242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2219 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_2219  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 261 aa  484  1e-136  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000229601  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1990  putative integral membrane transport protein  65.13 
 
 		 261 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5992  hypothetical protein  69.8 
 
 		 255 aa  300  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125554  normal  0.149158 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  63.98 
 
 		 261 aa  285  5.999999999999999e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2250  ABC-2 type transporter  62.11 
 
 		 275 aa  271  8.000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130225 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2966  ABC-2 type transporter  66.02 
 
 		 279 aa  266  2e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1975  ABC transporter protein  68.24 
 
 		 263 aa  264  1e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2079  ABC-2 type transporter  62.98 
 
 		 269 aa  258  6e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.524343  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2544  ABC-2 type transporter  55.51 
 
 		 265 aa  229  5e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.408574  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2343  ABC-2 type transporter  52.38 
 
 		 304 aa  215  7e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.299179 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2100  ABC-2 type transporter  50.41 
 
 		 252 aa  204  1e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21990  ABC-type multidrug transport system, permease component  48.64 
 
 		 266 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.164668  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2399  ABC-2 type transporter  48.56 
 
 		 241 aa  178  5.999999999999999e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000992199  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1842  ABC-2 type transporter  47.15 
 
 		 269 aa  171  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000710597 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1667  ABC-2 type transporter  54.18 
 
 		 262 aa  170  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0830718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16090  ABC-type multidrug transport system, permease component  49.34 
 
 		 268 aa  170  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.696284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2379  ABC drug efflux pump, inner membrane subunit, DrrB family  46.92 
 
 		 274 aa  169  4e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.866827  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1137  ABC-2 type transporter  45.95 
 
 		 257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.251829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14580  ABC-type multidrug transport system, permease component  43.89 
 
 		 264 aa  159  4e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1354  ABC-2 type transporter  52.87 
 
 		 257 aa  157  1e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.888329  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3681  multidrug ABC transporter inner membrane protein  47.01 
 
 		 259 aa  157  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.332995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13310  ABC-type multidrug transport system, permease component  46.75 
 
 		 245 aa  155  4e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.455926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5163  ABC-2 type transporter  49 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.759639  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2269  ABC-2 type transporter  45.42 
 
 		 266 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00770079  normal  0.0795799 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2920  ABC-2 type transporter  51.56 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2468  multidrug ABC transporter inner membrane protein  47.01 
 
 		 258 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2432  ABC transporter, DrrB efflux protein  46.88 
 
 		 258 aa  149  5e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2477  multidrug ABC transporter inner membrane protein  46.88 
 
 		 258 aa  149  5e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2729  multidrug ABC transporter inner membrane protein  47.01 
 
 		 259 aa  148  7e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11293 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2513  ABC drug efflux pump, inner membrane subunit, DrrB family  44.96 
 
 		 261 aa  148  9e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11460  ABC transporter efflux protein, DrrB family  50 
 
 		 258 aa  142  4e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.160921  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11485  antibiotic ABC transporter membrane protein  42.15 
 
 		 261 aa  140  3e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.574168  normal  0.62449 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0192  ABC-2 type transporter  43.39 
 
 		 244 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  35.65 
 
 		 366 aa  100  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  31.36 
 
 		 360 aa  89  7e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2681  ABC-2 type transporter  31.2 
 
 		 285 aa  87.8  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  31.82 
 
 		 360 aa  87.8  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  30.91 
 
 		 339 aa  86.7  4e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  33.21 
 
 		 281 aa  85.9  5e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0285  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  30.19 
 
 		 356 aa  85.9  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4560  ABC-2 type transporter  28.71 
 
 		 257 aa  85.5  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  31.47 
 
 		 375 aa  83.6  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  27.95 
 
 		 276 aa  79.7  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4005  ABC-2 type transporter  28.19 
 
 		 280 aa  78.6  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101832  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  28.24 
 
 		 280 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7344  ABC-2 type transporter  29.02 
 
 		 306 aa  76.6  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0101042 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3172  ABC-2 type transporter  31.95 
 
