273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4581 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4581  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 277 aa  550  1e-155  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.380224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2479  hypothetical protein  62.33 
 
 		 292 aa  340  1e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1095  hypothetical protein  60.69 
 
 		 290 aa  325  7e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0486  ABC-2 type transporter  51.1 
 
 		 270 aa  238  5.999999999999999e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.197916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0663  ABC-2 type transporter  42.86 
 
 		 274 aa  208  8e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0640  ABC-2 transporter component  42.18 
 
 		 270 aa  206  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0401  ABC-2 type transporter  44.57 
 
 		 302 aa  204  2e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.973292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1229  ABC-2 type transporter  43.64 
 
 		 273 aa  203  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal  0.0330448 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2615  ABC-2 type transporter  43.17 
 
 		 267 aa  200  3e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.747872  hitchhiker  0.00151672 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2042  ABC-2 type transporter  46.46 
 
 		 273 aa  192  4e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0166481 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3252  multidrug ABC transporter permease component  45.5 
 
 		 273 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2743  hypothetical protein  44.05 
 
 		 251 aa  183  3e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0836  ABC transporter, inner membrane subunit  40.8 
 
 		 253 aa  182  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3233  ABC-2 type transporter  42.86 
 
 		 262 aa  182  7e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2886  ABC-2 type transporter  43.46 
 
 		 262 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0831309 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0324  ABC-2 type transporter  43.09 
 
 		 273 aa  180  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0584539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0243  hypothetical protein  44.34 
 
 		 259 aa  180  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.113541 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0895  ABC-2 type transporter  43.49 
 
 		 271 aa  179  4e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.239157  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0348  ABC-2 type transporter  39.72 
 
 		 281 aa  178  8e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431352  normal  0.251356 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0339  ABC-2 type transporter  39.72 
 
 		 281 aa  178  8e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3115  hypothetical protein  45.25 
 
 		 273 aa  178  9e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.661432  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3564  ABC-2 type transporter  46.12 
 
 		 251 aa  178  9e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.460574  hitchhiker  0.0000462468 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2763  ABC-2 type transporter  44.8 
 
 		 251 aa  177  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2955  hypothetical protein  43.56 
 
 		 262 aa  177  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.279885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0103  ABC-2 type transporter  42.47 
 
 		 262 aa  177  2e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.759758  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0985  hypothetical protein  37.89 
 
 		 255 aa  176  3e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1784  ABC transporter, permease protein  44.8 
 
 		 251 aa  175  8e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2718  ABC transporter, permease protein  44.8 
 
 		 251 aa  175  8e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3728  ABC-2 type transporter, permease protein  44.8 
 
 		 251 aa  175  8e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3235  ABC-2 type transporter, permease protein  44.8 
 
 		 251 aa  175  8e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.460161  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3697  ABC transporter, permease protein  44.8 
 
 		 251 aa  175  8e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3670  ABC-2 type transporter, permease protein  44.8 
 
 		 251 aa  175  8e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.549508  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0400  ABC-2 type transporter  44.07 
 
 		 273 aa  175  8e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.732955 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2769  ABC-2 type transporter, permease protein  44.8 
 
 		 251 aa  175  8e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2686  ABC-2 type transporter  44.07 
 
 		 273 aa  175  9e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.859674  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0421  ABC-2 type transporter  44.07 
 
 		 273 aa  175  9e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.77682  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2997  ABC transporter, permease protein  45.21 
 
 		 251 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3519  ABC efflux pump, inner membrane subunit  45.05 
 
 		 251 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24829  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0886  ABC-2 type transporter  38.8 
 
 		 253 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.301364  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0394  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  44.34 
 
 		 254 aa  172  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2645  ABC-2 type transporter  44.95 
 
 		 268 aa  171  7.999999999999999e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3036  ABC-2 type transporter  44.95 
 
 		 268 aa  171  7.999999999999999e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0800  hypothetical protein  40.16 
 
 		 251 aa  171  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.200073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0882  ABC-2 type transporter  38.4 
 
 		 253 aa  170  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0692  ABC-2 type transporter  40.78 
 
 		 251 aa  169  4e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.815374  normal  0.797242 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0827  putative transmembrane protein  42.25 
 
 		 251 aa  168  8e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.366259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1583  ABC-2 type transporter  40.7 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0567734 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3395  hypothetical protein  40.54 
 
 		 250 aa  165  8e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0898  ABC-2 type transporter  40.45 
 
