More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1095 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1095  hypothetical protein  100 
 
 		 290 aa  571  1.0000000000000001e-162  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4581  ABC-2 type transporter  60.69 
 
 		 277 aa  336  2.9999999999999997e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.380224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2479  hypothetical protein  57.68 
 
 		 292 aa  323  2e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0401  ABC-2 type transporter  46.5 
 
 		 302 aa  228  7e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.973292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0640  ABC-2 transporter component  45.93 
 
 		 270 aa  222  6e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0486  ABC-2 type transporter  48.26 
 
 		 270 aa  221  9.999999999999999e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.197916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0663  ABC-2 type transporter  46.44 
 
 		 274 aa  212  7.999999999999999e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2615  ABC-2 type transporter  45.75 
 
 		 267 aa  194  2e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.747872  hitchhiker  0.00151672 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1229  ABC-2 type transporter  45.82 
 
 		 273 aa  194  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal  0.0330448 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0394  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  45.2 
 
 		 254 aa  192  7e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3564  ABC-2 type transporter  44.44 
 
 		 251 aa  191  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.460574  hitchhiker  0.0000462468 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0243  hypothetical protein  40.7 
 
 		 259 aa  191  2e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.113541 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2042  ABC-2 type transporter  43.48 
 
 		 273 aa  189  2.9999999999999997e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0166481 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0339  ABC-2 type transporter  40.14 
 
 		 281 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0348  ABC-2 type transporter  40.14 
 
 		 281 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431352  normal  0.251356 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2886  ABC-2 type transporter  43.25 
 
 		 262 aa  187  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0831309 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3233  ABC-2 type transporter  42.46 
 
 		 262 aa  186  3e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0800  hypothetical protein  42.46 
 
 		 251 aa  186  6e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.200073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0692  ABC-2 type transporter  42.91 
 
 		 251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.815374  normal  0.797242 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0324  ABC-2 type transporter  39.45 
 
 		 273 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0584539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2743  hypothetical protein  40.24 
 
 		 251 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2763  ABC-2 type transporter  42.86 
 
 		 251 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2769  ABC-2 type transporter, permease protein  42.46 
 
 		 251 aa  182  6e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2718  ABC transporter, permease protein  42.46 
 
 		 251 aa  182  6e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3697  ABC transporter, permease protein  42.46 
 
 		 251 aa  182  6e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1784  ABC transporter, permease protein  42.46 
 
 		 251 aa  182  6e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3235  ABC-2 type transporter, permease protein  42.46 
 
 		 251 aa  182  6e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.460161  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3728  ABC-2 type transporter, permease protein  42.46 
 
 		 251 aa  182  6e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3670  ABC-2 type transporter, permease protein  42.46 
 
 		 251 aa  182  6e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.549508  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3519  ABC efflux pump, inner membrane subunit  41.67 
 
 		 251 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24829  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2997  ABC transporter, permease protein  42.69 
 
 		 251 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0103  ABC-2 type transporter  40.82 
 
 		 262 aa  181  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.759758  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2686  ABC-2 type transporter  40.87 
 
 		 273 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.859674  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0400  ABC-2 type transporter  40.87 
 
 		 273 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.732955 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0421  ABC-2 type transporter  40.87 
 
 		 273 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.77682  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1583  ABC-2 type transporter  43.14 
 
 		 256 aa  178  8e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0567734 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2645  ABC-2 type transporter  45.24 
 
 		 268 aa  178  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3036  ABC-2 type transporter  45.24 
 
 		 268 aa  178  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3252  multidrug ABC transporter permease component  41.6 
 
 		 273 aa  175  7e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2955  hypothetical protein  41.67 
 
 		 262 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.279885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0827  putative transmembrane protein  42.19 
 
 		 251 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.366259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3395  hypothetical protein  44 
 
 		 250 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3115  hypothetical protein  43.89 
 
 		 273 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.661432  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0895  ABC-2 type transporter  42.21 
 
 		 271 aa  172  6.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.239157  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0836  ABC transporter, inner membrane subunit  39.22 
 
 		 253 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0985  hypothetical protein  36.18 
 
 		 255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03555  ABC-type multidrug transport system, permease component  36.82 
 
 		 271 aa  162  5.0000000000000005e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1161  ABC-2 type transporter  41.31 
 
 		 254 aa  161  9e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.843909  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0411  ABC-2 type transporter  36.5 
 
 		 259 aa  161  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.164581 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0379  ABC-2 type transporter  36.5 
 