 		 279 aa  75.5  0.0000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29920  ABC-type multidrug transport system, permease component  30.12 
 
 		 285 aa  75.5  0.0000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.207401  normal  0.6858 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5840  ABC-2 type transporter  27.75 
 
 		 367 aa  74.7  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.564028 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0703  ABC-2 type transporter  29.06 
 
 		 363 aa  73.6  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3623  ABC-2 type transporter  27.52 
 
 		 280 aa  73.2  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4396  ABC-2 type transporter  31.92 
 
 		 272 aa  72.4  0.000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0476  ABC transporter  26.64 
 
 		 261 aa  71.6  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0918062 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0671  ABC-2 type transporter  30.19 
 
 		 278 aa  67.4  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000519244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  27.45 
 
 		 270 aa  65.5  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0538  ABC-2 type transporter  27.05 
 
 		 267 aa  64.7  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.690834  hitchhiker  0.000010786 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0348  ABC-2 type transporter  28.16 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0113875  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0014  ABC-2 type transporter  26.42 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153169  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0150  ABC-2 type transporter  22.83 
 
 		 338 aa  62.4  0.000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0013  ABC-2 type transporter  25.91 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.67 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1478  ABC-2 type transporter  24.14 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2939  ABC-2 type transporter  27.82 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.27677 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1483  ABC-2 type transporter  23.85 
 
 		 269 aa  60.1  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00140227  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  24.58 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3736  ABC-2 type transporter  27.75 
 
 		 263 aa  58.5  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5103  ABC-2 type transporter  25.89 
 
 		 281 aa  58.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00233057  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3298  ABC-2 type transporter  28.33 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0275  ABC-2 type transporter  30.36 
 
 		 231 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1206  ABC-2 type transporter  28.1 
 
 		 243 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  26.79 
 
 		 288 aa  58.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8859  ABC transporter permease  26.5 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0966  ABC-2 type transporter  27.83 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1528  hypothetical protein  25.87 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  28.84 
 
 		 284 aa  57.4  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1459  ABC-2 type transporter  27.44 
 
 		 249 aa  57  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.43 
 
 		 249 aa  57  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2298  daunorubicin resistance ABC transporter membrane protein  28.49 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.207913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1034  ABC-2 type transporter  25.61 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.489208  normal  0.0976555 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0511  ABC-2 type transporter  28.19 
 
 		 266 aa  56.2  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0887  ABC transporter, permease protein  24.17 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00136851  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2561  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25.76 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3149  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  24.36 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0286068  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0062  ABC-2 type transporter  25.69 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566487  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1937  ABC-2 type transporter  23.83 
 
 		 284 aa  55.5  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.008119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1381  ABC-2 type transporter  25.6 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000108587  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1408  ABC-2 type transporter  25.6 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0360558  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0542  ABC-2 type transporter  23.08 
 
 		 253 aa  55.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0746  ABC-2 type transporter  25.94 
 
 		 280 aa  54.7  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1808  ABC transporter, efflux permease protein  24.68 
 
 		 249 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3147  ABC-2 type transporter  23.71 
 
 		 249 aa  54.7  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.145802  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5132  ABC-2 type transporter  29 
 
 		 358 aa  54.7  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.033585  normal  0.150856 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4512  ABC-2 type transporter  25.2 
 
 		 281 aa  54.3  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3695  ABC-2 type transporter  30.38 
 
 		 250 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.869493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9333  hypothetical protein  31.68 
 
 		 244 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3467  ABC transporter, efflux permease protein  23.08 
 
 		 249 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000810233  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3873  ABC-2 type transporter  22.22 
 
 		 244 aa  53.9  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.249696  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2148  putative ABC transporter, permease protein  27.09 
 
 		 327 aa  53.9  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249033  normal  0.497773 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24940  ABC-type multidrug transport system, permease component  25.5 
 
 		 284 aa  53.5  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.484855 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2250  ABC-2 type transporter  25.45 
 
 		 256 aa  53.5  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.239998  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>