More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0692 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0692  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 251 aa  494  1e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.815374  normal  0.797242 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0800  hypothetical protein  89.64 
 
 		 251 aa  451  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.200073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0827  putative transmembrane protein  75.2 
 
 		 251 aa  390  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.366259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5529  ABC-2 type transporter  79.2 
 
 		 251 aa  388  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.188866  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1161  ABC-2 type transporter  80.32 
 
 		 254 aa  386  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.843909  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1020  ABC-2 type transporter  78.49 
 
 		 251 aa  375  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.269933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1583  ABC-2 type transporter  71.31 
 
 		 256 aa  372  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0567734 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0756  ABC-2 type transporter  78.88 
 
 		 251 aa  370  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.97763  normal  0.423446 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4455  ABC-2 type transporter  78.49 
 
 		 251 aa  369  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0350682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0723  ABC-2 type transporter  78.88 
 
 		 251 aa  369  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3233  ABC-2 type transporter  71.49 
 
 		 262 aa  365  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2886  ABC-2 type transporter  70.68 
 
 		 262 aa  364  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0831309 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0103  ABC-2 type transporter  66.8 
 
 		 262 aa  353  1e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.759758  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2955  hypothetical protein  70.8 
 
 		 262 aa  352  4e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.279885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0243  hypothetical protein  66.4 
 
 		 259 aa  350  2e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.113541 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3728  ABC-2 type transporter, permease protein  69.72 
 
 		 251 aa  349  3e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2718  ABC transporter, permease protein  69.72 
 
 		 251 aa  349  3e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3697  ABC transporter, permease protein  69.72 
 
 		 251 aa  349  3e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3670  ABC-2 type transporter, permease protein  69.72 
 
 		 251 aa  349  3e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.549508  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1784  ABC transporter, permease protein  69.72 
 
 		 251 aa  349  3e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2769  ABC-2 type transporter, permease protein  69.72 
 
 		 251 aa  349  3e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3235  ABC-2 type transporter, permease protein  69.72 
 
 		 251 aa  349  3e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.460161  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3519  ABC efflux pump, inner membrane subunit  68.13 
 
 		 251 aa  348  4e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24829  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2997  ABC transporter, permease protein  69.32 
 
 		 251 aa  348  4e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0324  ABC-2 type transporter  70 
 
 		 273 aa  348  5e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0584539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3564  ABC-2 type transporter  66.93 
 
 		 251 aa  348  6e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.460574  hitchhiker  0.0000462468 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0348  ABC-2 type transporter  69.32 
 
 		 281 aa  347  8e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431352  normal  0.251356 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0339  ABC-2 type transporter  69.32 
 
 		 281 aa  347  8e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0394  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  67.2 
 
 		 254 aa  346  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2763  ABC-2 type transporter  69.44 
 
 		 251 aa  345  3e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2686  ABC-2 type transporter  68 
 
 		 273 aa  345  5e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.859674  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0400  ABC-2 type transporter  68 
 
 		 273 aa  345  5e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.732955 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0421  ABC-2 type transporter  68 
 
 		 273 aa  345  5e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.77682  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3115  hypothetical protein  70.52 
 
 		 273 aa  344  8.999999999999999e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.661432  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2942  hypothetical protein  72 
 
 		 251 aa  339  2.9999999999999998e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.236721  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2743  hypothetical protein  65.74 
 
 		 251 aa  336  1.9999999999999998e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0895  ABC-2 type transporter  67.2 
 
 		 271 aa  331  7.000000000000001e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.239157  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3252  multidrug ABC transporter permease component  68.92 
 
 		 273 aa  331  8e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3395  hypothetical protein  67.6 
 
 		 250 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2645  ABC-2 type transporter  56.91 
 
 		 268 aa  276  3e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3036  ABC-2 type transporter  56.91 
 
 		 268 aa  276  3e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0985  hypothetical protein  54.62 
 
 		 255 aa  275  5e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1893  ABC-2 type transport system permease protein  61.75 
 
 		 251 aa  272  3e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2615  ABC-2 type transporter  43.95 
 
 		 267 aa  206  2e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.747872  hitchhiker  0.00151672 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0663  ABC-2 type transporter  44.22 
 
 		 274 aa  206  3e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0097  ABC type transport system, integral membrane protein  40.89 
 
 		 264 aa  195  7e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0640  ABC-2 transporter component  44.13 
 
 		 270 aa  193  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0836  ABC transporter, inner membrane subunit  42.34 
 
