More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0755 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0755  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 254 aa  499  1e-140  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.25704  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2833  ABC transporter, inner membrane subunit  36.84 
 
 		 258 aa  189  4e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1098  ABC-2 type transporter  38.31 
 
 		 257 aa  187  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0881  ABC-2 type transporter  41.74 
 
 		 276 aa  186  2e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5370  ABC-2 type transporter  40.26 
 
 		 273 aa  185  7e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2137  ABC-2 type transporter  38.46 
 
 		 257 aa  184  9e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0672016  normal  0.103113 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002558  ABC-type multidrug transport system permease component  37.25 
 
 		 256 aa  182  5.0000000000000004e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.644442  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27780  putative ABC transporter, permease protein  41.39 
 
 		 259 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.235012 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1631  hypothetical protein  38.62 
 
 		 262 aa  180  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000356157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2346  ABC transporter  40.98 
 
 		 259 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0982615  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3854  ABC transporter, permease protein  38.21 
 
 		 262 aa  177  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.605289  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03454  hypothetical protein  36.03 
 
 		 256 aa  177  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0121  putative permease  35.22 
 
 		 256 aa  176  4e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0607  ABC-2 type transporter  36.44 
 
 		 271 aa  175  5e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.837549  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2121  ABC transporter, permease protein  38.55 
 
 		 254 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15510  ABC-2 type transporter, permease component  39.84 
 
 		 259 aa  173  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0849  ABC-type multidrug transport system, permease component  37.55 
 
 		 254 aa  173  1.9999999999999998e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.227676  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1471  ABC-2 type transporter  39.35 
 
 		 259 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3801  ABC transporter, permease protein  36.44 
 
 		 256 aa  172  5e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0795  ABC-2 type transporter  36.03 
 
 		 256 aa  172  5e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1896  ABC transporter  39.35 
 
 		 259 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.312969  hitchhiker  0.0000781572 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1352  hypothetical protein  36.4 
 
 		 257 aa  172  5.999999999999999e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000725132  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0461  hypothetical protein  36.84 
 
 		 257 aa  172  5.999999999999999e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0612935  normal  0.787561 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3143  ABC-2 type transporter  36.03 
 
 		 256 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0824  ABC-2 type transporter  36.03 
 
 		 256 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1078  ABC-2 type transporter  35.22 
 
 		 260 aa  171  6.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0427  ABC transporter, inner membrane subunit  36.84 
 
 		 257 aa  171  7.999999999999999e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4180  hypothetical protein  39.84 
 
 		 259 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0652  hypothetical protein  36.03 
 
 		 256 aa  171  9e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3881  ABC-2 type transporter  38.49 
 
 		 263 aa  171  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.574088  normal  0.697417 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1920  ABC-2 type transporter  40.95 
 
 		 264 aa  171  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00135758  normal  0.376856 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1016  ABC transporter permease  36.18 
 
 		 256 aa  170  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.875005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0676  ABC-2 type transporter  38.71 
 
 		 256 aa  169  3e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.655554 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0574  ABC-2 type transporter permease protein  38.43 
 
 		 257 aa  169  3e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3476  ABC-2 type transporter  36.18 
 
 		 256 aa  169  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1860  ABC-2 type transporter  36.89 
 
 		 257 aa  169  3e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3348  ABC transporter, permease protein  36.18 
 
 		 256 aa  169  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0192428  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02790  permease  37.4 
 
 		 263 aa  170  3e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0831  ABC-2 type transporter  36.14 
 
 		 256 aa  169  4e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0836  ABC transporter, inner membrane subunit  40.24 
 
 		 253 aa  169  5e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0121  ABC transporter, permease protein  36.18 
 
 		 256 aa  168  7e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00127  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  36.18 
 
 		 256 aa  167  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3474  ABC-2 type transporter  36.18 
 
 		 256 aa  167  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1005  ABC transporter, permease protein  34.96 
 
 		 254 aa  167  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0136  ABC transporter, permease protein  36.18 
 
 		 256 aa  167  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3519  ABC-2 type transporter  35.22 
 
 		 256 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.238751  normal  0.0167423 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0138  ABC transporter, permease protein  36.18 
 
 		 256 aa  167  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0723  ABC-2 type transporter  35.22 
 
 		 256 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0559  ABC transporter permease protein  38.79 
 
 		 259 aa  167  1e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3711  ABC-2 type transporter  35.22 
 
