74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1639 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1639  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 246 aa  459  9.999999999999999e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1722  ABC transporter protein  41.81 
 
 		 241 aa  145  6e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.611167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3004  ABC-2 type transporter  37.24 
 
 		 259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000399849  hitchhiker  0.000157522 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3873  ABC-2 type transporter  32.05 
 
 		 244 aa  122  7e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.249696  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5484  ABC transporter, permease protein, putative  29.91 
 
 		 244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5533  putative ABC transporter, permease protein  29.91 
 
 		 244 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5036  ABC transporter, permease  29.49 
 
 		 244 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5052  ABC transporter, permease  29.49 
 
 		 244 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5477  putative ABC transporter, permease protein  30.34 
 
 		 244 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.975667  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5446  putative ABC transporter, permease protein  29.49 
 
 		 244 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5475  putative ABC transporter, permease protein  30.34 
 
 		 244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.782818  hitchhiker  0.000000000276191 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5202  ABC transporter permease  29.49 
 
 		 244 aa  116  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5599  ABC transporter permease  29.49 
 
 		 244 aa  116  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5152  ABC-2 type transporter  29.91 
 
 		 244 aa  116  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0887  ABC transporter, permease protein  25 
 
 		 243 aa  106  4e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00136851  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0761  ABC-2 type transporter  31.58 
 
 		 241 aa  96.7  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.378108 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06320  ABC-2 type transporter  31.58 
 
 		 271 aa  96.3  4e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.458659  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0653  ABC-2 type transporter  28.45 
 
 		 250 aa  95.9  5e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1381  ABC-2 type transporter  28.29 
 
 		 243 aa  92.8  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000108587  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1408  ABC-2 type transporter  28.29 
 
 		 243 aa  92.8  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0360558  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1939  ABC-2 type transporter  34.83 
 
 		 242 aa  87.4  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0193  ABC-2 type transporter  32.67 
 
 		 241 aa  77  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.125467 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0288  ABC-2 type transporter  35.82 
 
 		 265 aa  76.6  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311075  normal  0.205657 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2549  hypothetical protein  32.97 
 
 		 246 aa  77  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1906  ABC-2 type transporter  31.53 
 
 		 250 aa  70.5  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.228085 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0185  ABC-2 type transporter  29.24 
 
 		 265 aa  65.9  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.361684  normal  0.861322 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3496  ABC-2 type transporter  32.5 
 
 		 258 aa  65.1  0.0000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0309  hypothetical protein  23.86 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.572414  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1266  ABC-2 type transporter  26.84 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.688668 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2100  ABC-2 type transporter  29.59 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0340  ABC-2 type transporter  28.87 
 
 		 273 aa  54.7  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.171685  hitchhiker  0.00234396 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0701  hypothetical protein  28.96 
 
 		 242 aa  53.9  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.320058  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2343  ABC-2 type transporter  31.22 
 
 		 304 aa  53.9  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.299179 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5588  ABC-2 type transporter  26.34 
 
 		 261 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  24.65 
 
 		 280 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1990  putative integral membrane transport protein  29.21 
 
 		 261 aa  50.1  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10730  ABC-2 type transporter  43.1 
 
 		 393 aa  50.4  0.00003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2250  ABC-2 type transporter  26.63 
 
 		 275 aa  49.3  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130225 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4024  ABC-2 type transporter  29.86 
 
 		 266 aa  49.7  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.410206 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1730  hypothetical protein  26.15 
 
 		 251 aa  48.9  0.00007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.45161 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1905  ABC-2 type transporter  30.35 
 
 		 255 aa  48.1  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0561  hypothetical protein  32.04 
 
 		 411 aa  47  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  29.95 
 
 		 261 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7344  ABC-2 type transporter  25.32 
 
 		 306 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0101042 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2399  ABC-2 type transporter  26.11 
 
 		 241 aa  47  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000992199  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5132  ABC-2 type transporter  29.27 
 
 		 358 aa  46.2  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.033585  normal  0.150856 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0674  ABC-2 type transporter  29.75 
 
 		 272 aa  46.6  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3448  ABC-2 type transporter  41.05 
 
 		 271 aa  46.6  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0600663 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0014  ABC transporter permease  30.32 
 
 		 251 aa  46.2  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.189407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0552  ABC-2 type transporter  28.17 
 
 		 336 aa  46.2  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0511  ABC-2 type transporter  24.52 
 
 		 266 aa  46.2  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3479  ABC transporter protein  26.96 
 
 		 254 aa  46.2  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2219  ABC-2 type transporter  29.67 
 
 		 261 aa  45.8  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000229601  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9333  hypothetical protein  31.65 
 
 		 244 aa  45.4  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01010  ABC-type multidrug transport system, permease component  32.04 
 
 		 255 aa  45.4  0.0009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2608  ABC-2 type transporter  25.64 
 
 		 244 aa  45.4  0.0009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000624625  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2056  ABC-2 type transporter  25.6 
 
 		 241 aa  45.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.794734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1842  ABC-2 type transporter  28.92 
 
 		 269 aa  45.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000710597 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2584  ABC-2 type transporter  30.83 
 
 		 251 aa  45.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  normal  0.0868823 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1034  ABC-2 type transporter  28.63 
 
 		 256 aa  45.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.150436 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3044  ABC-2 type transporter  30.28 
 
 		 269 aa  44.3  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.375207 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3695  ABC-2 type transporter  29.59 
 
 		 250 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.869493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0230  ABC-2 type transporter  23.69 
 
 		 256 aa  43.5  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  26.85 
 
 		 281 aa  43.5  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  24.24 
 
 		 360 aa  43.5  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1917  hypothetical protein  28.14 
 
 		 381 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  25 
 
 		 339 aa  43.1  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16230  ABC-2 type transporter  27.45 
 
 		 264 aa  43.1  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.362441  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2111  ABC-2 type transporter  22.27 
 
 		 237 aa  42.7  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.218796  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36170  ABC-type multidrug transport system, permease component  28.63 
 
 		 258 aa  42.7  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0116  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 247 aa  42.7  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0506987  normal  0.184799 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0256  ABC-2 type transporter  31.82 
 
 		 258 aa  42.4  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.32232 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1654  ABC transporter, permease component  24.56 
 
 		 169 aa  42.4  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.282903  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4092  ABC-2 type transporter  28.23 
 
 		 290 aa  42  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0130357  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>