231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0511 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0511  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 266 aa  517  1e-146  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  50.38 
 
 		 276 aa  250  2e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  48.46 
 
 		 280 aa  243  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4005  ABC-2 type transporter  45.59 
 
 		 280 aa  228  1e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101832  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0671  ABC-2 type transporter  49.62 
 
 		 278 aa  220  1.9999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000519244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7344  ABC-2 type transporter  44.06 
 
 		 306 aa  215  5.9999999999999996e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0101042 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3623  ABC-2 type transporter  44.83 
 
 		 280 aa  214  9.999999999999999e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2681  ABC-2 type transporter  44.32 
 
 		 285 aa  211  7.999999999999999e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4396  ABC-2 type transporter  47.67 
 
 		 272 aa  206  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29920  ABC-type multidrug transport system, permease component  44.44 
 
 		 285 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.207401  normal  0.6858 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  42.48 
 
 		 281 aa  199  3e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0348  ABC-2 type transporter  45 
 
 		 284 aa  193  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0113875  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3172  ABC-2 type transporter  43.35 
 
 		 279 aa  190  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1028  ABC-2 type transporter  43.97 
 
 		 275 aa  171  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.321996  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3163  ABC-2 type transporter  35 
 
 		 283 aa  125  5e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0455914 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3388  ABC-2 type transporter  33.46 
 
 		 283 aa  123  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.270773  normal  0.0856253 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33060  ABC-type multidrug transport system, permease component  35.65 
 
 		 287 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.486477  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7157  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  31.85 
 
 		 278 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.024158 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4303  ABC-2 type transporter  29.46 
 
 		 287 aa  99  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4560  ABC-2 type transporter  30.56 
 
 		 257 aa  97.8  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0143  ABC-2 type transporter  27.8 
 
 		 285 aa  86.3  5e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.1102 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  29.21 
 
 		 360 aa  75.9  0.0000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  29.21 
 
 		 339 aa  74.3  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  27.06 
 
 		 360 aa  72.8  0.000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3543  ABC-2 type transporter  30.31 
 
 		 246 aa  71.2  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187999  normal  0.524655 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3145  ABC-2 type transporter  30.58 
 
 		 283 aa  68.9  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000295495  normal  0.0421989 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  28.63 
 
 		 261 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9333  hypothetical protein  28.92 
 
 		 244 aa  66.2  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4746  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  28.11 
 
 		 232 aa  65.1  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1990  putative integral membrane transport protein  30.47 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2544  ABC-2 type transporter  28.35 
 
 		 265 aa  64.3  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.408574  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  26.7 
 
 		 375 aa  64.7  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3574  ABC-2 type transporter  27.31 
 
 		 443 aa  63.2  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1889  ABC-2 type transporter  27.52 
 
 		 413 aa  63.2  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5840  ABC-2 type transporter  24.52 
 
 		 367 aa  62.8  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.564028 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1192  ABC-2 type transporter  29.96 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  28.71 
 
 		 366 aa  62.4  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3695  ABC-2 type transporter  25.4 
 
 		 250 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.869493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1478  ABC-2 type transporter  22.69 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3004  ABC-2 type transporter  27.65 
 
 		 259 aa  61.2  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000399849  hitchhiker  0.000157522 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3106  ABC-2 type transporter  27.37 
 
 		 278 aa  60.5  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708923  hitchhiker  0.000220198 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4256  ABC-2 type transporter  26.21 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0309  hypothetical protein  23.47 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.572414  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5475  putative ABC transporter, permease protein  24.1 
 
 		 244 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.782818  hitchhiker  0.000000000276191 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4761  ABC-2 type transporter  25.75 
 
 		 261 aa  60.1  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000109025  hitchhiker  0.000621886 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2484  ABC-2 type transporter  28.7 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.308148  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5477  putative ABC transporter, permease protein  23.59 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.975667  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5103  ABC-2 type transporter  26.59 
 
