More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_3036 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_2645  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 268 aa  528  1e-149  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3036  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 268 aa  528  1e-149  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0348  ABC-2 type transporter  58.8 
 
 		 281 aa  300  1e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431352  normal  0.251356 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0339  ABC-2 type transporter  58.8 
 
 		 281 aa  300  1e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3519  ABC efflux pump, inner membrane subunit  61.79 
 
 		 251 aa  299  3e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24829  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0400  ABC-2 type transporter  61.79 
 
 		 273 aa  298  5e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.732955 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2686  ABC-2 type transporter  61.79 
 
 		 273 aa  298  5e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.859674  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0421  ABC-2 type transporter  61.79 
 
 		 273 aa  298  5e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.77682  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3670  ABC-2 type transporter, permease protein  61.79 
 
 		 251 aa  297  1e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.549508  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2718  ABC transporter, permease protein  61.79 
 
 		 251 aa  297  1e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2769  ABC-2 type transporter, permease protein  61.79 
 
 		 251 aa  297  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3697  ABC transporter, permease protein  61.79 
 
 		 251 aa  297  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3728  ABC-2 type transporter, permease protein  61.79 
 
 		 251 aa  297  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3235  ABC-2 type transporter, permease protein  61.79 
 
 		 251 aa  297  1e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.460161  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1784  ABC transporter, permease protein  61.79 
 
 		 251 aa  297  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0324  ABC-2 type transporter  60.98 
 
 		 273 aa  295  4e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0584539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2997  ABC transporter, permease protein  61.38 
 
 		 251 aa  295  4e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0394  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  60.16 
 
 		 254 aa  293  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3564  ABC-2 type transporter  60.16 
 
 		 251 aa  293  3e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.460574  hitchhiker  0.0000462468 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0243  hypothetical protein  57.49 
 
 		 259 aa  291  8e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.113541 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3233  ABC-2 type transporter  60.98 
 
 		 262 aa  290  2e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1583  ABC-2 type transporter  60.98 
 
 		 256 aa  290  2e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0567734 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2763  ABC-2 type transporter  59.76 
 
 		 251 aa  289  3e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2886  ABC-2 type transporter  60.57 
 
 		 262 aa  289  4e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0831309 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0827  putative transmembrane protein  61.38 
 
 		 251 aa  287  1e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.366259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2743  hypothetical protein  57.72 
 
 		 251 aa  286  2e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0895  ABC-2 type transporter  55.88 
 
 		 271 aa  285  4e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.239157  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0800  hypothetical protein  58.13 
 
 		 251 aa  284  9e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.200073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0103  ABC-2 type transporter  56.5 
 
 		 262 aa  280  2e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.759758  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2955  hypothetical protein  59.35 
 
 		 262 aa  276  2e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.279885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0692  ABC-2 type transporter  56.91 
 
 		 251 aa  276  4e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.815374  normal  0.797242 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3115  hypothetical protein  61.79 
 
 		 273 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.661432  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3252  multidrug ABC transporter permease component  63.55 
 
 		 273 aa  270  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0985  hypothetical protein  50.2 
 
 		 255 aa  265  4e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5529  ABC-2 type transporter  59.59 
 
 		 251 aa  263  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.188866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4455  ABC-2 type transporter  59.76 
 
 		 251 aa  262  4.999999999999999e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0350682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0723  ABC-2 type transporter  59.92 
 
 		 251 aa  257  1e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0756  ABC-2 type transporter  59.11 
 
 		 251 aa  256  2e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.97763  normal  0.423446 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2942  hypothetical protein  59.18 
 
 		 251 aa  256  2e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.236721  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1020  ABC-2 type transporter  59.35 
 
 		 251 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.269933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3395  hypothetical protein  54.29 
 
 		 250 aa  249  2e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1161  ABC-2 type transporter  58.61 
 
 		 254 aa  250  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.843909  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1893  ABC-2 type transport system permease protein  56.33 
 
 		 251 aa  231  9e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2615  ABC-2 type transporter  46.12 
 
 		 267 aa  214  9.999999999999999e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.747872  hitchhiker  0.00151672 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0663  ABC-2 type transporter  47.41 
 
 		 274 aa  204  1e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0486  ABC-2 type transporter  43.08 
 
 		 270 aa  202  4e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.197916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0640  ABC-2 transporter component  42.37 
 
 		 270 aa  201  9e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0401  ABC-2 type transporter  44.24 
 
 		 302 aa  195  7e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.973292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0097  ABC type transport system, integral membrane protein  43.95 
 
 		 264 aa  192  5e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2042  ABC-2 type transporter  46.34 
 