 		 259 aa  161  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.8814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0886  ABC-2 type transporter  37.65 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.301364  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0447  ABC-2 type transporter  36.54 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0882  ABC-2 type transporter  38.82 
 
 		 253 aa  159  6e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1893  ABC-2 type transport system permease protein  41.47 
 
 		 251 aa  159  7e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4455  ABC-2 type transporter  43.58 
 
 		 251 aa  158  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0350682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2088  ABC-2 type transporter  34.36 
 
 		 253 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0318264  normal  0.440249 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0704  ABC-2 type transporter  36.88 
 
 		 259 aa  156  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0516518 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1912  ABC-2 type transporter  34.62 
 
 		 253 aa  157  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.846791  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2326  ABC-2 type transporter  33.98 
 
 		 253 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0478  ABC-2 type transporter  37.31 
 
 		 253 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.704988  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5529  ABC-2 type transporter  44.5 
 
 		 251 aa  155  8e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.188866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0756  ABC-2 type transporter  42.66 
 
 		 251 aa  154  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.97763  normal  0.423446 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1020  ABC-2 type transporter  41.27 
 
 		 251 aa  154  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.269933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2942  hypothetical protein  42.2 
 
 		 251 aa  155  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.236721  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0861  ABC-2 type transporter  35.27 
 
 		 255 aa  154  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0630993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0723  ABC-2 type transporter  42.66 
 
 		 251 aa  154  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1607  ABC-2 type transporter  32.31 
 
 		 253 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0979931  normal  0.144248 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2722  ABC transporter membrane spanning protein  33.85 
 
 		 253 aa  152  5.9999999999999996e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0898  ABC-2 type transporter  40.57 
 
 		 253 aa  152  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1926  ABC-2 type transporter  36.02 
 
 		 255 aa  151  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.14437 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0639  ABC-2 type transporter  35.77 
 
 		 253 aa  150  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2524  ABC-2 type transporter  35.77 
 
 		 253 aa  149  4e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.438838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1714  ABC-2 type transporter  35.91 
 
 		 253 aa  149  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42149  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3121  ABC-2 type transporter  36.08 
 
 		 256 aa  148  9e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2924  putative ABC transporter inner membrane subunit  32.05 
 
 		 253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6044  ABC-2 type transporter  34.48 
 
 		 253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0380391  normal  0.233876 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3995  ABC-2 type transporter  34.9 
 
 		 256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2276  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.48 
 
 		 253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0123592  normal  0.410533 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0977  ABC transporter permease protein  36.84 
 
 		 255 aa  146  3e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.024266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0461  hypothetical protein  35.69 
 
 		 257 aa  147  3e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0612935  normal  0.787561 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0574  ABC-2 type transporter permease protein  34.84 
 
 		 257 aa  146  4.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2408  ABC-2 type transporter  37.84 
 
 		 253 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3854  ABC transporter, permease protein  33.85 
 
 		 262 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.605289  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0189  ABC transporter permease protein  34.38 
 
 		 256 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0197  ABC transporter permease  34.38 
 
 		 256 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.737997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0192  ABC transporter permease  34.38 
 
 		 256 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.333926 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0205  ABC transporter, permease protein  34.38 
 
 		 256 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4686  ABC-2 type transporter  34.48 
 
 		 253 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.731572  normal  0.106911 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0188  ABC transporter permease  34.38 
 
 		 256 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.137921  normal  0.864827 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1631  hypothetical protein  33.46 
 
 		 262 aa  145  5e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000356157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0607  ABC-2 type transporter  34.12 
 
 		 271 aa  145  6e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.837549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1221  ABC-2 type transporter  34.36 
 
 		 253 aa  145  6e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.389129  decreased coverage  0.00710452 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0121  ABC transporter, permease protein  35.16 
 
 		 256 aa  145  6e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1332  ABC-2 type transporter  35.14 
 
 		 253 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.993972  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0427  ABC transporter, inner membrane subunit  35.69 
 
 		 257 aa  145  7.0000000000000006e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2013  ABC-2 type transporter  33.98 
 
 		 253 aa  145  7.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1016  ABC transporter permease  36.44 
 
 		 256 aa  145  8.000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.875005  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1025  ABC-2 type transporter  34.51 
 
 		 256 aa  145  8.000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0880893  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3474  ABC-2 type transporter  34.77 
 
 		 256 aa  145  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0136  ABC transporter, permease protein  34.77 
 
 		 256 aa  145  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>