More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0097 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0097  ABC type transport system, integral membrane protein  100 
 
 		 264 aa  522  1e-147  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0121  putative permease  43.65 
 
 		 256 aa  221  8e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2121  ABC transporter, permease protein  45.71 
 
 		 254 aa  219  3e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3233  ABC-2 type transporter  46 
 
 		 262 aa  218  8.999999999999998e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2886  ABC-2 type transporter  45.6 
 
 		 262 aa  217  1e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0831309 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03454  hypothetical protein  43.2 
 
 		 256 aa  216  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1078  ABC-2 type transporter  44.8 
 
 		 260 aa  216  2e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0205  ABC transporter, permease protein  43.82 
 
 		 256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0189  ABC transporter permease protein  43.82 
 
 		 256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0192  ABC transporter permease  43.82 
 
 		 256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.333926 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0243  hypothetical protein  46.12 
 
 		 259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.113541 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0197  ABC transporter permease  43.82 
 
 		 256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.737997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0188  ABC transporter permease  43.82 
 
 		 256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.137921  normal  0.864827 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00127  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  43.43 
 
 		 256 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3474  ABC-2 type transporter  43.43 
 
 		 256 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0138  ABC transporter, permease protein  43.43 
 
 		 256 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0136  ABC transporter, permease protein  43.43 
 
 		 256 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3531  ABC-2 type transporter  43.43 
 
 		 256 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0132  ABC transporter, permease protein  43.43 
 
 		 256 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0130  ABC transporter, permease protein  43.43 
 
 		 256 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0849  ABC-type multidrug transport system, permease component  43.14 
 
 		 254 aa  213  2.9999999999999995e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.227676  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00126  hypothetical protein  43.43 
 
 		 256 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002558  ABC-type multidrug transport system permease component  42.8 
 
 		 256 aa  212  3.9999999999999995e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.644442  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0121  ABC transporter, permease protein  43.03 
 
 		 256 aa  210  2e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2718  ABC transporter, permease protein  45.75 
 
 		 251 aa  209  5e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3697  ABC transporter, permease protein  45.75 
 
 		 251 aa  209  5e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3670  ABC-2 type transporter, permease protein  45.75 
 
 		 251 aa  209  5e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.549508  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3235  ABC-2 type transporter, permease protein  45.75 
 
 		 251 aa  209  5e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.460161  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3728  ABC-2 type transporter, permease protein  45.75 
 
 		 251 aa  209  5e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2769  ABC-2 type transporter, permease protein  45.75 
 
 		 251 aa  209  5e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1784  ABC transporter, permease protein  45.75 
 
 		 251 aa  209  5e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2997  ABC transporter, permease protein  46.15 
 
 		 251 aa  207  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3995  ABC-2 type transporter  43.43 
 
 		 256 aa  207  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2955  hypothetical protein  44.8 
 
 		 262 aa  206  3e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.279885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1171  16S rRNA processing protein RimM  42.13 
 
 		 257 aa  206  4e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.730617  hitchhiker  0.000000152208 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0339  ABC-2 type transporter  44.79 
 
 		 281 aa  206  4e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0348  ABC-2 type transporter  44.79 
 
 		 281 aa  206  4e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431352  normal  0.251356 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0324  ABC-2 type transporter  45.24 
 
 		 273 aa  204  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0584539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0461  hypothetical protein  41.04 
 
 		 257 aa  204  2e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0612935  normal  0.787561 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3121  ABC-2 type transporter  42.63 
 
 		 256 aa  203  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1896  ABC transporter  40.78 
 
 		 259 aa  202  3e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.312969  hitchhiker  0.0000781572 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2686  ABC-2 type transporter  45.75 
 
 		 273 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.859674  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0400  ABC-2 type transporter  45.75 
 
 		 273 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.732955 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0421  ABC-2 type transporter  45.75 
 
 		 273 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.77682  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03555  ABC-type multidrug transport system, permease component  41.83 
 
 		 271 aa  202  7e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3519  ABC efflux pump, inner membrane subunit  45.34 
 
 		 251 aa  201  8e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24829  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0607  ABC-2 type transporter  40.48 
 
 		 271 aa  201  8e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.837549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1631  hypothetical protein  41.06 
 
 		 262 aa  201  9e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000356157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3252  multidrug ABC transporter permease component  45.34 
 
 		 273 aa  201  9e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1005  ABC transporter, permease protein  40.56 
 
 		 254 aa  201  9.999999999999999e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0676  ABC-2 type transporter  42.23 
 
