More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5370 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5370  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 273 aa  533  1e-150  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02790  permease  38.43 
 
 		 263 aa  194  2e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1860  ABC-2 type transporter  38.59 
 
 		 257 aa  192  6e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3881  ABC-2 type transporter  37.69 
 
 		 263 aa  191  1e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.574088  normal  0.697417 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0280  ABC-2 type transporter  41.13 
 
 		 256 aa  190  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0495  ABC-2 type transporter  39.11 
 
 		 259 aa  190  2e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0559  ABC transporter permease protein  39.11 
 
 		 259 aa  190  2e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03555  ABC-type multidrug transport system, permease component  38.84 
 
 		 271 aa  188  7e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0121  putative permease  36.59 
 
 		 256 aa  186  3e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0574  ABC-2 type transporter permease protein  38.6 
 
 		 257 aa  186  3e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0881  ABC-2 type transporter  35.25 
 
 		 276 aa  186  4e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03454  hypothetical protein  36.59 
 
 		 256 aa  185  7e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1098  ABC-2 type transporter  39.42 
 
 		 257 aa  185  8e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0690  ABC-2 type transporter  36.99 
 
 		 258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.809524  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1171  16S rRNA processing protein RimM  36.51 
 
 		 257 aa  181  8.000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.730617  hitchhiker  0.000000152208 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3801  ABC transporter, permease protein  35.77 
 
 		 256 aa  181  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0831  ABC-2 type transporter  35.77 
 
 		 256 aa  181  1e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3995  ABC-2 type transporter  37.75 
 
 		 256 aa  181  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2615  ABC-2 type transporter  39.11 
 
 		 267 aa  181  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.747872  hitchhiker  0.00151672 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2137  ABC-2 type transporter  34.71 
 
 		 257 aa  181  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0672016  normal  0.103113 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0795  ABC-2 type transporter  35.37 
 
 		 256 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3143  ABC-2 type transporter  35.77 
 
 		 256 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0824  ABC-2 type transporter  35.77 
 
 		 256 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1016  ABC transporter permease  35.95 
 
 		 256 aa  179  5.999999999999999e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.875005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3816  ABC-2 type transporter  35.37 
 
 		 258 aa  178  7e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.791577 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1352  hypothetical protein  36.29 
 
 		 257 aa  178  7e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000725132  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3476  ABC-2 type transporter  35.95 
 
 		 256 aa  178  9e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3348  ABC transporter, permease protein  35.95 
 
 		 256 aa  178  9e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0192428  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00127  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  37.6 
 
 		 256 aa  178  1e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3474  ABC-2 type transporter  37.6 
 
 		 256 aa  178  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0136  ABC transporter, permease protein  37.6 
 
 		 256 aa  178  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3531  ABC-2 type transporter  37.6 
 
 		 256 aa  178  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0132  ABC transporter, permease protein  37.6 
 
 		 256 aa  178  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00126  hypothetical protein  37.6 
 
 		 256 aa  178  1e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0652  hypothetical protein  34.96 
 
 		 256 aa  178  1e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0130  ABC transporter, permease protein  37.6 
 
 		 256 aa  178  1e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0138  ABC transporter, permease protein  37.6 
 
 		 256 aa  178  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3140  ABC-2 type transporter  35.12 
 
 		 262 aa  177  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.432553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2645  ABC-2 type transporter  37.86 
 
 		 268 aa  176  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0121  ABC transporter, permease protein  37.2 
 
 		 256 aa  176  3e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002558  ABC-type multidrug transport system permease component  34.96 
 
 		 256 aa  176  3e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.644442  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3036  ABC-2 type transporter  37.86 
 
 		 268 aa  176  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0188  ABC transporter permease  36 
 
 		 256 aa  176  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.137921  normal  0.864827 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0723  ABC-2 type transporter  34.96 
 
 		 256 aa  176  5e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0205  ABC transporter, permease protein  36 
 
 		 256 aa  176  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0197  ABC transporter permease  36 
 
 		 256 aa  176  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.737997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0189  ABC transporter permease protein  36 
 
 		 256 aa  176  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3519  ABC-2 type transporter  34.96 
 
 		 256 aa  176  5e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.238751  normal  0.0167423 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0192  ABC transporter permease  36 
 
 		 256 aa  176  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.333926 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3588  ABC-2 type transporter  34.96 
 
 		 256 aa  176  5e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0782802  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3711  ABC-2 type transporter  34.96 
 