 		 256 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3588  ABC-2 type transporter  35.22 
 
 		 256 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0782802  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00126  hypothetical protein  36.18 
 
 		 256 aa  167  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0132  ABC transporter, permease protein  36.18 
 
 		 256 aa  167  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0130  ABC transporter, permease protein  36.18 
 
 		 256 aa  167  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3531  ABC-2 type transporter  36.18 
 
 		 256 aa  167  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3231  ABC-2 type transporter  36.03 
 
 		 256 aa  167  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2645  ABC-2 type transporter  39.52 
 
 		 268 aa  167  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3036  ABC-2 type transporter  39.52 
 
 		 268 aa  167  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3816  ABC-2 type transporter  35.22 
 
 		 258 aa  166  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.791577 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0495  ABC-2 type transporter  38.79 
 
 		 259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1171  16S rRNA processing protein RimM  34.29 
 
 		 257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.730617  hitchhiker  0.000000152208 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1984  ABC-2 type transporter  39.27 
 
 		 260 aa  166  4e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0219123  normal  0.0104118 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0097  ABC type transport system, integral membrane protein  37.9 
 
 		 264 aa  166  5e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0773  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems permease component  37.05 
 
 		 256 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2614  ABC transporter, integral membrane protein  38.65 
 
 		 256 aa  165  6.9999999999999995e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.838377  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3121  ABC-2 type transporter  36.18 
 
 		 256 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0690  ABC-2 type transporter  36.44 
 
 		 258 aa  165  8e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.809524  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1025  ABC-2 type transporter  37.65 
 
 		 256 aa  165  8e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0880893  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1506  ABC-2 type transporter  39.81 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3819  ABC-2 type transporter  39.35 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.728867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1142  ABC transporter permease protein  34.8 
 
 		 257 aa  163  3e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0101435  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3995  ABC-2 type transporter  36.95 
 
 		 256 aa  163  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1012  ABC transporter, permease protein  34.8 
 
 		 257 aa  163  3e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000447992  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0188  ABC transporter permease  36.29 
 
 		 256 aa  162  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.137921  normal  0.864827 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0205  ABC transporter, permease protein  36.29 
 
 		 256 aa  162  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0197  ABC transporter permease  36.29 
 
 		 256 aa  162  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.737997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0189  ABC transporter permease protein  36.29 
 
 		 256 aa  162  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0324  ABC-2 type transporter  37.83 
 
 		 273 aa  162  6e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0584539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0192  ABC transporter permease  36.29 
 
 		 256 aa  162  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.333926 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0348  ABC-2 type transporter  37.86 
 
 		 281 aa  162  7e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431352  normal  0.251356 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03555  ABC-type multidrug transport system, permease component  35.1 
 
 		 271 aa  162  7e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0339  ABC-2 type transporter  37.86 
 
 		 281 aa  162  7e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1779  ABC-2 type transporter  37.1 
 
 		 275 aa  161  8.000000000000001e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0400  ABC-2 type transporter  37.13 
 
 		 273 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.732955 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2686  ABC-2 type transporter  37.13 
 
 		 273 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.859674  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0421  ABC-2 type transporter  37.13 
 
 		 273 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.77682  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0886  ABC-2 type transporter  39.84 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.301364  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2763  ABC-2 type transporter  36.71 
 
 		 251 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0616  ABC-2 type transporter  33.8 
 
 		 255 aa  159  3e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.33089 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3140  ABC-2 type transporter  36.69 
 
 		 262 aa  159  3e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.432553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3519  ABC efflux pump, inner membrane subunit  36.71 
 
 		 251 aa  159  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24829  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0882  ABC-2 type transporter  40.24 
 
 		 253 aa  159  5e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3564  ABC-2 type transporter  37.78 
 
 		 251 aa  159  6e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.460574  hitchhiker  0.0000462468 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0898  ABC-2 type transporter  40.74 
 
 		 253 aa  158  9e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3670  ABC-2 type transporter, permease protein  37.55 
 
 		 251 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.549508  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2718  ABC transporter, permease protein  37.55 
 
 		 251 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3697  ABC transporter, permease protein  37.55 
 
 		 251 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1784  ABC transporter, permease protein  37.55 
 
 		 251 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3908  ABC-2 type transporter  34.41 
 
 		 258 aa  157  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0394  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  37.78 
 
 		 254 aa  157  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>