192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3543 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3543  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 246 aa  461  1e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187999  normal  0.524655 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0825  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  44.08 
 
 		 261 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9333  hypothetical protein  43.39 
 
 		 244 aa  175  6e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0613  ABC-2 type transporter  48.19 
 
 		 247 aa  174  8e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3548  ABC transporter protein  45.31 
 
 		 251 aa  166  4e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.705683  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3106  ABC-2 type transporter  42.57 
 
 		 278 aa  158  6e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708923  hitchhiker  0.000220198 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0275  ABC-2 type transporter  40.25 
 
 		 231 aa  146  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0173  ABC-2 type transporter  36.67 
 
 		 262 aa  137  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0481  ABC-2 type transporter  38.25 
 
 		 267 aa  134  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4746  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  34.55 
 
 		 232 aa  133  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3319  ABC-2 type transporter  37.34 
 
 		 267 aa  122  4e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3801  ABC-2 type transporter  33.47 
 
 		 267 aa  115  6e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4920  ABC-2 type transporter  38.15 
 
 		 249 aa  101  9e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3151  ABC-2 type transporter  29.41 
 
 		 247 aa  90.1  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  34.17 
 
 		 375 aa  88.6  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  28.99 
 
 		 360 aa  87.8  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  28.5 
 
 		 339 aa  86.7  4e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  28.02 
 
 		 360 aa  85.1  9e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  31.75 
 
 		 280 aa  84  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4256  ABC-2 type transporter  30.93 
 
 		 249 aa  80.5  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0196  ABC-2 type transporter  30.69 
 
 		 247 aa  80.1  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.168445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  27.56 
 
 		 281 aa  78.2  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0094  ABC-2 type transporter  26.9 
 
 		 388 aa  77  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00282283  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2681  ABC-2 type transporter  27.76 
 
 		 285 aa  77  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  30.16 
 
 		 276 aa  77  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3695  ABC-2 type transporter  32.27 
 
 		 250 aa  75.9  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.869493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3574  ABC-2 type transporter  30.81 
 
 		 443 aa  75.9  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2584  ABC-2 type transporter  29.92 
 
 		 251 aa  75.1  0.0000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  normal  0.0868823 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0511  ABC-2 type transporter  30.31 
 
 		 266 aa  75.1  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2148  putative ABC transporter, permease protein  24.89 
 
 		 327 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249033  normal  0.497773 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2429  ABC-2 type transporter  30.31 
 
 		 251 aa  72.8  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0140653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  30.15 
 
 		 366 aa  71.2  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4396  ABC-2 type transporter  31.47 
 
 		 272 aa  70.9  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4202  ABC-2 type transporter  29.41 
 
 		 258 aa  68.9  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29920  ABC-type multidrug transport system, permease component  26.46 
 
 		 285 aa  68.9  0.00000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.207401  normal  0.6858 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  33.07 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0552  ABC-2 type transporter  28.29 
 
 		 336 aa  66.2  0.0000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4560  ABC-2 type transporter  26.4 
 
 		 257 aa  65.9  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0671  ABC-2 type transporter  30.4 
 
 		 278 aa  65.5  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000519244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2544  ABC-2 type transporter  29.37 
 
 		 265 aa  64.7  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.408574  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2399  ABC-2 type transporter  30.25 
 
 		 241 aa  64.7  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000992199  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0290  putative integral membrane protein  29.58 
 
 		 285 aa  64.3  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.528279  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3172  ABC-2 type transporter  26.19 
 
 		 279 aa  63.9  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1067  putative ABC transporter, permease protein  23.39 
 
 		 341 aa  62.8  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4005  ABC-2 type transporter  23.92 
 
 		 280 aa  60.8  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101832  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2769  ABC-2 type transporter  29.35 
 
 		 413 aa  60.1  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.160651  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2343  ABC-2 type transporter  32.23 
 
 		 304 aa  59.3  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.299179 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0152  ABC-2 type transporter  23.88 
 
 		 325 aa  58.2  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3623  ABC-2 type transporter  24.31 
 
 		 280 aa  57.4  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0479  ABC-2 type transporter  33.76 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1722  ABC transporter protein  28.35 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.611167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0093  ABC-2 type transporter  27.74 
 
