More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0103 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0103  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 262 aa  525  1e-148  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.759758  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3564  ABC-2 type transporter  70.8 
 
 		 251 aa  353  1e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.460574  hitchhiker  0.0000462468 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0692  ABC-2 type transporter  66.8 
 
 		 251 aa  353  1e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.815374  normal  0.797242 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1583  ABC-2 type transporter  70 
 
 		 256 aa  352  2.9999999999999997e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0567734 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0394  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  69.6 
 
 		 254 aa  350  2e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0827  putative transmembrane protein  67.87 
 
 		 251 aa  350  2e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.366259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0800  hypothetical protein  66.8 
 
 		 251 aa  348  5e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.200073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2763  ABC-2 type transporter  69.2 
 
 		 251 aa  347  1e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3233  ABC-2 type transporter  68.67 
 
 		 262 aa  347  1e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2886  ABC-2 type transporter  68.27 
 
 		 262 aa  347  1e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0831309 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3115  hypothetical protein  72.69 
 
 		 273 aa  346  2e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.661432  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2955  hypothetical protein  69.6 
 
 		 262 aa  345  4e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.279885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0400  ABC-2 type transporter  68.13 
 
 		 273 aa  343  1e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.732955 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2686  ABC-2 type transporter  68.13 
 
 		 273 aa  343  2e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.859674  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0421  ABC-2 type transporter  68.13 
 
 		 273 aa  343  2e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.77682  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0348  ABC-2 type transporter  65.76 
 
 		 281 aa  342  4e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431352  normal  0.251356 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0339  ABC-2 type transporter  65.76 
 
 		 281 aa  342  4e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0324  ABC-2 type transporter  68.13 
 
 		 273 aa  342  5e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0584539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3519  ABC efflux pump, inner membrane subunit  67.6 
 
 		 251 aa  341  5e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24829  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2997  ABC transporter, permease protein  66 
 
 		 251 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1784  ABC transporter, permease protein  65.6 
 
 		 251 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2718  ABC transporter, permease protein  65.6 
 
 		 251 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3235  ABC-2 type transporter, permease protein  65.6 
 
 		 251 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.460161  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3670  ABC-2 type transporter, permease protein  65.6 
 
 		 251 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.549508  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3697  ABC transporter, permease protein  65.6 
 
 		 251 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3728  ABC-2 type transporter, permease protein  65.6 
 
 		 251 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2769  ABC-2 type transporter, permease protein  65.6 
 
 		 251 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3252  multidrug ABC transporter permease component  71.49 
 
 		 273 aa  334  7e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0895  ABC-2 type transporter  67.47 
 
 		 271 aa  333  2e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.239157  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5529  ABC-2 type transporter  69.08 
 
 		 251 aa  330  2e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.188866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0243  hypothetical protein  65.71 
 
 		 259 aa  328  8e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.113541 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1161  ABC-2 type transporter  68.67 
 
 		 254 aa  323  1e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.843909  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4455  ABC-2 type transporter  68 
 
 		 251 aa  317  9e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0350682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1020  ABC-2 type transporter  69.2 
 
 		 251 aa  316  3e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.269933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0756  ABC-2 type transporter  69.48 
 
 		 251 aa  315  7e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.97763  normal  0.423446 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0723  ABC-2 type transporter  69.48 
 
 		 251 aa  314  9.999999999999999e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2743  hypothetical protein  62 
 
 		 251 aa  311  4.999999999999999e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3395  hypothetical protein  64.78 
 
 		 250 aa  310  1e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2942  hypothetical protein  66.27 
 
 		 251 aa  300  1e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.236721  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0985  hypothetical protein  60.98 
 
 		 255 aa  289  3e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3036  ABC-2 type transporter  56.5 
 
 		 268 aa  280  1e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2645  ABC-2 type transporter  56.5 
 
 		 268 aa  280  1e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1893  ABC-2 type transport system permease protein  63.2 
 
 		 251 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2615  ABC-2 type transporter  43.45 
 
 		 267 aa  211  1e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.747872  hitchhiker  0.00151672 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0663  ABC-2 type transporter  45.63 
 
 		 274 aa  211  1e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0640  ABC-2 transporter component  45.75 
 
 		 270 aa  210  2e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0097  ABC type transport system, integral membrane protein  44.53 
 
 		 264 aa  191  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1229  ABC-2 type transporter  47.08 
 
 		 273 aa  186  5e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal  0.0330448 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2479  hypothetical protein  42.16 
 
 		 292 aa  183  3e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0836  ABC transporter, inner membrane subunit  40.56 
 
