98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3004 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3004  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 259 aa  504  9.999999999999999e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000399849  hitchhiker  0.000157522 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0761  ABC-2 type transporter  36.96 
 
 		 241 aa  157  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.378108 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06320  ABC-2 type transporter  36.07 
 
 		 271 aa  155  5.0000000000000005e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.458659  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5484  ABC transporter, permease protein, putative  31.69 
 
 		 244 aa  142  8e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5477  putative ABC transporter, permease protein  31.69 
 
 		 244 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.975667  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5475  putative ABC transporter, permease protein  31.69 
 
 		 244 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.782818  hitchhiker  0.000000000276191 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5533  putative ABC transporter, permease protein  31.69 
 
 		 244 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5202  ABC transporter permease  31.74 
 
 		 244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5036  ABC transporter, permease  30.86 
 
 		 244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5052  ABC transporter, permease  30.86 
 
 		 244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5599  ABC transporter permease  31.74 
 
 		 244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5152  ABC-2 type transporter  32.17 
 
 		 244 aa  139  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5446  putative ABC transporter, permease protein  30.45 
 
 		 244 aa  139  6e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1722  ABC transporter protein  36.52 
 
 		 241 aa  137  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.611167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3873  ABC-2 type transporter  30.43 
 
 		 244 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.249696  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0653  ABC-2 type transporter  33.63 
 
 		 250 aa  132  3.9999999999999996e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1639  ABC-2 type transporter  35.32 
 
 		 246 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0193  ABC-2 type transporter  36.1 
 
 		 241 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.125467 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0288  ABC-2 type transporter  32.67 
 
 		 265 aa  124  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311075  normal  0.205657 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1408  ABC-2 type transporter  27.16 
 
 		 243 aa  116  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0360558  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1381  ABC-2 type transporter  27.16 
 
 		 243 aa  116  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000108587  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0887  ABC transporter, permease protein  25.83 
 
 		 243 aa  107  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00136851  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1939  ABC-2 type transporter  38.89 
 
 		 242 aa  106  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0185  ABC-2 type transporter  34.03 
 
 		 265 aa  106  4e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.361684  normal  0.861322 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1906  ABC-2 type transporter  31.86 
 
 		 250 aa  82.8  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.228085 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0309  hypothetical protein  27 
 
 		 246 aa  82.8  0.000000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.572414  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2608  ABC-2 type transporter  30.5 
 
 		 244 aa  80.1  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000624625  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  25.8 
 
 		 280 aa  78.2  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16230  ABC-2 type transporter  29.71 
 
 		 264 aa  77  0.0000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.362441  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3496  ABC-2 type transporter  32.83 
 
 		 258 aa  76.6  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02220  ABC-2 type transporter  28.63 
 
 		 245 aa  72.8  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7344  ABC-2 type transporter  26.64 
 
 		 306 aa  69.3  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0101042 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4396  ABC-2 type transporter  30.9 
 
 		 272 aa  68.9  0.00000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1266  ABC-2 type transporter  24.02 
 
 		 244 aa  68.2  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.688668 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0511  ABC-2 type transporter  27.65 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01010  ABC-type multidrug transport system, permease component  29.32 
 
 		 255 aa  65.1  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4005  ABC-2 type transporter  26.79 
 
 		 280 aa  65.1  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101832  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1905  ABC-2 type transporter  32.83 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0116  ABC-2 type transporter  31.44 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0506987  normal  0.184799 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1292  ABC-type multidrug transport system, permease component  23.12 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000120577  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2549  hypothetical protein  28.63 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  23.33 
 
 		 276 aa  60.8  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2681  ABC-2 type transporter  27.04 
 
 		 285 aa  59.7  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0256  ABC-2 type transporter  29.44 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.32232 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2399  ABC-2 type transporter  29.91 
 
 		 241 aa  58.5  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000992199  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36170  ABC-type multidrug transport system, permease component  24.18 
 
 		 258 aa  57  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4024  ABC-2 type transporter  23.83 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.410206 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0344  ABC-2 type transporter  27.94 
 
 		 261 aa  55.5  0.0000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.261927  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3623  ABC-2 type transporter  25.31 
 
