More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0895 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0895  ABC-2 type transporter  100 
 
 
271 aa  539  9.999999999999999e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.239157  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1583  ABC-2 type transporter  70 
 
 
256 aa  354  1e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0567734 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2955  hypothetical protein  69.2 
 
 
262 aa  353  2e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.279885  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2763  ABC-2 type transporter  71.2 
 
 
251 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0827  putative transmembrane protein  68.92 
 
 
251 aa  351  8e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.366259  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2886  ABC-2 type transporter  68.08 
 
 
262 aa  350  1e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0831309 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3233  ABC-2 type transporter  70.56 
 
 
262 aa  350  1e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0324  ABC-2 type transporter  67.29 
 
 
273 aa  350  2e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0584539  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3115  hypothetical protein  73.08 
 
 
273 aa  349  2e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.661432  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2743  hypothetical protein  68.8 
 
 
251 aa  347  1e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2686  ABC-2 type transporter  65.44 
 
 
273 aa  347  1e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.859674  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0400  ABC-2 type transporter  65.44 
 
 
273 aa  347  1e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.732955 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0421  ABC-2 type transporter  65.44 
 
 
273 aa  347  1e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.77682  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0348  ABC-2 type transporter  66.29 
 
 
281 aa  346  2e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431352  normal  0.251356 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0339  ABC-2 type transporter  66.29 
 
 
281 aa  346  2e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0243  hypothetical protein  67.72 
 
 
259 aa  345  6e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.113541 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3252  multidrug ABC transporter permease component  72.31 
 
 
273 aa  342  4e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3519  ABC efflux pump, inner membrane subunit  68 
 
 
251 aa  342  5e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24829  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2997  ABC transporter, permease protein  68.8 
 
 
251 aa  342  5e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0692  ABC-2 type transporter  67.2 
 
 
251 aa  342  5e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.815374  normal  0.797242 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0103  ABC-2 type transporter  67.47 
 
 
262 aa  340  1e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.759758  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3564  ABC-2 type transporter  68.4 
 
 
251 aa  340  1e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.460574  hitchhiker  0.0000462468 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2718  ABC transporter, permease protein  68.8 
 
 
251 aa  340  2e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3728  ABC-2 type transporter, permease protein  68.8 
 
 
251 aa  340  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3235  ABC-2 type transporter, permease protein  68.8 
 
 
251 aa  340  2e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.460161  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3697  ABC transporter, permease protein  68.8 
 
 
251 aa  340  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3670  ABC-2 type transporter, permease protein  68.8 
 
 
251 aa  340  2e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.549508  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1784  ABC transporter, permease protein  68.8 
 
 
251 aa  340  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2769  ABC-2 type transporter, permease protein  68.8 
 
 
251 aa  340  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0394  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  67.86 
 
 
254 aa  338  7e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0800  hypothetical protein  66.8 
 
 
251 aa  337  8e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.200073  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3395  hypothetical protein  70.56 
 
 
250 aa  335  5.999999999999999e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5529  ABC-2 type transporter  67.2 
 
 
251 aa  323  2e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.188866  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1161  ABC-2 type transporter  66.93 
 
 
254 aa  322  4e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.843909  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0723  ABC-2 type transporter  68.53 
 
 
251 aa  322  5e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4455  ABC-2 type transporter  68 
 
 
251 aa  320  9.999999999999999e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0350682  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0756  ABC-2 type transporter  68.13 
 
 
251 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.97763  normal  0.423446 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1020  ABC-2 type transporter  66.14 
 
 
251 aa  315  5e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.269933  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2942  hypothetical protein  64.94 
 
 
251 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.236721  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1893  ABC-2 type transport system permease protein  68.4 
 
 
251 aa  295  5e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2645  ABC-2 type transporter  55.88 
 
 
268 aa  291  1e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3036  ABC-2 type transporter  55.88 
 
 
268 aa  291  1e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0985  hypothetical protein  57.09 
 
 
255 aa  288  8e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2615  ABC-2 type transporter  49 
 
 
267 aa  219  3e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.747872  hitchhiker  0.00151672 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0663  ABC-2 type transporter  48.41 
 
 
274 aa  211  9e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0640  ABC-2 transporter component  45.78 
 
 
270 aa  206  3e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0097  ABC type transport system, integral membrane protein  44.35 
 
 
264 aa  202  7e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1229  ABC-2 type transporter  46.48 
 
