More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2833 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2833  ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
258 aa  513  1.0000000000000001e-145  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2137  ABC-2 type transporter  66.02 
 
 
257 aa  350  8.999999999999999e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0672016  normal  0.103113 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1984  ABC-2 type transporter  66.54 
 
 
260 aa  350  1e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0219123  normal  0.0104118 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03454  hypothetical protein  62.99 
 
 
256 aa  339  2.9999999999999998e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0121  putative permease  64.17 
 
 
256 aa  339  2.9999999999999998e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002558  ABC-type multidrug transport system permease component  63.89 
 
 
256 aa  337  9.999999999999999e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.644442  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1352  hypothetical protein  63.28 
 
 
257 aa  336  2.9999999999999997e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000725132  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1779  ABC-2 type transporter  60.7 
 
 
275 aa  330  1e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1098  ABC-2 type transporter  63.64 
 
 
257 aa  328  4e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1171  16S rRNA processing protein RimM  62.11 
 
 
257 aa  323  2e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.730617  hitchhiker  0.000000152208 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1860  ABC-2 type transporter  59.84 
 
 
257 aa  322  3e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1005  ABC transporter, permease protein  60.47 
 
 
254 aa  320  9.999999999999999e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2614  ABC transporter, integral membrane protein  65.48 
 
 
256 aa  320  9.999999999999999e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.838377  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02790  permease  58.66 
 
 
263 aa  319  3e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3881  ABC-2 type transporter  58.53 
 
 
263 aa  318  5e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.574088  normal  0.697417 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0652  hypothetical protein  58.27 
 
 
256 aa  317  7.999999999999999e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3801  ABC transporter, permease protein  58.27 
 
 
256 aa  317  9e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0723  ABC-2 type transporter  58.27 
 
 
256 aa  317  1e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0690  ABC-2 type transporter  58.14 
 
 
258 aa  317  1e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.809524  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3519  ABC-2 type transporter  58.27 
 
 
256 aa  317  1e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.238751  normal  0.0167423 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3588  ABC-2 type transporter  58.27 
 
 
256 aa  317  1e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0782802  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2346  ABC transporter  64.2 
 
 
259 aa  317  1e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0982615  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3711  ABC-2 type transporter  58.27 
 
 
256 aa  317  1e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0495  ABC-2 type transporter  58.1 
 
 
259 aa  317  1e-85  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27780  putative ABC transporter, permease protein  64.2 
 
 
259 aa  317  1e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.235012 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3140  ABC-2 type transporter  58.53 
 
 
262 aa  317  2e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.432553  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0831  ABC-2 type transporter  58.27 
 
 
256 aa  316  2e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3143  ABC-2 type transporter  57.87 
 
 
256 aa  316  3e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0795  ABC-2 type transporter  57.48 
 
 
256 aa  315  4e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0773  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems permease component  59.84 
 
 
256 aa  315  4e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0824  ABC-2 type transporter  57.48 
 
 
256 aa  315  4e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3908  ABC-2 type transporter  58.53 
 
 
258 aa  315  6e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0559  ABC transporter permease protein  57.71 
 
 
259 aa  315  6e-85  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1896  ABC transporter  61.81 
 
 
259 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.312969  hitchhiker  0.0000781572 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0849  ABC-type multidrug transport system, permease component  60 
 
 
254 aa  313  1.9999999999999998e-84  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.227676  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3816  ABC-2 type transporter  57.36 
 
 
258 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.791577 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1078  ABC-2 type transporter  59.84 
 
 
260 aa  312  2.9999999999999996e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1471  ABC-2 type transporter  61.81 
 
 
259 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1631  hypothetical protein  64.4 
 
 
262 aa  311  5.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000356157  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1920  ABC-2 type transporter  65.2 
 
 
264 aa  311  6.999999999999999e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00135758  normal  0.376856 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3854  ABC transporter, permease protein  64 
 
 
262 aa  310  2e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.605289  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3231  ABC-2 type transporter  56.75 
 
 
256 aa  309  2.9999999999999997e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0574  ABC-2 type transporter permease protein  60.63 
 
 
257 aa  308  4e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2121  ABC transporter, permease protein  60.32 
 
 
254 aa  308  5e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1506  ABC-2 type transporter  62.85 
 
 
259 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15510  ABC-2 type transporter, permease component  61.42 
 
 
259 aa  306  2.0000000000000002e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4180  hypothetical protein  63.18 
 
 
259 aa  305  3e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03555  ABC-type multidrug transport system, permease component  57.87 
 
 
271 aa  304  8.000000000000001e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0461  hypothetical protein  59.14 
 
