  25.43 
 
 		 243 aa  43.5  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184246  normal  0.618546 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0344  ABC-2 type transporter  25.11 
 
 		 261 aa  43.9  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.261927  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0185  ABC-2 type transporter  26.77 
 
 		 265 aa  43.9  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.361684  normal  0.861322 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1533  ABC-2 type transporter  25.62 
 
 		 274 aa  43.5  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6846  ABC-2 type transporter  30.94 
 
 		 430 aa  43.1  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3496  ABC-2 type transporter  25.91 
 
 		 258 aa  43.1  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0058  ABC-2 type transporter  27.78 
 
 		 271 aa  42.7  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29920  ABC-type multidrug transport system, permease component  26.89 
 
 		 285 aa  42.7  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.207401  normal  0.6858 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0380  ABC-2 type transporter  30 
 
 		 280 aa  42.4  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4396  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 272 aa  42.4  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>