 
273 aa  194  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal  0.0330448 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0486  ABC-2 type transporter  44.18 
 
 
270 aa  193  3e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.197916  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0401  ABC-2 type transporter  45.82 
 
 
302 aa  188  7e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.973292  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2479  hypothetical protein  45.04 
 
 
292 aa  188  8e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2042  ABC-2 type transporter  43.15 
 
 
273 aa  187  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0166481 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4581  ABC-2 type transporter  43.45 
 
 
277 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.380224  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0836  ABC transporter, inner membrane subunit  39.76 
 
 
253 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1095  hypothetical protein  42.75 
 
 
290 aa  172  5e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0882  ABC-2 type transporter  40.16 
 
 
253 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2121  ABC transporter, permease protein  38.46 
 
 
254 aa  170  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0886  ABC-2 type transporter  39.36 
 
 
253 aa  169  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.301364  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02790  permease  38.62 
 
 
263 aa  168  1e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5370  ABC-2 type transporter  37.23 
 
 
273 aa  167  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1098  ABC-2 type transporter  37.5 
 
 
257 aa  168  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2722  ABC transporter membrane spanning protein  35.68 
 
 
253 aa  166  4e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0898  ABC-2 type transporter  42.4 
 
 
253 aa  166  4e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002558  ABC-type multidrug transport system permease component  35.6 
 
 
256 aa  165  5.9999999999999996e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.644442  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0616  ABC-2 type transporter  36.07 
 
 
255 aa  165  6.9999999999999995e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.33089 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1860  ABC-2 type transporter  37.6 
 
 
257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3260  ABC-2 type transporter  35.34 
 
 
253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0633139  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5173  ABC-2 type transporter  35.34 
 
 
253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.108513 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5108  ABC-2 type transporter  35.34 
 
 
253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3881  ABC-2 type transporter  38.21 
 
 
263 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.574088  normal  0.697417 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0704  ABC-2 type transporter  34.82 
 
 
259 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0516518 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0849  ABC-type multidrug transport system, permease component  37.5 
 
 
254 aa  163  3e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.227676  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3816  ABC-2 type transporter  38.8 
 
 
258 aa  163  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.791577 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1005  ABC transporter, permease protein  37.1 
 
 
254 aa  162  5.0000000000000005e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03360  ABC-2 type transport system permease component  35.86 
 
 
253 aa  162  5.0000000000000005e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.163605  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0607  ABC-2 type transporter  35.06 
 
 
271 aa  162  5.0000000000000005e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.837549  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0831  ABC-2 type transporter  37.35 
 
 
256 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0461  hypothetical protein  37.1 
 
 
257 aa  161  1e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0612935  normal  0.787561 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0121  putative permease  36.4 
 
 
256 aa  161  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0540  ABC transporter, inner membrane subunit  35.06 
 
 
253 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1926  ABC-2 type transporter  35.77 
 
 
255 aa  160  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.14437 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2018  hypothetical protein  36.63 
 
 
253 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.803499  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3371  hypothetical protein  36.21 
 
 
253 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3143  ABC-2 type transporter  37.35 
 
 
256 aa  160  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0574  ABC-2 type transporter permease protein  37.98 
 
 
257 aa  160  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0795  ABC-2 type transporter  37.35 
 
 
256 aa  160  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0824  ABC-2 type transporter  36.95 
 
 
256 aa  160  3e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6044  ABC-2 type transporter  33.88 
 
 
253 aa  160  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0380391  normal  0.233876 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2276  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.88 
 
 
253 aa  159  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0123592  normal  0.410533 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0652  hypothetical protein  36.51 
 
 
256 aa  159  6e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3801  ABC transporter, permease protein  36.95 
 
 
256 aa  158  9e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0427  ABC transporter, inner membrane subunit  36.69 
 
 
257 aa  158  9e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3519  ABC-2 type transporter  36.95 
 
 
256 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.238751  normal  0.0167423 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4686  ABC-2 type transporter  34.26 
 
 
253 aa  158  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.731572  normal  0.106911 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1497  hypothetical protein  35.18 
 
 
255 aa  158  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.212759 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3711  ABC-2 type transporter  36.95 
 
 
256 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3231  ABC-2 type transporter  36.95 
 
 
256 aa  157  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1078  ABC-2 type transporter  38.4 
 
 
260 aa  158  1e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0723  ABC-2 type transporter  36.95 
 
 
256 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3588  ABC-2 type transporter  36.95 
 
 
256 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0782802  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>