 		 356 aa  55.8  0.0000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.154072  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5132  ABC-2 type transporter  29.71 
 
 		 358 aa  55.5  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.033585  normal  0.150856 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0926  ABC-2 type transporter  29.73 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.348687  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0531  ABC transporter permease  21.89 
 
 		 241 aa  55.1  0.0000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3101  ABC-2 type transporter  28.71 
 
 		 344 aa  54.7  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000558169  hitchhiker  0.0000121126 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  29.17 
 
 		 369 aa  54.3  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1589  ABC-2 type transporter  30.33 
 
 		 369 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548124  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2470  ABC-2 type transporter  37.23 
 
 		 247 aa  54.3  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.218035  hitchhiker  0.00397591 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1137  ABC-2 type transporter  31.07 
 
 		 257 aa  53.1  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.251829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0699  hypothetical protein  29.21 
 
 		 363 aa  52.8  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.201685  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0516  ABC-2 type transporter, permease protein  29.21 
 
 		 363 aa  52.8  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.948898  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0534  ABC-2 type transporter, permease protein  29.21 
 
 		 363 aa  52.8  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.359277  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  23.2 
 
 		 261 aa  52.4  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000233601  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2100  ABC-2 type transporter  31.69 
 
 		 252 aa  52  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3873  ABC-2 type transporter  24.09 
 
 		 244 aa  52  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.249696  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3044  ABC-2 type transporter  24.66 
 
 		 269 aa  52  0.000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.375207 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3151  ABC transporter, permease protein, putative  29.21 
 
 		 363 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0121  ABC-2 type transporter, permease protein  29.21 
 
 		 363 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1467  putative ABC transporter, permease protein  29.21 
 
 		 363 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2895  ABC-2 type transporter, permease protein  29.21 
 
 		 363 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0277  ABC-2 type transporter  25.7 
 
 		 380 aa  51.6  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.41 
 
 		 384 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0857  hypothetical protein  30 
 
 		 377 aa  50.8  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5475  putative ABC transporter, permease protein  23.11 
 
 		 244 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.782818  hitchhiker  0.000000000276191 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  27.46 
 
 		 384 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0553  ABC-2 type transporter  23.86 
 
 		 361 aa  50.8  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0425  ABC-2 type transporter  27.97 
 
 		 366 aa  50.8  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0348  ABC-2 type transporter  29.72 
 
 		 284 aa  51.2  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0113875  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0539  ABC-2 type transporter  24.43 
 
 		 361 aa  50.8  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1667  ABC-2 type transporter  31.02 
 
 		 262 aa  50.4  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0830718  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0701  hypothetical protein  26.2 
 
 		 242 aa  50.1  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.320058  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5484  ABC transporter, permease protein, putative  22.22 
 
 		 244 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5036  ABC transporter, permease  24.02 
 
 		 244 aa  50.1  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5052  ABC transporter, permease  24.02 
 
 		 244 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5477  putative ABC transporter, permease protein  23.11 
 
 		 244 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.975667  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5202  ABC transporter permease  22.67 
 
 		 244 aa  49.7  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5599  ABC transporter permease  22.67 
 
 		 244 aa  49.7  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  25.4 
 
 		 367 aa  49.7  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  26.14 
 
 		 371 aa  50.1  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5152  ABC-2 type transporter  23.58 
 
 		 244 aa  49.7  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0887  ABC transporter, permease protein  21.94 
 
 		 243 aa  49.7  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00136851  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2368  hypothetical protein  33.33 
 
 		 379 aa  49.7  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  26.76 
 
 		 384 aa  49.3  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0987  ABC-2 type transporter  26.21 
 
 		 247 aa  49.3  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0449521 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  25.68 
 
 		 253 aa  49.3  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3040  hypothetical protein  29.23 
 
 		 371 aa  48.9  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0276  ABC-2 type transporter  20.79 
 
 		 348 aa  48.9  0.00007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5533  putative ABC transporter, permease protein  21.78 
 
 		 244 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1937  ABC-2 type transporter  25.89 
 
 		 284 aa  48.9  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.008119  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>