 
257 aa  303  2.0000000000000002e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0612935  normal  0.787561 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0607  ABC-2 type transporter  58.33 
 
 
271 aa  302  4.0000000000000003e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.837549  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0427  ABC transporter, inner membrane subunit  58.75 
 
 
257 aa  301  8.000000000000001e-81  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0197  ABC transporter permease  57.09 
 
 
256 aa  298  5e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.737997  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0188  ABC transporter permease  57.09 
 
 
256 aa  298  5e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.137921  normal  0.864827 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0189  ABC transporter permease protein  57.09 
 
 
256 aa  298  5e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0192  ABC transporter permease  57.09 
 
 
256 aa  298  5e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.333926 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0205  ABC transporter, permease protein  57.09 
 
 
256 aa  298  5e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3819  ABC-2 type transporter  61.42 
 
 
259 aa  298  7e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.728867  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3995  ABC-2 type transporter  56.35 
 
 
256 aa  296  1e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1016  ABC transporter permease  54.72 
 
 
256 aa  294  8e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.875005  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3476  ABC-2 type transporter  54.72 
 
 
256 aa  293  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3348  ABC transporter, permease protein  54.72 
 
 
256 aa  293  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0192428  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00127  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  55.56 
 
 
256 aa  293  2e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3474  ABC-2 type transporter  55.56 
 
 
256 aa  293  2e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3531  ABC-2 type transporter  55.56 
 
 
256 aa  293  2e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0138  ABC transporter, permease protein  55.56 
 
 
256 aa  293  2e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0130  ABC transporter, permease protein  55.56 
 
 
256 aa  293  2e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0132  ABC transporter, permease protein  55.56 
 
 
256 aa  293  2e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00126  hypothetical protein  55.56 
 
 
256 aa  293  2e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0136  ABC transporter, permease protein  55.56 
 
 
256 aa  293  2e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0121  ABC transporter, permease protein  55.56 
 
 
256 aa  292  4e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1025  ABC-2 type transporter  54.37 
 
 
256 aa  291  7e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0880893  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0676  ABC-2 type transporter  57.14 
 
 
256 aa  290  2e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.655554 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0881  ABC-2 type transporter  55.91 
 
 
276 aa  289  3e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3121  ABC-2 type transporter  54.37 
 
 
256 aa  289  3e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3928  ABC-2 type transporter  58.04 
 
 
256 aa  287  1e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1012  ABC transporter, permease protein  52.96 
 
 
257 aa  277  1e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000447992  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1142  ABC transporter permease protein  52.96 
 
 
257 aa  277  1e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0101435  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0454  hypothetical protein  53.75 
 
 
257 aa  267  1e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0430  hypothetical protein  53.75 
 
 
257 aa  267  1e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1157  ABC-2 type transporter  53.17 
 
 
256 aa  263  1e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0839963  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2826  ABC-2 type transporter  54.58 
 
 
256 aa  257  1e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.525501  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0800  ABC-2 type transporter  44.75 
 
 
257 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0251444  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0097  ABC type transport system, integral membrane protein  42.8 
 
 
264 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1332  ABC-2 type transporter  40.64 
 
 
253 aa  198  7.999999999999999e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.993972  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0836  ABC transporter, inner membrane subunit  42.57 
 
 
253 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1221  ABC-2 type transporter  40 
 
 
253 aa  185  5e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.389129  decreased coverage  0.00710452 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0749  ABC-2 type transporter  36.84 
 
 
253 aa  185  6e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.41583 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0639  ABC-2 type transporter  38.25 
 
 
253 aa  185  7e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0886  ABC-2 type transporter  42.57 
 
 
253 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.301364  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0616  ABC-2 type transporter  36.11 
 
 
255 aa  182  4.0000000000000006e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.33089 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0808  hypothetical protein  39.17 
 
 
253 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.283236  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0882  ABC-2 type transporter  42.97 
 
 
253 aa  182  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2018  hypothetical protein  37.5 
 
 
253 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.803499  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0977  ABC transporter permease protein  37.34 
 
 
255 aa  181  1e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.024266  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0747  hypothetical protein  38.1 
 
 
253 aa  181  1e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2326  ABC-2 type transporter  35.74 
 
 
253 aa  180  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0755  ABC-2 type transporter  38.22 
 
 
254 aa  180  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.25704  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1453  ABC-2 type transporter  36.93 
 
 
253 aa  179  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2088  ABC-2 type transporter  35.74 
 
 
253 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0318264  normal  0.440249 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0447  ABC-2 type transporter  38.43 
 
 
259 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>