More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3564 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3564  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 251 aa  496  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.460574  hitchhiker  0.0000462468 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0394  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  98 
 
 		 254 aa  488  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2763  ABC-2 type transporter  89.64 
 
 		 251 aa  456  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2718  ABC transporter, permease protein  85.26 
 
 		 251 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1784  ABC transporter, permease protein  85.26 
 
 		 251 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2769  ABC-2 type transporter, permease protein  85.26 
 
 		 251 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3697  ABC transporter, permease protein  85.26 
 
 		 251 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3235  ABC-2 type transporter, permease protein  85.26 
 
 		 251 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.460161  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3728  ABC-2 type transporter, permease protein  85.26 
 
 		 251 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2997  ABC transporter, permease protein  85.26 
 
 		 251 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3670  ABC-2 type transporter, permease protein  85.26 
 
 		 251 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.549508  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0400  ABC-2 type transporter  85.6 
 
 		 273 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.732955 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3519  ABC efflux pump, inner membrane subunit  84.46 
 
 		 251 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24829  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2686  ABC-2 type transporter  85.6 
 
 		 273 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.859674  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0348  ABC-2 type transporter  86 
 
 		 281 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431352  normal  0.251356 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0339  ABC-2 type transporter  86 
 
 		 281 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0421  ABC-2 type transporter  85.6 
 
 		 273 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.77682  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0324  ABC-2 type transporter  85.6 
 
 		 273 aa  436  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0584539  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2955  hypothetical protein  72 
 
 		 262 aa  360  2e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.279885  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2886  ABC-2 type transporter  71.08 
 
 		 262 aa  359  2e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0831309 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3233  ABC-2 type transporter  71.08 
 
 		 262 aa  359  3e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3115  hypothetical protein  73.49 
 
 		 273 aa  356  1.9999999999999998e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.661432  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1583  ABC-2 type transporter  67.73 
 
 		 256 aa  355  3.9999999999999996e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0567734 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0103  ABC-2 type transporter  70.8 
 
 		 262 aa  353  1e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.759758  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0827  putative transmembrane protein  67.2 
 
 		 251 aa  352  2.9999999999999997e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.366259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0692  ABC-2 type transporter  66.93 
 
 		 251 aa  348  6e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.815374  normal  0.797242 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0800  hypothetical protein  67.33 
 
 		 251 aa  347  1e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.200073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3252  multidrug ABC transporter permease component  72.29 
 
 		 273 aa  342  2.9999999999999997e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2743  hypothetical protein  66.14 
 
 		 251 aa  339  2e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0243  hypothetical protein  65.2 
 
 		 259 aa  340  2e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.113541 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0895  ABC-2 type transporter  68.4 
 
 		 271 aa  328  4e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.239157  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5529  ABC-2 type transporter  68.4 
 
 		 251 aa  327  9e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.188866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4455  ABC-2 type transporter  68.53 
 
 		 251 aa  322  5e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0350682  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1161  ABC-2 type transporter  68.4 
 
 		 254 aa  321  7e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.843909  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1020  ABC-2 type transporter  68.13 
 
 		 251 aa  319  3e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.269933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3395  hypothetical protein  66.8 
 
 		 250 aa  316  2e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0756  ABC-2 type transporter  66.14 
 
 		 251 aa  311  7.999999999999999e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.97763  normal  0.423446 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0723  ABC-2 type transporter  66.14 
 
 		 251 aa  310  1e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2942  hypothetical protein  66 
 
 		 251 aa  310  2e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.236721  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3036  ABC-2 type transporter  60.16 
 
 		 268 aa  293  2e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2645  ABC-2 type transporter  60.16 
 
 		 268 aa  293  2e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1893  ABC-2 type transport system permease protein  64.54 
 
 		 251 aa  287  1e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0985  hypothetical protein  54.22 
 
 		 255 aa  274  9e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0640  ABC-2 transporter component  47.18 
 
 		 270 aa  219  3e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0663  ABC-2 type transporter  46.43 
 
 		 274 aa  217  1e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2615  ABC-2 type transporter  46.22 
 
 		 267 aa  210  2e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.747872  hitchhiker  0.00151672 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0401  ABC-2 type transporter  47.18 
 
 		 302 aa  201  8e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.973292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1229  ABC-2 type transporter  48.41 
 
 		 273 aa  200  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal  0.0330448 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0097  ABC type transport system, integral membrane protein  43.32 
 