 		 280 aa  54.7  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2584  ABC-2 type transporter  24.37 
 
 		 251 aa  53.5  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  normal  0.0868823 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0671  ABC-2 type transporter  26.14 
 
 		 278 aa  52.8  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000519244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0761  ABC-type multidrug transport system, permease component  28.26 
 
 		 149 aa  51.6  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00187961  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3044  ABC-2 type transporter  26.64 
 
 		 269 aa  51.6  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.375207 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5132  ABC-2 type transporter  29.87 
 
 		 358 aa  51.6  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.033585  normal  0.150856 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14580  ABC-type multidrug transport system, permease component  30.95 
 
 		 264 aa  50.8  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3695  ABC-2 type transporter  28.19 
 
 		 250 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.869493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2100  ABC-2 type transporter  29.18 
 
 		 252 aa  50.1  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0230  ABC-2 type transporter  25.71 
 
 		 256 aa  50.4  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2429  ABC-2 type transporter  24.87 
 
 		 251 aa  50.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0140653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1990  putative integral membrane transport protein  29.8 
 
 		 261 aa  49.7  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3534  hypothetical protein  22.1 
 
 		 381 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1889  ABC-2 type transporter  27.69 
 
 		 413 aa  48.9  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1028  ABC-2 type transporter  26.07 
 
 		 275 aa  48.1  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.321996  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1806  hypothetical protein  20.44 
 
 		 381 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3448  ABC-2 type transporter  31 
 
 		 271 aa  48.1  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0600663 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4560  ABC-2 type transporter  26.21 
 
 		 257 aa  47.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3163  ABC-2 type transporter  28.06 
 
 		 283 aa  47  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0455914 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  23.53 
 
 		 281 aa  47.4  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1610  multidrug ABC transporter, permease  20.99 
 
 		 381 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.476781  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1917  hypothetical protein  19.89 
 
 		 381 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1451  hypothetical protein  24.73 
 
 		 258 aa  45.8  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.245884  normal  0.0167299 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1660  ABC-2 type transporter  19.89 
 
 		 381 aa  45.8  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102355  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1867  hypothetical protein  20.44 
 
 		 381 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.205494  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5840  ABC-2 type transporter  29.13 
 
 		 367 aa  45.4  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.564028 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2625  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 372 aa  45.4  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4303  ABC-2 type transporter  25.48 
 
 		 287 aa  45.4  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3106  ABC-2 type transporter  27.55 
 
 		 278 aa  45.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708923  hitchhiker  0.000220198 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2171  ABC-2 type transporter  26.22 
 
 		 256 aa  45.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  30.19 
 
 		 360 aa  45.1  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0538  ABC-2 type transporter  25.68 
 
 		 267 aa  44.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.690834  hitchhiker  0.000010786 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0348  ABC-2 type transporter  25.75 
 
 		 284 aa  44.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0113875  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3319  ABC-2 type transporter  31.03 
 
 		 267 aa  44.7  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  30.27 
 
 		 261 aa  44.3  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2367  hypothetical protein  27.68 
 
 		 370 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.175245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0703  ABC-2 type transporter  37.14 
 
 		 363 aa  43.9  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1801  ABC-2 type transporter  30.85 
 
 		 253 aa  43.9  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4761  ABC-2 type transporter  24.45 
 
 		 261 aa  43.9  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000109025  hitchhiker  0.000621886 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  23.44 
 
 		 366 aa  43.5  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  29.25 
 
 		 339 aa  43.1  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2296  hypothetical protein  39.66 
 
 		 103 aa  42.7  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  31.13 
 
 		 360 aa  42.4  0.008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1354  ABC-2 type transporter  50 
 
 		 257 aa  42  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.888329  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1641  multidrug ABC transporter, permease  24.32 
 
 		 381 aa  42  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000991751  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2321  ABC-2 type transporter  25.37 
 
 		 245 aa  42  0.01  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1795  hypothetical protein  20.99 
 
 		 380 aa  42  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1843  hypothetical protein  24.32 
 
 		 381 aa  42  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.668364 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1663  hypothetical protein  20.99 
 
 		 380 aa  42  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0766835  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2219  ABC-2 type transporter  29.92 
 
 		 261 aa  42  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000229601  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>