 		 253 aa  180  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2042  ABC-2 type transporter  44.58 
 
 		 273 aa  180  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0166481 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0486  ABC-2 type transporter  41.13 
 
 		 270 aa  177  1e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.197916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4581  ABC-2 type transporter  42.47 
 
 		 277 aa  177  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.380224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02790  permease  40.24 
 
 		 263 aa  174  9.999999999999999e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0401  ABC-2 type transporter  45.02 
 
 		 302 aa  173  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.973292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1098  ABC-2 type transporter  35.6 
 
 		 257 aa  173  2.9999999999999996e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1095  hypothetical protein  40.82 
 
 		 290 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0886  ABC-2 type transporter  40.16 
 
 		 253 aa  172  5e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.301364  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0882  ABC-2 type transporter  40.96 
 
 		 253 aa  172  5e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0607  ABC-2 type transporter  38 
 
 		 271 aa  170  2e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.837549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1860  ABC-2 type transporter  38.15 
 
 		 257 aa  169  6e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1332  ABC-2 type transporter  39.26 
 
 		 253 aa  167  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.993972  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0427  ABC transporter, inner membrane subunit  36.55 
 
 		 257 aa  167  2e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0461  hypothetical protein  36.55 
 
 		 257 aa  167  2e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0612935  normal  0.787561 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6150  putative ABC-2 type transporter (permease protein)  37.25 
 
 		 253 aa  166  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00809538  normal  0.0938496 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3995  ABC-2 type transporter  37.86 
 
 		 256 aa  166  4e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2362  ABC transporter, inner membrane subunit  37.65 
 
 		 253 aa  165  6.9999999999999995e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0916375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0977  ABC transporter permease protein  39.26 
 
 		 255 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.024266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0121  putative permease  35.71 
 
 		 256 aa  165  8e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3711  ABC-2 type transporter  37.5 
 
 		 256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3519  ABC-2 type transporter  37.5 
 
 		 256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.238751  normal  0.0167423 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3284  hypothetical protein  37.45 
 
 		 255 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0995545  normal  0.811608 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0723  ABC-2 type transporter  37.5 
 
 		 256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3588  ABC-2 type transporter  37.5 
 
 		 256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0782802  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1896  ABC transporter  34.96 
 
 		 259 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.312969  hitchhiker  0.0000781572 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002558  ABC-type multidrug transport system permease component  35.18 
 
 		 256 aa  163  3e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.644442  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3881  ABC-2 type transporter  37.4 
 
 		 263 aa  162  3e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.574088  normal  0.697417 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0898  ABC-2 type transporter  40.24 
 
 		 253 aa  162  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1221  ABC-2 type transporter  35.95 
 
 		 253 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.389129  decreased coverage  0.00710452 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2722  ABC transporter membrane spanning protein  34.58 
 
 		 253 aa  162  6e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3270  ABC-2 type transporter  37.86 
 
 		 253 aa  162  6e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0824  ABC-2 type transporter  37.9 
 
 		 256 aa  162  6e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0121  ABC transporter, permease protein  36.36 
 
 		 256 aa  162  6e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2833  ABC transporter, inner membrane subunit  36.29 
 
 		 258 aa  162  7e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2741  hypothetical protein  36.21 
 
 		 253 aa  161  8.000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.919871  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3143  ABC-2 type transporter  37.5 
 
 		 256 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0795  ABC-2 type transporter  37.5 
 
 		 256 aa  161  9e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4686  ABC-2 type transporter  36.63 
 
 		 253 aa  160  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.731572  normal  0.106911 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0773  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems permease component  36.65 
 
 		 256 aa  161  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1471  ABC-2 type transporter  34.55 
 
 		 259 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3260  ABC-2 type transporter  35.71 
 
 		 253 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0633139  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6044  ABC-2 type transporter  36.84 
 
 		 253 aa  161  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0380391  normal  0.233876 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5173  ABC-2 type transporter  35.71 
 
 		 253 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.108513 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0849  ABC-type multidrug transport system, permease component  35.74 
 
 		 254 aa  161  1e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.227676  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5108  ABC-2 type transporter  35.71 
 
 		 253 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3474  ABC-2 type transporter  35.95 
 
 		 256 aa  160  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2276  ABC efflux pump, inner membrane subunit  36.84 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0123592  normal  0.410533 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0652  hypothetical protein  37.1 
 
 		 256 aa  160  2e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0136  ABC transporter, permease protein  35.95 
 
 		 256 aa  160  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03454  hypothetical protein  34.52 
 
 		 256 aa  160  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>