More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4202 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4202  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 258 aa  496  1e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2584  ABC-2 type transporter  53.44 
 
 		 251 aa  260  1e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  normal  0.0868823 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2429  ABC-2 type transporter  54.07 
 
 		 251 aa  249  2e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0140653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3695  ABC-2 type transporter  51.41 
 
 		 250 aa  235  7e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.869493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5132  ABC-2 type transporter  38.74 
 
 		 358 aa  152  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.033585  normal  0.150856 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3101  ABC-2 type transporter  40.29 
 
 		 344 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000558169  hitchhiker  0.0000121126 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  32 
 
 		 366 aa  92.8  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4256  ABC-2 type transporter  27.13 
 
 		 249 aa  80.1  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  27.37 
 
 		 375 aa  75.5  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3574  ABC-2 type transporter  26.09 
 
 		 443 aa  74.7  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2803  ABC-2 type transporter  29.49 
 
 		 252 aa  70.5  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2148  putative ABC transporter, permease protein  25.79 
 
 		 327 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249033  normal  0.497773 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  27.41 
 
 		 276 aa  70.1  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  26.63 
 
 		 360 aa  70.5  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  26.63 
 
 		 339 aa  69.7  0.00000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1192  ABC-2 type transporter  28.64 
 
 		 257 aa  69.7  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  26.13 
 
 		 360 aa  69.7  0.00000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9333  hypothetical protein  31.25 
 
 		 244 aa  68.9  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2484  ABC-2 type transporter  28.85 
 
 		 263 aa  68.6  0.00000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.308148  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  26.09 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0703  ABC-2 type transporter  29.41 
 
 		 363 aa  66.2  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  24.55 
 
 		 280 aa  65.9  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3298  ABC-2 type transporter  30 
 
 		 257 aa  65.1  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0327  ABC-2 type transporter  30.24 
 
 		 251 aa  65.1  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.461338  normal  0.0259517 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1067  putative ABC transporter, permease protein  25.91 
 
 		 341 aa  62.8  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5840  ABC-2 type transporter  30.82 
 
 		 367 aa  60.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.564028 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0689  ABC-2 type transporter, NodJ family  29.95 
 
 		 262 aa  60.8  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0447972 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7344  ABC-2 type transporter  31.82 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0101042 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  26.32 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000233601  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4560  ABC-2 type transporter  25.21 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3408  ABC-2 type transporter, permease protein  27.64 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184246  normal  0.618546 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1142  ABC transporter permease protein  28.8 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0101435  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1012  ABC transporter, permease protein  28.8 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000447992  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5992  hypothetical protein  31.43 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125554  normal  0.149158 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0271  ABC-2 type transporter  29.44 
 
 		 245 aa  58.9  0.00000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0843829  hitchhiker  0.000145713 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2328  transporter, putative  25.68 
 
 		 246 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.117528  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1170  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25.82 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4396  ABC-2 type transporter  27.36 
 
 		 272 aa  58.5  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4005  ABC-2 type transporter  22.22 
 
 		 280 aa  57.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101832  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3543  ABC-2 type transporter  29.41 
 
 		 246 aa  57  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187999  normal  0.524655 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0275  ABC-2 type transporter  26.79 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1667  ABC-2 type transporter  25.53 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0141124  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4746  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  26.56 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.27 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3548  ABC transporter protein  27.1 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.705683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0849  ABC-type multidrug transport system, permease component  27.22 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.227676  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  32.65 
 
 		 261 aa  55.5  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1779  ABC-2 type transporter  24.9 
 
 		 275 aa  55.5  0.0000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1730  hypothetical protein  25.76 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.45161 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2321  ABC-2 type transporter  34.55 
 
 		 245 aa  54.7  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2615  ABC-2 type transporter  38.24 
 
 		 267 aa  55.1  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.747872  hitchhiker  0.00151672 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3151  ABC-2 type transporter  23.76 
 
 		 247 aa  55.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0663  ABC-2 type transporter  27.87 
 