 		 273 aa  187  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0166481 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1229  ABC-2 type transporter  47.39 
 
 		 273 aa  186  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal  0.0330448 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1912  ABC-2 type transporter  38.65 
 
 		 253 aa  185  9e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.846791  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0427  ABC transporter, inner membrane subunit  39.06 
 
 		 257 aa  183  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0836  ABC transporter, inner membrane subunit  45.71 
 
 		 253 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0461  hypothetical protein  39.06 
 
 		 257 aa  183  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0612935  normal  0.787561 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0478  ABC-2 type transporter  43.39 
 
 		 253 aa  183  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.704988  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3260  ABC-2 type transporter  41.06 
 
 		 253 aa  182  6e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0633139  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0849  ABC-type multidrug transport system, permease component  40.24 
 
 		 254 aa  182  6e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.227676  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5173  ABC-2 type transporter  41.06 
 
 		 253 aa  182  6e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.108513 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5108  ABC-2 type transporter  41.06 
 
 		 253 aa  182  6e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1714  ABC-2 type transporter  42.74 
 
 		 253 aa  181  8.000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42149  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3121  ABC-2 type transporter  42.34 
 
 		 256 aa  180  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1332  ABC-2 type transporter  41.08 
 
 		 253 aa  180  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.993972  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1497  hypothetical protein  40.08 
 
 		 255 aa  181  2e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.212759 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0882  ABC-2 type transporter  45.31 
 
 		 253 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3995  ABC-2 type transporter  42.62 
 
 		 256 aa  179  4e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0607  ABC-2 type transporter  38.46 
 
 		 271 aa  179  4.999999999999999e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.837549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0886  ABC-2 type transporter  45.31 
 
 		 253 aa  178  7e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.301364  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2479  hypothetical protein  40.7 
 
 		 292 aa  178  7e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0540  ABC transporter, inner membrane subunit  40.65 
 
 		 253 aa  178  9e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3284  hypothetical protein  39.83 
 
 		 255 aa  178  9e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0995545  normal  0.811608 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00127  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  41.98 
 
 		 256 aa  177  1e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3474  ABC-2 type transporter  41.98 
 
 		 256 aa  177  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0379  ABC-2 type transporter  39.83 
 
 		 259 aa  177  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.8814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2362  ABC transporter, inner membrane subunit  37.7 
 
 		 253 aa  177  1e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0916375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0136  ABC transporter, permease protein  41.98 
 
 		 256 aa  177  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0132  ABC transporter, permease protein  41.98 
 
 		 256 aa  177  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2741  hypothetical protein  37.7 
 
 		 253 aa  178  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.919871  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3534  ABC-2 type transporter  39 
 
 		 256 aa  178  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3531  ABC-2 type transporter  41.98 
 
 		 256 aa  177  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00126  hypothetical protein  41.98 
 
 		 256 aa  177  1e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0138  ABC transporter, permease protein  41.98 
 
 		 256 aa  177  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0130  ABC transporter, permease protein  41.98 
 
 		 256 aa  177  1e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0411  ABC-2 type transporter  39.83 
 
 		 259 aa  177  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.164581 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0639  ABC-2 type transporter  38.89 
 
 		 253 aa  177  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6044  ABC-2 type transporter  40.98 
 
 		 253 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0380391  normal  0.233876 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1453  ABC-2 type transporter  37.3 
 
 		 253 aa  177  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02790  permease  40.24 
 
 		 263 aa  177  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0447  ABC-2 type transporter  39.83 
 
 		 259 aa  177  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4521  ABC-2 type transporter  40.08 
 
 		 256 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5044  ABC-2 type transporter  40.08 
 
 		 256 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.917306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0121  ABC transporter, permease protein  41.98 
 
 		 256 aa  176  3e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0977  ABC transporter permease protein  39.67 
 
 		 255 aa  176  3e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.024266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4686  ABC-2 type transporter  40.08 
 
 		 253 aa  176  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.731572  normal  0.106911 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2276  ABC efflux pump, inner membrane subunit  40.98 
 
 		 253 aa  176  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0123592  normal  0.410533 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3138  ABC-2 type transporter  39.58 
 
 		 253 aa  176  4e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00549881  normal  0.763555 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0205  ABC transporter, permease protein  41.15 
 
 		 256 aa  176  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0188  ABC transporter permease  41.15 
 
 		 256 aa  176  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.137921  normal  0.864827 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0197  ABC transporter permease  41.15 
 
 		 256 aa  176  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.737997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0189  ABC transporter permease protein  41.15 
 
 		 256 aa  176  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>