 		 264 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0486  ABC-2 type transporter  43.95 
 
 		 270 aa  192  4e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.197916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2479  hypothetical protein  43.46 
 
 		 292 aa  186  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1098  ABC-2 type transporter  37.2 
 
 		 257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1095  hypothetical protein  44.44 
 
 		 290 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0836  ABC transporter, inner membrane subunit  41.53 
 
 		 253 aa  181  7e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2042  ABC-2 type transporter  43.15 
 
 		 273 aa  180  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0166481 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3519  ABC-2 type transporter  39.27 
 
 		 256 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.238751  normal  0.0167423 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3588  ABC-2 type transporter  39.27 
 
 		 256 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0782802  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3711  ABC-2 type transporter  39.27 
 
 		 256 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0886  ABC-2 type transporter  41.94 
 
 		 253 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.301364  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0723  ABC-2 type transporter  39.27 
 
 		 256 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0849  ABC-type multidrug transport system, permease component  38.71 
 
 		 254 aa  179  2.9999999999999997e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.227676  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5173  ABC-2 type transporter  36.8 
 
 		 253 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.108513 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3260  ABC-2 type transporter  36.8 
 
 		 253 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0633139  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5108  ABC-2 type transporter  36.8 
 
 		 253 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3534  ABC-2 type transporter  36.03 
 
 		 256 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0831  ABC-2 type transporter  39.27 
 
 		 256 aa  178  8e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4581  ABC-2 type transporter  46.12 
 
 		 277 aa  178  8e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.380224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0882  ABC-2 type transporter  42.74 
 
 		 253 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1078  ABC-2 type transporter  38.46 
 
 		 260 aa  177  2e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0652  hypothetical protein  39.27 
 
 		 256 aa  176  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3143  ABC-2 type transporter  39.27 
 
 		 256 aa  177  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0824  ABC-2 type transporter  38.87 
 
 		 256 aa  177  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0795  ABC-2 type transporter  39.27 
 
 		 256 aa  177  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6044  ABC-2 type transporter  34.82 
 
 		 253 aa  176  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0380391  normal  0.233876 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6150  putative ABC-2 type transporter (permease protein)  35.66 
 
 		 253 aa  176  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00809538  normal  0.0938496 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0607  ABC-2 type transporter  39.11 
 
 		 271 aa  175  5e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.837549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2276  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.82 
 
 		 253 aa  175  5e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0123592  normal  0.410533 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3121  ABC-2 type transporter  37.8 
 
 		 256 aa  175  6e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3801  ABC transporter, permease protein  38.87 
 
 		 256 aa  175  6e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0540  ABC transporter, inner membrane subunit  35.46 
 
 		 253 aa  175  6e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0121  putative permease  37.35 
 
 		 256 aa  175  6e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0461  hypothetical protein  37.1 
 
 		 257 aa  175  6e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0612935  normal  0.787561 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1860  ABC-2 type transporter  39.36 
 
 		 257 aa  175  7e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0427  ABC transporter, inner membrane subunit  37.1 
 
 		 257 aa  174  8e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0749  ABC-2 type transporter  37.5 
 
 		 253 aa  175  8e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.41583 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002558  ABC-type multidrug transport system permease component  36 
 
 		 256 aa  174  9e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.644442  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2326  ABC-2 type transporter  36.03 
 
 		 253 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5044  ABC-2 type transporter  36.14 
 
 		 256 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.917306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4521  ABC-2 type transporter  36.14 
 
 		 256 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3995  ABC-2 type transporter  36.29 
 
 		 256 aa  174  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2722  ABC transporter membrane spanning protein  36.07 
 
 		 253 aa  173  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2088  ABC-2 type transporter  35.63 
 
 		 253 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0318264  normal  0.440249 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4025  ABC-2 type transporter  34 
 
 		 253 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3231  ABC-2 type transporter  38.46 
 
 		 256 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0121  ABC transporter, permease protein  36.99 
 
 		 256 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1607  ABC-2 type transporter  37.25 
 
 		 253 aa  172  5e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0979931  normal  0.144248 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3474  ABC-2 type transporter  36.59 
 
 		 256 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0136  ABC transporter, permease protein  36.59 
 
 		 256 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0138  ABC transporter, permease protein  36.59 
 
 		 256 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0130  ABC transporter, permease protein  36.59 
 
 		 256 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>