 		 256 aa  176  5e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5173  ABC-2 type transporter  35.74 
 
 		 253 aa  175  7e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.108513 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3260  ABC-2 type transporter  35.74 
 
 		 253 aa  175  7e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0633139  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5108  ABC-2 type transporter  35.74 
 
 		 253 aa  175  7e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0755  ABC-2 type transporter  38.19 
 
 		 254 aa  174  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.25704  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1005  ABC transporter, permease protein  33.2 
 
 		 254 aa  174  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1078  ABC-2 type transporter  37.19 
 
 		 260 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0640  ABC-2 transporter component  37.35 
 
 		 270 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3908  ABC-2 type transporter  34.55 
 
 		 258 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0461  hypothetical protein  35.29 
 
 		 257 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0612935  normal  0.787561 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0607  ABC-2 type transporter  34.56 
 
 		 271 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.837549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3231  ABC-2 type transporter  34.15 
 
 		 256 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27780  putative ABC transporter, permease protein  35.68 
 
 		 259 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.235012 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1631  hypothetical protein  34.85 
 
 		 262 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000356157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0427  ABC transporter, inner membrane subunit  34.9 
 
 		 257 aa  173  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2346  ABC transporter  35.68 
 
 		 259 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0982615  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15510  ABC-2 type transporter, permease component  36.93 
 
 		 259 aa  172  3.9999999999999995e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1779  ABC-2 type transporter  33.58 
 
 		 275 aa  172  7.999999999999999e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0773  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems permease component  34.71 
 
 		 256 aa  171  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1471  ABC-2 type transporter  35.12 
 
 		 259 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2833  ABC transporter, inner membrane subunit  33.07 
 
 		 258 aa  170  2e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3121  ABC-2 type transporter  35.95 
 
 		 256 aa  171  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0849  ABC-type multidrug transport system, permease component  33.61 
 
 		 254 aa  170  2e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.227676  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1012  ABC transporter, permease protein  33.75 
 
 		 257 aa  170  3e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000447992  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1142  ABC transporter permease protein  33.75 
 
 		 257 aa  170  3e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0101435  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0676  ABC-2 type transporter  35.48 
 
 		 256 aa  169  3e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.655554 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3854  ABC transporter, permease protein  34.02 
 
 		 262 aa  169  4e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.605289  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5044  ABC-2 type transporter  35.34 
 
 		 256 aa  169  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.917306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0540  ABC transporter, inner membrane subunit  34.54 
 
 		 253 aa  169  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1025  ABC-2 type transporter  35.54 
 
 		 256 aa  169  4e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0880893  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4521  ABC-2 type transporter  35.34 
 
 		 256 aa  169  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0243  hypothetical protein  33.2 
 
 		 259 aa  169  6e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.113541 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0663  ABC-2 type transporter  39.44 
 
 		 274 aa  169  6e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1896  ABC transporter  34.71 
 
 		 259 aa  169  7e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.312969  hitchhiker  0.0000781572 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0749  ABC-2 type transporter  33.73 
 
 		 253 aa  168  7e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.41583 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3083  ABC transporter permease  35.42 
 
 		 253 aa  168  8e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.646009  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2886  ABC-2 type transporter  35.16 
 
 		 262 aa  167  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0831309 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3233  ABC-2 type transporter  35.16 
 
 		 262 aa  167  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3534  ABC-2 type transporter  36.36 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3928  ABC-2 type transporter  37.84 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2088  ABC-2 type transporter  32.92 
 
 		 253 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0318264  normal  0.440249 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1607  ABC-2 type transporter  34.02 
 
 		 253 aa  166  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0979931  normal  0.144248 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2042  ABC-2 type transporter  37.75 
 
 		 273 aa  166  5e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0166481 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0895  ABC-2 type transporter  37.23 
 
 		 271 aa  165  8e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.239157  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1984  ABC-2 type transporter  33.46 
 
 		 260 aa  165  8e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0219123  normal  0.0104118 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1229  ABC-2 type transporter  37.85 
 
 		 273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal  0.0330448 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2743  hypothetical protein  34.68 
 
 		 251 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2924  putative ABC transporter inner membrane subunit  34.17 
 
 		 253 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1658  ABC-2 type transporter  33.86 
 
 		 255 aa  163  2.0000000000000002e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1920  ABC-2 type transporter  33.59 
 
 		 264 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00135758  normal  0.376856 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>