 		 281 aa  59.3  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00233057  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5036  ABC transporter, permease  23.59 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5052  ABC transporter, permease  23.59 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5202  ABC transporter permease  24.1 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5599  ABC transporter permease  24.1 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0327  ABC-2 type transporter  25.35 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.461338  normal  0.0259517 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  22.22 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000233601  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5446  putative ABC transporter, permease protein  23.59 
 
 		 244 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0275  ABC-2 type transporter  26.32 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3044  ABC-2 type transporter  25.12 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.375207 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5533  putative ABC transporter, permease protein  23.59 
 
 		 244 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0703  ABC-2 type transporter  22.6 
 
 		 363 aa  56.6  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  24.85 
 
 		 388 aa  56.6  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0285  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  25.63 
 
 		 356 aa  56.2  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5152  ABC-2 type transporter  23.08 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5484  ABC transporter, permease protein, putative  23.78 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  23.56 
 
 		 384 aa  55.8  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0014  ABC-2 type transporter  24.71 
 
 		 304 aa  55.8  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  24.27 
 
 		 253 aa  55.8  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  24.85 
 
 		 387 aa  55.8  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3548  ABC transporter protein  26.15 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.705683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2079  ABC-2 type transporter  29.07 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.524343  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  23.95 
 
 		 381 aa  55.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0363  ABC-2 type transporter  29.67 
 
 		 289 aa  55.5  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1354  ABC-2 type transporter  35.59 
 
 		 257 aa  55.1  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.888329  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.95 
 
 		 384 aa  54.7  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02220  ABC-2 type transporter  28.17 
 
 		 245 aa  54.7  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3298  ABC-2 type transporter  28.17 
 
 		 257 aa  54.3  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4064  ABC-2 type transporter  26.97 
 
 		 371 aa  54.7  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1477  ABC-2 type transporter  27.33 
 
 		 371 aa  54.3  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0465  ABC transporter, permease protein  27.08 
 
 		 377 aa  53.9  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1781  ABC transporter, inner membrane subunit  26.7 
 
 		 365 aa  53.5  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5132  ABC-2 type transporter  25.6 
 
 		 358 aa  53.9  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.033585  normal  0.150856 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2803  ABC-2 type transporter  26.29 
 
 		 252 aa  53.9  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363524  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1722  ABC transporter protein  28.28 
 
 		 241 aa  53.5  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.611167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  24.85 
 
 		 384 aa  53.5  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2219  ABC-2 type transporter  27.69 
 
 		 261 aa  53.1  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000229601  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2399  ABC-2 type transporter  28.06 
 
 		 241 aa  53.1  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000992199  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  25.75 
 
 		 290 aa  52.4  0.000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0734  ABC-2 type transporter  22.79 
 
 		 241 aa  52.4  0.000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00105629  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0058  ABC-2 type transporter  26 
 
 		 271 aa  52.4  0.000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0887  ABC transporter, permease protein  22.89 
 
 		 243 aa  51.6  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00136851  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2769  ABC-2 type transporter  27.04 
 
 		 413 aa  52  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.160651  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1067  putative ABC transporter, permease protein  24.89 
 
 		 341 aa  52  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0481  ABC-2 type transporter  24.42 
 
 		 267 aa  51.6  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1667  ABC-2 type transporter  24.19 
 
 		 238 aa  51.6  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0141124  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2584  ABC-2 type transporter  23.47 
 
 		 251 aa  51.6  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  normal  0.0868823 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  24.85 
 
 		 384 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1721  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  23.84 
 
 		 380 aa  51.2  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3151  ABC-2 type transporter  26.7 
 
 		 247 aa  51.2  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2429  ABC-2 type transporter  22.96 
 
 		 251 aa  51.2  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0140653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0404  ABC transporter, permease protein  27.64 
 
 		 377 aa  51.2  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0300  ABC-2 type transporter  25.49 
 
 		 270 aa  50.8  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>