72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_4024 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_4024  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 266 aa  517  1e-146  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.410206 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36170  ABC-type multidrug transport system, permease component  61.75 
 
 		 258 aa  306  2.0000000000000002e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3448  ABC-2 type transporter  58.36 
 
 		 271 aa  277  1e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0600663 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4202  hypothetical protein  44.94 
 
 		 245 aa  190  2e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2549  hypothetical protein  40.5 
 
 		 246 aa  163  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2608  ABC-2 type transporter  34.14 
 
 		 244 aa  122  9e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000624625  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1266  ABC-2 type transporter  32.93 
 
 		 244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.688668 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1906  ABC-2 type transporter  32.62 
 
 		 250 aa  78.6  0.00000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.228085 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1722  ABC transporter protein  32.37 
 
 		 241 aa  75.1  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.611167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0185  ABC-2 type transporter  28.09 
 
 		 265 aa  70.1  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.361684  normal  0.861322 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5484  ABC transporter, permease protein, putative  20.68 
 
 		 244 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5477  putative ABC transporter, permease protein  20.68 
 
 		 244 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.975667  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5475  putative ABC transporter, permease protein  20.68 
 
 		 244 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.782818  hitchhiker  0.000000000276191 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5052  ABC transporter, permease  20.25 
 
 		 244 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5533  putative ABC transporter, permease protein  20.25 
 
 		 244 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5036  ABC transporter, permease  20.25 
 
 		 244 aa  65.1  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5202  ABC transporter permease  20.25 
 
 		 244 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5599  ABC transporter permease  20.25 
 
 		 244 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5446  putative ABC transporter, permease protein  20.25 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5152  ABC-2 type transporter  19.83 
 
 		 244 aa  61.6  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3873  ABC-2 type transporter  18.99 
 
 		 244 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.249696  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1408  ABC-2 type transporter  21.46 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0360558  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1381  ABC-2 type transporter  21.46 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000108587  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0895  ABC-2 type transporter  29.32 
 
 		 266 aa  55.5  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0746  ABC-2 type transporter  28.25 
 
 		 280 aa  55.5  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  30.77 
 
 		 269 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3004  ABC-2 type transporter  24.71 
 
 		 259 aa  54.3  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000399849  hitchhiker  0.000157522 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0193  ABC-2 type transporter  27.13 
 
 		 241 aa  53.5  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.125467 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2021  hypothetical protein  28.65 
 
 		 289 aa  53.5  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.290119  normal  0.988573 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0937  ABC-2 type transporter  32.47 
 
 		 269 aa  53.5  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0538  ABC-2 type transporter  24.6 
 
 		 267 aa  53.1  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.690834  hitchhiker  0.000010786 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  28.38 
 
 		 280 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0618  ABC-2 type transporter  23.89 
 
 		 267 aa  50.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.099686  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0309  hypothetical protein  25 
 
 		 246 aa  49.3  0.00007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.572414  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  26.36 
 
 		 270 aa  48.9  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06320  ABC-2 type transporter  28.72 
 
 		 271 aa  48.1  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.458659  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0761  ABC-2 type transporter  20.09 
 
 		 241 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.378108 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1137  ABC-2 type transporter  27.55 
 
 		 257 aa  47.8  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.251829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1937  ABC-2 type transporter  29.15 
 
 		 284 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.008119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4795  ABC-2 type transporter  28.06 
 
 		 284 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597944 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0288  ABC-2 type transporter  32.35 
 
 		 265 aa  47  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311075  normal  0.205657 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1755  ABC-2 type transporter  25.86 
 
 		 264 aa  46.2  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.586856  decreased coverage  0.00328589 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1476  ABC-2 type transporter  28.02 
 
 		 267 aa  46.2  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0653  ABC-2 type transporter  21.4 
 
 		 250 aa  45.8  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3922  ABC-2 type transporter  25.77 
 
 		 266 aa  45.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0348636  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3044  ABC-2 type transporter  24.22 
 
 		 269 aa  45.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.375207 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0344  ABC-2 type transporter  30.48 
 
 		 261 aa  44.7  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.261927  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2399  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 241 aa  44.3  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000992199  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4936  ABC-2 type transporter  26.36 
 
 		 280 aa  44.3  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.707728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0256  ABC-2 type transporter  28.97 
 
 		 258 aa  44.3  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.32232 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1622  ABC-2 type transporter  27.23 
 
 		 278 aa  44.3  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0655  ABC-2 type transporter  25.98 
 
 		 273 aa  43.9  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.121363  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02220  ABC-2 type transporter  27.63 
 
 		 245 aa  44.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0013  ABC-2 type transporter  28.15 
 
 		 251 aa  43.5  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07250  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  30.51 
 
 		 265 aa  43.9  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.307058 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4512  ABC-2 type transporter  23.4 
 
 		 281 aa  43.9  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6250  ABC-2 type transporter  26.13 
 
 		 285 aa  43.5  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0014  ABC-2 type transporter  28.15 
 
 		 251 aa  43.5  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153169  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35420  ABC-type multidrug transport system, permease component  24.19 
 
 		 257 aa  43.1  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4656  ABC-2 type transporter  25.73 
 
 		 285 aa  43.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.890125  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  26.34 
 
 		 276 aa  43.1  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 360 aa  43.1  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1122  ABC-2 type transporter  25.76 
 
 		 285 aa  42.7  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2221  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  30.48 
 
 		 273 aa  42.4  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000454003  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2939  ABC-2 type transporter  26.43 
 
 		 286 aa  42.4  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.27677 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4638  ABC-2 type transporter  25.91 
 
 		 282 aa  42.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.619797  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0887  ABC transporter, permease protein  18.68 
 
 		 243 aa  42.4  0.008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00136851  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4345  ABC-2 type transporter  25.91 
 
 		 282 aa  42.4  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0911686 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  27.94 
 
 		 261 aa  42.4  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4259  ABC-2 type transporter  25.91 
 
 		 282 aa  42.4  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573247  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0671  ABC-2 type transporter  26.04 
 
 		 278 aa  42  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000519244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2100  ABC-2 type transporter  27.5 
 
 		 252 aa  42  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>