 		 253 aa  187  9e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1098  ABC-2 type transporter  39.6 
 
 		 257 aa  186  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1229  ABC-2 type transporter  43.48 
 
 		 273 aa  186  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal  0.0330448 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0886  ABC-2 type transporter  42.34 
 
 		 253 aa  185  7e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.301364  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0486  ABC-2 type transporter  43.2 
 
 		 270 aa  184  2.0000000000000003e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.197916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0882  ABC-2 type transporter  41.94 
 
 		 253 aa  181  8.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1095  hypothetical protein  45 
 
 		 290 aa  179  4e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0401  ABC-2 type transporter  43.9 
 
 		 302 aa  178  7e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.973292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02790  permease  38.37 
 
 		 263 aa  177  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0427  ABC transporter, inner membrane subunit  36.95 
 
 		 257 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0607  ABC-2 type transporter  38.15 
 
 		 271 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.837549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0461  hypothetical protein  36.95 
 
 		 257 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0612935  normal  0.787561 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2479  hypothetical protein  41.98 
 
 		 292 aa  172  2.9999999999999996e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1860  ABC-2 type transporter  38.8 
 
 		 257 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3881  ABC-2 type transporter  37.55 
 
 		 263 aa  171  9e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.574088  normal  0.697417 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0881  ABC-2 type transporter  36.48 
 
 		 276 aa  171  1e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0574  ABC-2 type transporter permease protein  36.9 
 
 		 257 aa  169  4e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4581  ABC-2 type transporter  40.78 
 
 		 277 aa  169  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.380224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2042  ABC-2 type transporter  41.6 
 
 		 273 aa  169  5e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0166481 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0559  ABC transporter permease protein  38.52 
 
 		 259 aa  168  7e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1171  16S rRNA processing protein RimM  40.32 
 
 		 257 aa  167  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.730617  hitchhiker  0.000000152208 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3121  ABC-2 type transporter  41.38 
 
 		 256 aa  166  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0849  ABC-type multidrug transport system, permease component  40.55 
 
 		 254 aa  167  2e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.227676  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0495  ABC-2 type transporter  38.11 
 
 		 259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03555  ABC-type multidrug transport system, permease component  39.18 
 
 		 271 aa  166  4e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1896  ABC transporter  38.74 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.312969  hitchhiker  0.0000781572 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2121  ABC transporter, permease protein  36.18 
 
 		 254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3519  ABC-2 type transporter  38.33 
 
 		 256 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.238751  normal  0.0167423 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0723  ABC-2 type transporter  38.33 
 
 		 256 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3995  ABC-2 type transporter  39.52 
 
 		 256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3711  ABC-2 type transporter  38.33 
 
 		 256 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3588  ABC-2 type transporter  38.33 
 
 		 256 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0782802  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1471  ABC-2 type transporter  38.34 
 
 		 259 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3143  ABC-2 type transporter  36.84 
 
 		 256 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1506  ABC-2 type transporter  37.7 
 
 		 259 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5173  ABC-2 type transporter  33.73 
 
 		 253 aa  162  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.108513 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0795  ABC-2 type transporter  36.84 
 
 		 256 aa  163  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3260  ABC-2 type transporter  33.73 
 
 		 253 aa  162  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0633139  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3819  ABC-2 type transporter  37.7 
 
 		 259 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.728867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0824  ABC-2 type transporter  36.44 
 
 		 256 aa  162  3e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5108  ABC-2 type transporter  33.73 
 
 		 253 aa  162  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1025  ABC-2 type transporter  41.56 
 
 		 256 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0880893  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3854  ABC transporter, permease protein  35.86 
 
 		 262 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.605289  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27780  putative ABC transporter, permease protein  37.7 
 
 		 259 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.235012 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3801  ABC transporter, permease protein  36.84 
 
 		 256 aa  161  7e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1631  hypothetical protein  35.46 
 
 		 262 aa  162  7e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000356157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2346  ABC transporter  37.7 
 
 		 259 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0982615  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0652  hypothetical protein  35.2 
 
 		 256 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0808  hypothetical protein  36.33 
 
 		 253 aa  161  8.000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.283236  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1005  ABC transporter, permease protein  37.2 
 
 		 254 aa  161  9e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0478  ABC-2 type transporter  35.77 
 
 		 253 aa  161  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.704988  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2722  ABC transporter membrane spanning protein  32.79 
 
 		 253 aa  161  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0773  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems permease component  38.53 
 
 		 256 aa  160  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>