 		 256 aa  201  9.999999999999999e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.655554 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2833  ABC transporter, inner membrane subunit  42.8 
 
 		 258 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1583  ABC-2 type transporter  44.49 
 
 		 256 aa  201  9.999999999999999e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0567734 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1471  ABC-2 type transporter  40.39 
 
 		 259 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3854  ABC transporter, permease protein  40.65 
 
 		 262 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.605289  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1016  ABC transporter permease  41.43 
 
 		 256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.875005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1860  ABC-2 type transporter  40 
 
 		 257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0881  ABC-2 type transporter  42.11 
 
 		 276 aa  200  1.9999999999999998e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3348  ABC transporter, permease protein  41.43 
 
 		 256 aa  199  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0192428  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3476  ABC-2 type transporter  41.43 
 
 		 256 aa  199  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2137  ABC-2 type transporter  40.8 
 
 		 257 aa  199  3e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0672016  normal  0.103113 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0827  putative transmembrane protein  43.67 
 
 		 251 aa  199  3e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.366259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2763  ABC-2 type transporter  43.32 
 
 		 251 aa  198  6e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0427  ABC transporter, inner membrane subunit  39.84 
 
 		 257 aa  198  7.999999999999999e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3115  hypothetical protein  45.34 
 
 		 273 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.661432  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0836  ABC transporter, inner membrane subunit  44.08 
 
 		 253 aa  196  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0895  ABC-2 type transporter  43.32 
 
 		 271 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.239157  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3564  ABC-2 type transporter  43.32 
 
 		 251 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.460574  hitchhiker  0.0000462468 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0394  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  43.72 
 
 		 254 aa  196  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1025  ABC-2 type transporter  41.83 
 
 		 256 aa  196  3e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0880893  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0574  ABC-2 type transporter permease protein  45.05 
 
 		 257 aa  196  5.000000000000001e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0886  ABC-2 type transporter  43.27 
 
 		 253 aa  195  6e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.301364  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0882  ABC-2 type transporter  44.08 
 
 		 253 aa  195  7e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0692  ABC-2 type transporter  40.89 
 
 		 251 aa  195  8.000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.815374  normal  0.797242 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3819  ABC-2 type transporter  40.39 
 
 		 259 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.728867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0985  hypothetical protein  40 
 
 		 255 aa  193  2e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3395  hypothetical protein  47.43 
 
 		 250 aa  193  3e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1012  ABC transporter, permease protein  40.4 
 
 		 257 aa  193  3e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000447992  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1142  ABC transporter permease protein  40.4 
 
 		 257 aa  193  3e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0101435  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0800  hypothetical protein  39.27 
 
 		 251 aa  193  3e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.200073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0898  ABC-2 type transporter  43.27 
 
 		 253 aa  193  3e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3036  ABC-2 type transporter  43.95 
 
 		 268 aa  192  4e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2645  ABC-2 type transporter  43.95 
 
 		 268 aa  192  4e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1352  hypothetical protein  37.85 
 
 		 257 aa  192  5e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000725132  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02790  permease  38.8 
 
 		 263 aa  192  5e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5529  ABC-2 type transporter  43.72 
 
 		 251 aa  191  9e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.188866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2614  ABC transporter, integral membrane protein  39.29 
 
 		 256 aa  191  1e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.838377  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1157  ABC-2 type transporter  41.83 
 
 		 256 aa  191  1e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0839963  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0103  ABC-2 type transporter  44.53 
 
 		 262 aa  191  1e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.759758  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4180  hypothetical protein  40.41 
 
 		 259 aa  190  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2346  ABC transporter  40.82 
 
 		 259 aa  190  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0982615  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27780  putative ABC transporter, permease protein  40.82 
 
 		 259 aa  190  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.235012 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2743  hypothetical protein  41.94 
 
 		 251 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2826  ABC-2 type transporter  43.03 
 
 		 256 aa  189  4e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.525501  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1920  ABC-2 type transporter  38.78 
 
 		 264 aa  189  4e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00135758  normal  0.376856 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0454  hypothetical protein  38.78 
 
 		 257 aa  189  5e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0430  hypothetical protein  38.78 
 
 		 257 aa  189  5e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0723  ABC-2 type transporter  39.2 
 
 		 256 aa  189  5e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3711  ABC-2 type transporter  39.2 
 
 		 256 aa  189  5e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3519  ABC-2 type transporter  39.2 
 
 		 256 aa  189  5e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.238751  normal  0.0167423 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>