 		 274 aa  55.1  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1448  ABC-2 type transporter  27.51 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0318973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0121  ABC-2 type transporter  30.08 
 
 		 252 aa  55.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0240531  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  30.39 
 
 		 290 aa  54.3  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0390  ABC-2 type transporter  29.11 
 
 		 255 aa  53.9  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3908  ABC-2 type transporter  28.49 
 
 		 258 aa  54.7  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0196  ABC-2 type transporter  25.12 
 
 		 247 aa  54.3  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.168445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0094  ABC-2 type transporter  22.01 
 
 		 388 aa  54.3  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00282283  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0530  ABC-2 type transporter  24.88 
 
 		 251 aa  54.3  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.203492  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4656  ABC-2 type transporter  32.97 
 
 		 285 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.890125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  32.65 
 
 		 255 aa  54.3  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03555  ABC-type multidrug transport system, permease component  25.11 
 
 		 271 aa  53.9  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0511  ABC-2 type transporter  24 
 
 		 266 aa  53.9  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0671  ABC-2 type transporter  25.59 
 
 		 278 aa  53.5  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000519244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5370  ABC-2 type transporter  28.65 
 
 		 273 aa  53.5  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1533  ABC-2 type transporter  27.62 
 
 		 274 aa  53.9  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.98 
 
 		 253 aa  53.5  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0096  ABC-2 type transporter  30.12 
 
 		 247 aa  53.5  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0552  ABC-2 type transporter  26.42 
 
 		 336 aa  53.1  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3044  ABC-2 type transporter  25.25 
 
 		 269 aa  53.1  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.375207 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25.37 
 
 		 253 aa  52.8  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1171  16S rRNA processing protein RimM  26.49 
 
 		 257 aa  52.8  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.730617  hitchhiker  0.000000152208 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0285  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  27.44 
 
 		 356 aa  53.1  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1958  ABC-2 type transporter  29.9 
 
 		 250 aa  52.8  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00055396  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0825  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  28.63 
 
 		 261 aa  52.4  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  24.14 
 
 		 253 aa  52.4  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3106  ABC-2 type transporter  28.52 
 
 		 278 aa  52.4  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708923  hitchhiker  0.000220198 
 
 
-
 
NC_002936  DET0411  putative NodJ  28.17 
 
 		 255 aa  52.4  0.000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1211  ABC-2 type transporter  28.79 
 
 		 252 aa  52  0.000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0786  ABC-2 type transporter  27.78 
 
 		 254 aa  52  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.585621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2409  ABC-2 type transporter  29.15 
 
 		 253 aa  52  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_354  ABC-2 type transport system, permease protein  28.17 
 
 		 255 aa  52  0.000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.216034  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0276  ABC-2 type transporter, NodJ  29.9 
 
 		 261 aa  51.6  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.664635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3623  ABC-2 type transporter  22.34 
 
 		 280 aa  51.6  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  27.35 
 
 		 284 aa  51.6  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3828  ABC transporter  30.37 
 
 		 262 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29920  ABC-type multidrug transport system, permease component  26.04 
 
 		 285 aa  51.2  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.207401  normal  0.6858 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3137  ABC-2 type transporter  28.37 
 
 		 277 aa  50.8  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.428202  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1975  ABC transporter protein  32.32 
 
 		 263 aa  50.8  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1098  ABC-2 type transporter  26.27 
 
 		 257 aa  50.8  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0121  putative permease  25.14 
 
 		 256 aa  50.8  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1381  ABC-2 type transporter  27.18 
 
 		 243 aa  50.4  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000108587  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1005  ABC transporter, permease protein  41.57 
 
 		 254 aa  50.4  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0640  ABC-2 transporter component  25.14 
 
 		 270 aa  50.4  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1408  ABC-2 type transporter  27.18 
 
 		 243 aa  50.4  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0360558  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0461  hypothetical protein  25.68 
 
 		 257 aa  50.1  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0612935  normal  0.787561 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1826  ABC-2 type transporter  27.37 
 
 		 233 aa  50.4  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.805602  normal  0.102256 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0881  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 276 aa  50.4  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>