55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0761 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0761  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 241 aa  480  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.378108 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3004  ABC-2 type transporter  36.96 
 
 		 259 aa  149  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000399849  hitchhiker  0.000157522 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5533  putative ABC transporter, permease protein  31.56 
 
 		 244 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5202  ABC transporter permease  31.56 
 
 		 244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5599  ABC transporter permease  31.56 
 
 		 244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5036  ABC transporter, permease  31.15 
 
 		 244 aa  126  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5052  ABC transporter, permease  31.15 
 
 		 244 aa  126  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5475  putative ABC transporter, permease protein  31.15 
 
 		 244 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.782818  hitchhiker  0.000000000276191 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5477  putative ABC transporter, permease protein  31.15 
 
 		 244 aa  125  5e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.975667  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5484  ABC transporter, permease protein, putative  31.15 
 
 		 244 aa  125  6e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5446  putative ABC transporter, permease protein  30.74 
 
 		 244 aa  124  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5152  ABC-2 type transporter  31.56 
 
 		 244 aa  123  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1722  ABC transporter protein  33.62 
 
 		 241 aa  122  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.611167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3873  ABC-2 type transporter  30.74 
 
 		 244 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.249696  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0653  ABC-2 type transporter  27.35 
 
 		 250 aa  115  6e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0193  ABC-2 type transporter  34.02 
 
 		 241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.125467 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0887  ABC transporter, permease protein  26.29 
 
 		 243 aa  107  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00136851  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0288  ABC-2 type transporter  33.48 
 
 		 265 aa  107  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311075  normal  0.205657 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06320  ABC-2 type transporter  28.7 
 
 		 271 aa  99.4  4e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.458659  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1408  ABC-2 type transporter  24.9 
 
 		 243 aa  97.8  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0360558  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1381  ABC-2 type transporter  24.9 
 
 		 243 aa  97.8  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000108587  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1639  ABC-2 type transporter  31.58 
 
 		 246 aa  89  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3496  ABC-2 type transporter  34.58 
 
 		 258 aa  80.5  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0309  hypothetical protein  27.27 
 
 		 246 aa  79.3  0.00000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.572414  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16230  ABC-2 type transporter  32.65 
 
 		 264 aa  71.2  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.362441  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1905  ABC-2 type transporter  34.65 
 
 		 255 aa  67  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1292  ABC-type multidrug transport system, permease component  23.65 
 
 		 245 aa  67.4  0.0000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000120577  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0185  ABC-2 type transporter  25.93 
 
 		 265 aa  65.1  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.361684  normal  0.861322 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1906  ABC-2 type transporter  27.49 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.228085 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0116  ABC-2 type transporter  29.36 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0506987  normal  0.184799 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1939  ABC-2 type transporter  31.25 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02220  ABC-2 type transporter  26.45 
 
 		 245 aa  62.4  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4202  hypothetical protein  26.34 
 
 		 245 aa  58.5  0.00000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2549  hypothetical protein  31.14 
 
 		 246 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01010  ABC-type multidrug transport system, permease component  36 
 
 		 255 aa  57  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7344  ABC-2 type transporter  25.62 
 
 		 306 aa  55.5  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0101042 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4005  ABC-2 type transporter  25.66 
 
 		 280 aa  55.5  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101832  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  26.37 
 
 		 281 aa  54.3  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2608  ABC-2 type transporter  24.26 
 
 		 244 aa  53.1  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000624625  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  25.57 
 
 		 276 aa  49.7  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1674  hypothetical protein  22.4 
 
 		 236 aa  48.9  0.00006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000719102  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4396  ABC-2 type transporter  30.61 
 
 		 272 aa  49.3  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1266  ABC-2 type transporter  24.08 
 
 		 244 aa  47.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.688668 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4024  ABC-2 type transporter  20.09 
 
 		 266 aa  47.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.410206 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1028  ABC-2 type transporter  27.07 
 
 		 275 aa  46.2  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.321996  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2681  ABC-2 type transporter  24.6 
 
 		 285 aa  46.2  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36170  ABC-type multidrug transport system, permease component  27.71 
 
 		 258 aa  46.2  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3623  ABC-2 type transporter  23.68 
 
 		 280 aa  45.8  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0344  ABC-2 type transporter  24.44 
 
 		 261 aa  45.4  0.0007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.261927  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2100  ABC-2 type transporter  28.49 
 
 		 252 aa  45.4  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5008  ABC-2 type transporter  26.88 
 
 		 290 aa  44.3  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0701746  normal  0.113041 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2148  putative ABC transporter, permease protein  30.56 
 
 		 327 aa  43.5  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249033  normal  0.497773 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0671  ABC-2 type transporter  24.6 
 
 		 278 aa  43.1  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000519244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5312  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 292 aa  43.1  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.91396  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3543  ABC-2 type transporter  24.9 
 
 		 246 aa  42.4  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187999  normal  0.524655 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>