 		 253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4455  ABC-2 type transporter  43.48 
 
 		 251 aa  159  4e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0350682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0756  ABC-2 type transporter  41.63 
 
 		 251 aa  159  5e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.97763  normal  0.423446 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5529  ABC-2 type transporter  42.8 
 
 		 251 aa  158  9e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.188866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2942  hypothetical protein  42.66 
 
 		 251 aa  158  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.236721  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0723  ABC-2 type transporter  41.18 
 
 		 251 aa  157  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1020  ABC-2 type transporter  40.65 
 
 		 251 aa  155  6e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.269933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1161  ABC-2 type transporter  42.08 
 
 		 254 aa  154  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.843909  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1893  ABC-2 type transport system permease protein  40.91 
 
 		 251 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3138  ABC-2 type transporter  37.21 
 
 		 253 aa  152  8e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00549881  normal  0.763555 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0097  ABC type transport system, integral membrane protein  35.02 
 
 		 264 aa  151  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3121  ABC-2 type transporter  35.91 
 
 		 256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2524  ABC-2 type transporter  34.88 
 
 		 253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.438838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0478  ABC-2 type transporter  36.29 
 
 		 253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.704988  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1714  ABC-2 type transporter  37.45 
 
 		 253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42149  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2326  ABC-2 type transporter  38.17 
 
 		 253 aa  146  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4006  ABC-2 type transporter  35.04 
 
 		 253 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3273  ABC multidrug/carbohydrate efflux transporter, inner membrane subunit  35.04 
 
 		 253 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.86814  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03555  ABC-type multidrug transport system, permease component  35.29 
 
 		 271 aa  144  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2121  ABC transporter, permease protein  35.46 
 
 		 254 aa  143  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0639  ABC-2 type transporter  33.46 
 
 		 253 aa  144  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1332  ABC-2 type transporter  33.46 
 
 		 253 aa  144  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.993972  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2088  ABC-2 type transporter  37.5 
 
 		 253 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0318264  normal  0.440249 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2722  ABC transporter membrane spanning protein  35.66 
 
 		 253 aa  143  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0574  ABC-2 type transporter permease protein  36.04 
 
 		 257 aa  142  4e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0704  ABC-2 type transporter  36.15 
 
 		 259 aa  142  5e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0516518 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2924  putative ABC transporter inner membrane subunit  34.25 
 
 		 253 aa  141  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0189  ABC transporter permease protein  34.62 
 
 		 256 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0197  ABC transporter permease  34.62 
 
 		 256 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.737997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0192  ABC transporter permease  34.62 
 
 		 256 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.333926 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1607  ABC-2 type transporter  34.51 
 
 		 253 aa  141  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0979931  normal  0.144248 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0205  ABC transporter, permease protein  34.62 
 
 		 256 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0188  ABC transporter permease  34.62 
 
 		 256 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.137921  normal  0.864827 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5173  ABC-2 type transporter  33.2 
 
 		 253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.108513 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2362  ABC transporter, inner membrane subunit  36.48 
 
 		 253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0916375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1453  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3260  ABC-2 type transporter  33.2 
 
 		 253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0633139  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5108  ABC-2 type transporter  33.2 
 
 		 253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0379  ABC-2 type transporter  34.38 
 
 		 259 aa  140  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.8814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0411  ABC-2 type transporter  34.38 
 
 		 259 aa  140  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.164581 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0861  ABC-2 type transporter  32.81 
 
 		 255 aa  140  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0630993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0447  ABC-2 type transporter  34.63 
 
 		 259 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3995  ABC-2 type transporter  32.95 
 
 		 256 aa  139  4.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0676  ABC-2 type transporter  33.98 
 
 		 256 aa  139  4.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.655554 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2741  hypothetical protein  34.88 
 
 		 253 aa  139  6e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.919871  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1926  ABC-2 type transporter  36.94 
 
 		 255 aa  139  6e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.14437 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1025  ABC-2 type transporter  33.98 
 
 		 256 aa  139  7e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0880893  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3083  ABC transporter permease  37.84 
 
 		 253 aa  138  7.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.646009  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2408  ABC-2 type transporter  34.84 
 
 		 253 aa  138  7.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0130  ABC transporter, permease protein  32.55 
 
 		 256 aa  138  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2276  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.2 
 
 		 253 aa  138  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0123592  normal  0.410533 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0136  ABC transporter, permease protein  32.55 
 
 		 256 aa  138  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>